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Sélection de groupes de variables corrélées en grande dimension / Selection of groups of correlated variables in a high dimensionnal setting

Grimonprez, Quentin 14 December 2016 (has links)
Le contexte de cette thèse est la sélection de variables en grande dimension à l'aide de procédures de régression régularisée en présence de redondance entre variables explicatives. Parmi les variables candidates, on suppose que seul un petit nombre est réellement pertinent pour expliquer la réponse. Dans ce cadre de grande dimension, les approches classiques de type Lasso voient leurs performances se dégrader lorsque la redondance croît, puisqu'elles ne tiennent pas compte de cette dernière. Regrouper au préalable ces variables peut pallier ce défaut, mais nécessite usuellement la calibration de paramètres supplémentaires. L'approche proposée combine regroupement et sélection de variables dans un souci d'interprétabilité et d'amélioration des performances. D'abord une Classification Ascendante Hiérarchique (CAH) fournit à chaque niveau une partition des variables en groupes. Puis le Group-lasso est utilisé à partir de l'ensemble des groupes de variables des différents niveaux de la CAH à paramètre de régularisation fixé. Choisir ce dernier fournit alors une liste de groupe candidats issus potentiellement de différents niveaux. Le choix final des groupes est obtenu via une procédure de tests multiples. La procédure proposée exploite la structure hiérarchