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Caracterização de populações naturais de Rhizophora spp. (Rhizophoraceae) de manguezais do litoral brasileiro e análise de zona de hibridação utilizando marcadores microssatélites = Characterization of natural populations of Rhizophora spp. (Rhizophoraceae) from mangroves forests along the Brazilian coast and analysis of a hybridization zone using microsatellite markers / Characterization of natural populations of Rhizophora spp. (Rhizophoraceae) from mangroves forests along the Brazilian coast and analysis of a hybridization zone using microsatellite markers

Francisco, Patrícia Mara, 1984- 27 August 2018 (has links)
Orientador: Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T05:05:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco_PatriciaMara_D.pdf: 7911618 bytes, checksum: f90010b3ff20ba6416b899bcfb99b443 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Manguezais são ecossistemas com uma variedade incomum de animais e plantas adaptados às condições de alta salinidade, inundações frequentes e solo lodoso e anaeróbico. Ocorrem em locais onde há o encontro de águas de rios com a do mar. Diversos fatores bióticos e abióticos influenciam os padrões de diversidade de espécies de manguezais, como oceanografia, clima, topografia e condições do solo. A diversidade de plantas de mangue é muito reduzida, quando comparada com outros ecossistemas tropicais. O Brasil possui uma das maiores areas de manguezal do mundo e apresenta três gêneros de angiospermas de mangue. Um deles é Rhizophora, composto pelas espécies Rhizophora mangle, Rhizophora racemosa e, um possível híbrido, Rhizophora harrisonii. O objetivo da presente tese foi isolar e caracterizar locos microssatélites para essas espécies e estimar parâmetros populacionais como fluxo gênico, estruturação populacional, diversidade gênica e tamanho efetivo de população, além de estudar outros aspectos da biologia de Rhizophora, como uma possível zona de hibridação na região norte do país, taxa de cruzamento e o sistema reprodutivo. Com este propósito, foram coletados 318 indivíduos de R. mangle de 11 localidades ao longo da costa brasileira, e 33 indivíduos de R. racemosa e 37 indivíduos de R. harrisonii ambas coletadas de duas localidades no litoral brasileiro. Para identificar e caracterizar locos de microssatélites foram desenvolvidas bibliotecas enriquecidas em microssatélites para as três espécies. Utilizando os marcadores desenvolvidos na presente tese, bem como outros que já publicados, observou-se uma diferença significativa entre as populações no padrão de variação genética. A riqueza de alelos, heterozigosidades esperada e observada foram maiores na região norte. Os resultados sugerem que as espécies de Rhizophora não compõe apenas uma população panmítica ao longo do litoral brasileiro, devido à diferenciação existente entre as regiões norte e sul da costa. A análise do sistema reprodutivo de R. mangle de uma população do estado do Pará, encontramos valores que indicariam um sistema de reprodução misto. Em relação à hibridação contínua, não foram encontradas evidências de hibridação introgressiva entre as espécies de Rhizophora. Concluímos que com os resultados obtidos na presente tese foi possível contribuir para o maior conhecimento genético das espécies de Rhizophora spp. do litoral brasileiro / Abstract: Mangrove are ecosystems with an unusual variety of animals and plants adapted to conditions of high salinity and frequent floods and muddy anaerobic soil. Several abiotic factors influence the patterns of mangrove species diversity, such as oceanography, climate, topographic and soil conditions. The number of mangrove plant species is much reduced compared with other tropical ecosystems. Brazil has the second largest mangrove area in the world and has three genera of mangrove angiosperms. One genera is Rhizophora, composed of Rhizophora mangle, Rhizophora racemosa and a possible hybrid, Rhizophora harrisonii. The aim of this thesis was to isolate and characterize microsatellite loci for these species and estimate population parameters such as gene flow, population structure, genetic diversity and effective population size, and study other aspects of Rhizophora biology, as a possible hybrid zone in the north region of the Brazilian coast, crossing rate and the reproductive system. For this purpose, 318 individuals of R. mangle of 11 locations along the Brazilian coast, 33 individuals of R. racemosa and 37 individuals of R. harrisonii from two locations were collected. To identify and characterize the microsatellite loci, enriched microsatellite libraries for the three species were developed. Using the developed markers, and some others already published, we observed a significant difference between the populations in the pattern of genetic variation. Alleles richness, expected and observed heterozygosity were higher in the north. The results suggest that the species of R. mangle is not only composed of a single panmitic population due to differentiation found among the population from locales north and south of the Brazilian Coast. The reproductive system was evaluated studing a population of R. mangle from the state of Pará and we find values that would indicate a mixed mating system. Regarding the ongoing hybridization, we found no evidence of introgressive hybridization among the species leading to a hybrid species. We concluded that with this results it was possible to contribute to further genetic knowledge of Rhizophora spp. from the Brazilian coast / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutora em Genética e Biologia Molecular
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Factors Influencing the Distribution and Abundance of Sphaeroma terebrans in Florida’s Red Mangroves

Unknown Date (has links)
In Palm Beach County, S. terebrans burrows into grounded roots and trunks of R. mangle causing collapse. This is contrary to previous studies suggesting this species burrows only into free-hanging roots. Nutrients and C. virginica cover may affect S. terebrans abundance and distribution. Surveys show burrowing significantly varies among sites, but not between free-hanging and grounded roots. Nutrients vary by site, but neither N nor P was correlated with burrowing. Nutrient treated roots showed no colonization pattern associated with N or P. Lignin varied among sites, but didn’t affect burrowing. Finally, C. virginica limited colonization in the portion of R. mangle tissue it covered. The location of C. virginica on the seaward/landward side was not predictive of burrowing. R. mangle height and leaves were not negatively affected by cover treatment or burrowing. Results highlight the need for additional research to determine the influence of environmental factors on this species interaction. / Includes bibliography. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2018. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection
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Relações ecológicas entre Melampus coffeus (Gastropoda: Pulmonata) e a serapilheira no médio estuário do rio Pacoti, Ceará / Ecological relations between Melampus coffeus (Gastropoda: Pulmonata) and the leaflitter in the middle estuary of Pacoti river, Ceará

Tavares, Diva da Silva January 2011 (has links)
TAVARES, Diva da Silva. Relações ecológicas entre Melampus coffeus (Gastropoda: Pulmonata) e a serapilheira no médio estuário do rio Pacoti, Ceará. 2011. 88 f. Dissertação (Mestrado em ecologia e recursos naturais)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-05-19T19:48:46Z No. of bitstreams: 1 2011_dis_dstavares.pdf: 1642320 bytes, checksum: 75f41b4a06417de0770a60342bd4a459 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-05-27T20:12:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_dis_dstavares.pdf: 1642320 bytes, checksum: 75f41b4a06417de0770a60342bd4a459 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-27T20:12:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_dis_dstavares.pdf: 1642320 bytes, checksum: 75f41b4a06417de0770a60342bd4a459 (MD5) Previous issue date: 2011 / The litter is essential for the nutrients and organic matter cycles in forests ecosystems. These vegetal detritus are a food source to many groups of animals that act directly on the litter decomposition. Litter also seems to provide microhabitats and works as a shelter for many individuals of the mangrove fauna. The gastropod Melampus coffeus (Linnaeus, 1758) (Ellobiidae) is a common snail in mangroves from the Atlantic and feed on mangrove leaves. These animals must be important components in detritus based food webs and may accelerate the detritus decompositions processes and also facilitate the mangrove litter consume by other organisms. It was hypothesized that these gastropods use mangrove litter as a food source, thus accelerating its decomposition, and as a refuge. So its spatial distribution may be directly affected by litter biomass accumulation. Therefore this research aimed to evaluate the M. coffeus spatial distribution related to biomasses of different mangrove litter fractions biomasses besides evaluate the feeding behavior of this specie when submitted to a diet based on different mangrove tissues. To test such hypothesis samples of M. coffeus and litter were procedure monthly through a year in a fringe mangrove forest in the middle estuary of Pacoti river, Ceará, northeast of Brazil. The population density and shell length of M. coffeus were recorded and compared to the biomasses of different Rhizophora mangle structures that were sampled during this research. In addition of it laboratory and field experiments were carried out to test, respectively, the feeding preference of M. coffeus to different R. mangle tissues (leaves, twigs and flowers) and to evaluate the importance of these snails on R. mangle leaves decomposition in the study area. The results indicated that the presence of twigs in the mangrove litter may favor the occupation by smaller individuals of these snails, probably because these structures may provide a shelter against predators attack and dissection. However M. coffeus seemed to avoid such vegetal tissues as source of food and prefers some more palatable tissues like leaves and flowers. Field experiment confirmed that these gastropods feed on leaves of R. mangle, especially when these tissues get into advanced decomposition stages. So, because of the abundance in mangrove areas and because its ecological relations with mangrove litter, M. coffeus might be an important tool to environmental conservation researches, as its presence may be influenced by the mangrove litter production and, for consequence, by mangrove forest structure. Moreover, M. coffeus spatial distribution is potentially capable to affect the distribution of others organisms that are probably elements of the mangrove detritus food web. / A serapilheira é essencial para a ciclagem de nutrientes e matéria orgânica em ecossistemas florestais. Esses detritos vegetais são fonte de alimento para diversos grupos de animais (os quais contribuem diretamente para a sua decomposição) e parecem favorecer a formação de microhabitats. Dessa forma, a presença desse material sobre o solo pode servir como refúgio para diversos organismos nos manguezais. O gastrópode Melampus coffeus (Linnaeus 1758) (Ellobiidae) é uma espécie comum em manguezais do Atlântico e se alimenta de folhas de mangue. Esses moluscos podem ser importantes componentes nas teias alimentares com base em detritos por, possivelmente, serem capazes de acelerar os processos de decomposição de tecidos vegetais senescentes de mangue e facilitarem seu consumo por outros organismos. Foi assumida a hipótese de que M. coffeus utiliza a serapilheira como fonte de alimento, e assim acelera sua decomposição, e como refúgio, de modo que sua distribuição espacial é afetada diretamente pela biomassa desses detritos vegetais. O objetivo geral do trabalho foi avaliar a distribuição espacial de M. coffeus em relação à biomassa de diferentes frações de serapilheira, além de avaliar o comportamento alimentar desses animais diante dessas estruturas vegetais. Para isso, foram realizadas coletas mensais, de janeiro a dezembro de 2010, de M. coffeus e de serapilheira em um bosque de franja dominado por R. mangle, localizado no médio estuário do rio Pacoti, Ceará. A distribuição espacial dos animais, quanto à densidade populacional e à altura da concha, foi avaliada em relação à biomassa de diferentes estruturas de R. mangle amostradas na serapilheira. Além disso, foram realizados experimentos em laboratório, para avaliar a preferência alimentar desses gastrópodes em relação a galhos, flores e folhas de R. mangle, e em campo, para verificar a importância desses invertebrados na decomposição das folhas de mangue presentes sobre o solo do bosque estudado. Os resultados indicaram que a presença de galhos na serapilheira favorece a ocupação por indivíduos de M. coffeus de menor tamanho, possivelmente por fornecer abrigo contra predadores e contra a dessecação, já que indivíduos menores tendem a ser mais suscetíveis a esses fatores. Contudo, esses animais parecem evitar tais estruturas como fonte de alimento e dão preferência a estruturas provavelmente mais palatáveis, como folhas e flores. Os resultados encontrados no experimento de campo indicaram que esses moluscos consomem tecidos foliares, sobretudo quando esses tecidos chegam a estágios mais avançados de decomposição. Assim, em virtude de sua abundância em áreas de mangue e de suas relações ecológicas com a serapilheira, essa espécie pode ser uma ferramenta de grande importância nos estudos de conservação, já que sua presença pode ser influenciada pela produção de serapilheira e, conseqüentemente pela estrutura do mangue, além de sua distribuição espacial ser potencialmente capaz de afetar outros grupos de organismos que possivelmente se relacionam na teia alimentar dos manguezais.
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Nitrogen and carbon mineralization and dynamics of Fe depending on the type of vegetation and shrimp aquaculture effluent in mangrove soils / MineralizaÃÃo do nitrogÃnio e carbono e dinÃmica do Fe em funÃÃo do tipo de vegetaÃÃo e do efluente de carcinicultura em solos de manguezais

Tassia Raquel GarcÃs Passos 16 June 2015 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / A mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio pode ser afetada por diversos fatores. Com esse estudo objetivou - se avaliar a influÃncia das vegetaÃÃes (Rhizophora e Avicennia) no potencial de mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio do solo; comparar a mineralizaÃÃo do nitrogÃnio e carbono do solo entre as Ãreas impactadas e nÃo impactada com efluente de carcinicultura e verificar o efeito da variaÃÃo da marà na mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio do solo. As amostras de solo foram coletadas em duas Ãreas (Ãrea impactada e nÃo impactada com efluente de carcinicultura) e com predomÃnio de duas vegetaÃÃes (Rhizophora e Avicennia). Em seguida, essas amostras foram incubadas em laboratÃrio por 30 dias para avaliar o potencial de mineralizaÃÃo do carbono e do nitrogÃnio em resposta ao hidroperÃodo (inundado 18h e 6h seco), ao tipo de vegetaÃÃo e ao impacto do solo por efluente de carcinicultura. Verificou - se que no solo da Ãrea impactada menor formaÃÃo da pirita no solo. NÃo houve diferenÃa significativa para os teores de COT, N-total, N-NH4+e N-NO3-para as Ãreas e para as vegetaÃÃes, entretanto foi observada a relaÃÃo positiva entre os teores de COT e de N-total do solo. Foi verificado correlaÃÃo positiva entre os teores de COT e o carbono mineralizado indicando que os procedimentos de inundaÃÃo e sem inundaÃÃo (18 e 6 horas, respectivamente) foram eficientes para promover a mineralizaÃÃo do carbono do solo. / A mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio pode ser afetada por diversos fatores. Com esse estudo objetivou-se avaliar a influÃncia das vegetaÃÃes (Rhizophora e Avicennia) no potencial de mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio do solo; comparar a mineralizaÃÃo do nitrogÃnio e carbono do solo entre as Ãreas impactadas e nÃo impactada com efluente de carcinicultura e verificar o efeito da variaÃÃo da marà na mineralizaÃÃo do carbono e nitrogÃnio do solo. As amostras de solo foram coletadas em duas Ãreas (Ãrea impactada e nÃo impactada com efluente de carcinicultura) e com predomÃnio de duas vegetaÃÃes (Rhizophora e Avicennia). Em seguida, essas amostras foram incubadas em laboratÃrio por 30 dias para avaliar o potencial de mineralizaÃÃo do carbono e do nitrogÃnio em resposta ao hidroperÃodo (inundado 18h e 6h seco), ao tipo de vegetaÃÃo e ao impacto do solo por efluente de carcinicultura. Verificou-se que no solo da Ãrea impactada menor formaÃÃo da pirita no solo. NÃo houve diferenÃa significativa para os teores de COT, N-total, N-NH4+ e N-NO3- para as Ãreas e para as vegetaÃÃes, entretanto foi observada a relaÃÃo positiva entre os teores de COT e de N-total do solo. Foi verificado correlaÃÃo positiva entre os teores de COT e o carbono mineralizado indicando que os procedimentos de inundaÃÃo e sem inundaÃÃo (18 e 6 horas, respectivamente) foram eficientes para promover a mineralizaÃÃo do carbono do solo
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Phylogenetic relationships and natural hybridization in the mangrove genus rhizophora from the Indo-West Pacific Region

羅毓瑩, Lo, Yuk-ying, Eugenia. January 2003 (has links)
published_or_final_version / Zoology / Master / Master of Philosophy
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Adaptação de Ensaio Cometa às células meristemáticas provenientes de raízes de propágulos de Rhizophora mangle para avaliar a genotoxicidade no ambiente marinho / Adaptation of comet assay to meristematic cells of mangrove root to study genotoxicity on the marine environment

Garcia, Juliana Maia Rabêlo Nucci 07 October 2016 (has links)
O presente estudo teve como objetivo o estabelecimento de um método citogenotoxico, o ensaio cometa, adaptado às células meristemáticas provenientes de raízes de propágulos de mangue da espécie Rhizophora mangle para utilização em estudos sobre genotoxicidade em ambientes marinhos. Foram testados dois tipos de germinação de raízes, quatro diferentes soluções de extração de núcleos, duas soluções de lise e o não uso da lise, dois períodos de exposição à lise, dois períodos de relaxamento, dois períodos de eletroforese e a interação de duas condições de lise com dois diferentes tempos de relaxamento. A validação de método foi realizada através da exposição de núcleos a quatro diferentes concentrações de peróxido de hidrogênio. Os resultados mostraram que é possível a obtenção de cometas com núcleos extraídos de propágulos de Rhizophora mangle e que a validação de método apresenta uma relação concentração dependente entre o índice de dano de núcleos e a concentração do agente genotoxico testado. Os melhores parâmetros utilizados para obtenção de cometas através do método por nós adaptado são: PBS ou solução salina 12‰ como solução de extração, exposição à lise alcalina iônica por 60 minutos, 5 minutos de relaxamento e eletroforese em tampão pH>13, 0,8V/cm, 230mA por 20 minutos a 4ºC. / This study aimed to establish a citogenotoxic method, the comet assay, adapted to the meristematic cells from propagule roots of red mangrove, Rhizophora mangle, for use in studies of genotoxicity in marine environments. Experiments were carried out to test two ways of root germination, four different nuclei extraction solutions, two lysis solutions and without lysis, two periods of exposure to lysis, two periods of unwinding, two periods of electrophoresis and the interaction of two lysis conditions with two different times of unwinding. Experiments on validation of the method were performed by exposing the nuclei to four different concentrations of hydrogen peroxide. The results showed that it is possible to obtain comets with nuclei extracted from the root of propagules of Rhizophora mangle and the validation data showed a dose-dependent relationship between the damage index and the concentration of the genotoxic agent tested. The best parameters to obtain comets using the method adapted by us are: PBS or saline 12‰ as extraction solution, exposure to alkaline lysis for 60 minutes, 5 minutes of unwinding and electrophoresis in buffer pH> 13, 0,8V/cm, 230mA for 20 min at 4ºC.
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RelaÃÃes ecolÃgicas entre Melampus coffeus (Gastropoda: Pulmonata) e a serapilheira no mÃdio estuÃrio do rio Pacoti, Cearà / Ecological relations between Melampus coffeus (Gastropoda: Pulmonata) and the leaflitter in the middle estuary of Pacoti river, CearÃ

Diva da Silva Tavares 29 April 2011 (has links)
A serapilheira à essencial para a ciclagem de nutrientes e matÃria orgÃnica em ecossistemas florestais. Esses detritos vegetais sÃo fonte de alimento para diversos grupos de animais (os quais contribuem diretamente para a sua decomposiÃÃo) e parecem favorecer a formaÃÃo de microhabitats. Dessa forma, a presenÃa desse material sobre o solo pode servir como refÃgio para diversos organismos nos manguezais. O gastrÃpode Melampus coffeus (Linnaeus 1758) (Ellobiidae) à uma espÃcie comum em manguezais do AtlÃntico e se alimenta de folhas de mangue. Esses moluscos podem ser importantes componentes nas teias alimentares com base em detritos por, possivelmente, serem capazes de acelerar os processos de decomposiÃÃo de tecidos vegetais senescentes de mangue e facilitarem seu consumo por outros organismos. Foi assumida a hipÃtese de que M. coffeus utiliza a serapilheira como fonte de alimento, e assim acelera sua decomposiÃÃo, e como refÃgio, de modo que sua distribuiÃÃo espacial à afetada diretamente pela biomassa desses detritos vegetais. O objetivo geral do trabalho foi avaliar a distribuiÃÃo espacial de M. coffeus em relaÃÃo à biomassa de diferentes fraÃÃes de serapilheira, alÃm de avaliar o comportamento alimentar desses animais diante dessas estruturas vegetais. Para isso, foram realizadas coletas mensais, de janeiro a dezembro de 2010, de M. coffeus e de serapilheira em um bosque de franja dominado por R. mangle, localizado no mÃdio estuÃrio do rio Pacoti, CearÃ. A distribuiÃÃo espacial dos animais, quanto à densidade populacional e à altura da concha, foi avaliada em relaÃÃo à biomassa de diferentes estruturas de R. mangle amostradas na serapilheira. AlÃm disso, foram realizados experimentos em laboratÃrio, para avaliar a preferÃncia alimentar desses gastrÃpodes em relaÃÃo a galhos, flores e folhas de R. mangle, e em campo, para verificar a importÃncia desses invertebrados na decomposiÃÃo das folhas de mangue presentes sobre o solo do bosque estudado. Os resultados indicaram que a presenÃa de galhos na serapilheira favorece a ocupaÃÃo por indivÃduos de M. coffeus de menor tamanho, possivelmente por fornecer abrigo contra predadores e contra a dessecaÃÃo, jà que indivÃduos menores tendem a ser mais suscetÃveis a esses fatores. Contudo, esses animais parecem evitar tais estruturas como fonte de alimento e dÃo preferÃncia a estruturas provavelmente mais palatÃveis, como folhas e flores. Os resultados encontrados no experimento de campo indicaram que esses moluscos consomem tecidos foliares, sobretudo quando esses tecidos chegam a estÃgios mais avanÃados de decomposiÃÃo. Assim, em virtude de sua abundÃncia em Ãreas de mangue e de suas relaÃÃes ecolÃgicas com a serapilheira, essa espÃcie pode ser uma ferramenta de grande importÃncia nos estudos de conservaÃÃo, jà que sua presenÃa pode ser influenciada pela produÃÃo de serapilheira e, conseqÃentemente pela estrutura do mangue, alÃm de sua distribuiÃÃo espacial ser potencialmente capaz de afetar outros grupos de organismos que possivelmente se relacionam na teia alimentar dos manguezais. / The litter is essential for the nutrients and organic matter cycles in forests ecosystems. These vegetal detritus are a food source to many groups of animals that act directly on the litter decomposition. Litter also seems to provide microhabitats and works as a shelter for many individuals of the mangrove fauna. The gastropod Melampus coffeus (Linnaeus, 1758) (Ellobiidae) is a common snail in mangroves from the Atlantic and feed on mangrove leaves. These animals must be important components in detritus based food webs and may accelerate the detritus decompositions processes and also facilitate the mangrove litter consume by other organisms. It was hypothesized that these gastropods use mangrove litter as a food source, thus accelerating its decomposition, and as a refuge. So its spatial distribution may be directly affected by litter biomass accumulation. Therefore this research aimed to evaluate the M. coffeus spatial distribution related to biomasses of different mangrove litter fractions biomasses besides evaluate the feeding behavior of this specie when submitted to a diet based on different mangrove tissues. To test such hypothesis samples of M. coffeus and litter were procedure monthly through a year in a fringe mangrove forest in the middle estuary of Pacoti river, CearÃ, northeast of Brazil. The population density and shell length of M. coffeus were recorded and compared to the biomasses of different Rhizophora mangle structures that were sampled during this research. In addition of it laboratory and field experiments were carried out to test, respectively, the feeding preference of M. coffeus to different R. mangle tissues (leaves, twigs and flowers) and to evaluate the importance of these snails on R. mangle leaves decomposition in the study area. The results indicated that the presence of twigs in the mangrove litter may favor the occupation by smaller individuals of these snails, probably because these structures may provide a shelter against predators attack and dissection. However M. coffeus seemed to avoid such vegetal tissues as source of food and prefers some more palatable tissues like leaves and flowers. Field experiment confirmed that these gastropods feed on leaves of R. mangle, especially when these tissues get into advanced decomposition stages. So, because of the abundance in mangrove areas and because its ecological relations with mangrove litter, M. coffeus might be an important tool to environmental conservation researches, as its presence may be influenced by the mangrove litter production and, for consequence, by mangrove forest structure. Moreover, M. coffeus spatial distribution is potentially capable to affect the distribution of others organisms that are probably elements of the mangrove detritus food web.
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Adaptação de Ensaio Cometa às células meristemáticas provenientes de raízes de propágulos de Rhizophora mangle para avaliar a genotoxicidade no ambiente marinho / Adaptation of comet assay to meristematic cells of mangrove root to study genotoxicity on the marine environment

Juliana Maia Rabêlo Nucci Garcia 07 October 2016 (has links)
O presente estudo teve como objetivo o estabelecimento de um método citogenotoxico, o ensaio cometa, adaptado às células meristemáticas provenientes de raízes de propágulos de mangue da espécie Rhizophora mangle para utilização em estudos sobre genotoxicidade em ambientes marinhos. Foram testados dois tipos de germinação de raízes, quatro diferentes soluções de extração de núcleos, duas soluções de lise e o não uso da lise, dois períodos de exposição à lise, dois períodos de relaxamento, dois períodos de eletroforese e a interação de duas condições de lise com dois diferentes tempos de relaxamento. A validação de método foi realizada através da exposição de núcleos a quatro diferentes concentrações de peróxido de hidrogênio. Os resultados mostraram que é possível a obtenção de cometas com núcleos extraídos de propágulos de Rhizophora mangle e que a validação de método apresenta uma relação concentração dependente entre o índice de dano de núcleos e a concentração do agente genotoxico testado. Os melhores parâmetros utilizados para obtenção de cometas através do método por nós adaptado são: PBS ou solução salina 12‰ como solução de extração, exposição à lise alcalina iônica por 60 minutos, 5 minutos de relaxamento e eletroforese em tampão pH>13, 0,8V/cm, 230mA por 20 minutos a 4ºC. / This study aimed to establish a citogenotoxic method, the comet assay, adapted to the meristematic cells from propagule roots of red mangrove, Rhizophora mangle, for use in studies of genotoxicity in marine environments. Experiments were carried out to test two ways of root germination, four different nuclei extraction solutions, two lysis solutions and without lysis, two periods of exposure to lysis, two periods of unwinding, two periods of electrophoresis and the interaction of two lysis conditions with two different times of unwinding. Experiments on validation of the method were performed by exposing the nuclei to four different concentrations of hydrogen peroxide. The results showed that it is possible to obtain comets with nuclei extracted from the root of propagules of Rhizophora mangle and the validation data showed a dose-dependent relationship between the damage index and the concentration of the genotoxic agent tested. The best parameters to obtain comets using the method adapted by us are: PBS or saline 12‰ as extraction solution, exposure to alkaline lysis for 60 minutes, 5 minutes of unwinding and electrophoresis in buffer pH> 13, 0,8V/cm, 230mA for 20 min at 4ºC.
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Avaliação da resposta anti-inflamatória intestinal de proantocianidinas de Rhizophora mangle L. no tratamento de colite experimental induzida por ácido tri-nitro-benzeno sulfônico (TNBS) em ratos e dextrana sal sódico (DSS) em camundongos / Evaluation of the intestinal anti-inflammatory response of proanthocyanidins of Rhizophora mangle in the treatment of experimental colitis induced by trinitro benzene sulfonic acid (TNBS) in rats and dextran sodium sulfate (DSS) in mice

Faria, Felipe Meira de, 1984- 22 August 2018 (has links)
Orientador: Alba Regina Monteiro Souza Brito / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-22T00:33:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Faria_FelipeMeirade_D.pdf: 5634635 bytes, checksum: 78374f3fbaac985834cc384c5652485c (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: As doenças inflamatórias intestinais (DII) compreendem doença de Crohn e reto-colite ulcerativa inespecífica, ambas caracterizadas por processo inflamatório crônico e descontrolado no intestino mediado por células do sistema imune. DII tem sido objeto de extensas pesquisas nos últimos anos; indefinição sobre etiologia e ausência de tratamento eficaz os justificam. Nesse cenário, produtos naturais surgem como alternativas terapêuticas, uma vez que moléculas com atividade farmacológica pronunciada, especialmente compostos fenólicos, têm merecido destaque. Neste trabalho foram avaliadas três frações orgânicas (aquosa - Aq, butanólica - BuOH, e acetato de EtOAc) obtidas a partir das cascas de Rhizophora mangle em modelos experimentais de colite induzida por dextrana sal sódico (DSS) em camundongos e ácido 2,4,6-tri-nitro-benzeno-sulfônico (TNBS) em ratos. BuOH (0.5 e 1.5 mg.Kg-1) e EtOAc (1.5 mg.Kg-1) foram efetivas no modelo de colite por DSS, enquanto BuOH 0.5 mg.K-1 e EtOAc 1.5 mg.Kg-1 mostraram-se eficazes na colite aguda por TNBS. No modelo sub-crônico de colite os tratamentos BuOH e EtOAc reduziram novamente os danos causados pelo TNBS, embora BuOH tenha se mostrado mais eficiente. A avaliação de mediadores envolvidos nesses modelos experimentais mostrou que tanto BuOH quanto EtOAc exercem ação sobre a atividade da glutationa peroxidase (GSH-Px) e mieloperoxidase (MPO) bem como sobre os níveis das citocinas pró-inflamatórias fator de necrose tumoral-? (TNF-?), interferon-? (IFN-?), interleucinas 1?, 6 e 12 (IL-1?, IL-6 e IL-12), além de reduzirem a expressão de ciclo-oxigenase-2 (COX-2) no modelo de DSS. No modelo sub-crônico de colite induzida por TNBS, às duas frações atuaram sobre a atividade da GSH-Px e catalase (CAT) e sobre os níveis de glutationa (GSH), TNF-? e IL-12; EtOH também reduziu os níveis de IL-6 e levou ao aumento de citocina anti-inflamatória interleucina-10 (IL-10), BuOH por sua vez mostrou-se eficaz em reduzir o índice de peroxidação lipídica (TBARS) e atividade da MPO, atuando também sobre a expressão de ciclo-oxigenase-1 (COX-1). A análise fitoquímica revelou presença de procianidinas oligoméricas nas duas frações ativas, BuOH e EtOAc, sugerindo que estas substâncias sejam responsáveis pelos efeitos produzidos pelos tratamentos experimentais. As frações BuOH e EtOAc apresentaram efeitos importantes sobre os componentes imune, inflamatório e oxidante em modelos experimentais de colite induzida por TNBS e DSS em doses consideradas baixas para uma mistura de substâncias. As procianidinas de R. mangle surgem então como alternativa terapêutica interessante sobre as DII / Abstract: Inflammatory bowel diseases (IBD) comprises Crohn's disease and ulcerative colitis, both are characterized by an immune-mediated chronic inflammatory process in the gut. IBD have been studied over the past few years; undefined etiology and the absence of effective treatments justify these studies. In this scenario, natural products arises as therapeutic alternative, once various studies in animal models have shown efficient treatments. Nowadays, molecules with pronounced pharmacological activities, especially phenolic compounds, have been highlighted. In this work three organic fractions (aqueous - Aq, butanolic - BuOH and ethyl acetate - EtOAc) obtained from Rhizophora mangle barks were evaluated in experimental models of dextran sodium sulphate (DSS)-induced colitis in mice and 2,4,6-tri-nitro-benzene sulphonic acid (TNBS)-induced colitis in rats. BuOH (0.5 and 1.5 mg.Kg-1) and EtOAc (1.5 mg.Kg-1) were effective in the DSS-induced model, while BuOH (0.5 mg.Kg-1) and EtOAc (1.5 mg.Kg-1) were also effective in acute TNBS-induced model of colitis, which lead to the evaluation of these last ones in sub-chronic TNBS-induced models of colitis. In this model, both treatments reduced the injury provoked by the instillation of TNBS, although BuOH has shown more efficiency. The evaluation of the mediators involved in these experimental models showed that either BuOH as EtOAc act on the glutathione peroxidase (GSH-Px) and myeloperoxidase activities as well as on pro-inflammatory cytokines tumor necrosis factor- (TNF-?), interferon- (IFN-?) and interleukins -1?, 6 and 12 (IL-1, IL-6 and IL-12) levels, and down-regulation of ciclo-oxygenase-2 (COX-2) expression in the DSS-induced model of colitis. Whereas in the sub-chronic TNBS-induced model of colitis, both fractions showed effects on the GSH-Px and catalase (CAT) activities, and glutathione (GSH), TNF-? and IL-12 levels; EtOAc also reduced IL-6 levels and lead to the enhancement of the levels of an anti-inflammatory cytokine, interlukin-10 (IL-10), on the other hand BuOH showed to be efficient in reducing lipid peroxidation index (TBARS) and MPO activity, acting on the upregulation of cyclo-oxygenase-1 (COX-1). Phytochemistry analysis reveals the presence of oligomeric procyanidins in both fractions, BuOH and EtOAc, suggesting that these substances are responsible for the effects produced by the experimental treatments. BuOH and EtOAc fractions presented important effects on the immune, inflammatory and oxidant components in the experimental models of TNBS and DSS-induced colitis using doses, considered, lower for a mixture of substances. The procyanidins of R. mangle became an interesting alternative therapeutic for IBD / Doutorado / Farmacologia / Doutor em Farmacologia
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Biogeoquímica do ambiente estuarino do rio passa vaca em área urbana de Salvador, BA

Andrade, Consuelo Lima Navarro de 04 April 2012 (has links)
Karina Santos Garcia -Co-orientadora / Submitted by Hora Fontes Nadja Maria (pospetro@ufba.br) on 2012-11-12T19:12:35Z No. of bitstreams: 1 DISSERTA_ C L N ANDRADE.pdf: 4887549 bytes, checksum: 9a878f6bec7244405e18e8330d1b1b80 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-12T19:12:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTA_ C L N ANDRADE.pdf: 4887549 bytes, checksum: 9a878f6bec7244405e18e8330d1b1b80 (MD5) Previous issue date: 2012-04-04 / FAPESB; CAPES / Este trabalho apresenta um estudo biogeoquímico no estuário do rio Passa Vaca, situado em área urbana da cidade de Salvador, Bahia. Para o estudo da morfologia foliar foram estabelecidas três áreas de amostragem, nas quais foram selecionaas três árvores de cada espécie obrigatória de manguezal presente (Laguncularia racemosa (L.) Gaertn e Rhizophora mangle L.) e coletadas 30 folhas adultas em cada. Foram avaliadas: as medidas biométricas; as características externas (necrose tecidual, clorose, perfurações, bordas revolutas e manchas escuras); e as características internas (disposição dos diversos tecidos, presença de glândulas, de galhas, drusas, dentre outras estruturas) por meio de cortes histológicos. Para o estudo das demais variáveis foram estabelecidos dois transectos nas margens do rio, nos quais foram demarcados 15 pontos de amostragem com 60 m² cada. Para a avaliação da estrutura da vegetação, foram contados e mensurados alturas e circunferências de todos os indivíduos, das espécies obrigatórias de manguezal presentes. Para o estudo químico foram também coletadas, em cada ponto dos transectos, 30 folhas adultas, porções de sedimento de superfície, e estimados os parâmetros não conservativos: pH, Eh, temperatura e salinidade, na água intersticial e no sedimento e o Oxigênio Dissolvido (OD) nas águas superficiais do rio. Foram determinados os elementos: Zn, Cu, Fe, Mn, Na, K, Ca, Al nas folhas e nos sedimentos, além de Mg nas folhas; e os teores de P, Carbono Orgânico Total (COT), N, granulometria e isótopos de nitrogênio (δ 15 N) e carbono (δ 13 C) nos sedimentos. Os resultados demonstraram que a espécie Laguncularia racemosa (L.) Gaertn teve maior dominância na área estudada e que o bosque estudado se encontra em estágio maduro de desenvolvimento. Á nível morfológico as espécies apresentaram muitas adaptações relacionadas à manutenção da homeostase e para a sobrevivência em ambiente antropizado. Além disso, foram observadas muitas necroses e fragilidades teciduais, sobretudo na espécie Laguncularia racemosa (L.) Gaertn. Entretanto, a composição química e a morfologia das folhas, no geral, não diferiram de outros estudos em áreas de manguezal também impactadas por atividades antrópicas, com exceção para as concentrações de K, que estiveram abaixo do referenciado pela literatura. Nos sedimentos foram encontradas concentrações de Cu e Fe acima do referenciado pela literatura em alguns pontos e foram observadas correlações entre a temperatura do sedimento e a densidade de indivíduos mortos, além de associações entre densidade de Rhizophora mangle L. e a composição química do substrato. Também foram observadas correlações sedimento/ planta na concentração dos nutrientes avaliados, contudo, os fatores de concentração para os metais pesados estiveram abaixo de 1,0, indicando baixa absorção destes pelas plantas. A razão molar C/N e isotópicas δ 13 C e δ 15 C indicaram que um percentual considerável da matéria orgânica na área estudada é de fonte terrestre, sendo proveniente da vegetação do próprio manguezal. Assim, ficou evidenciado que a vegetação do estuário do rio Passa Vaca atua como barreira biogeoquímica no transporte e exportação de metais para o manguezal e o ecossistema costeiro adjacente. / Salvador

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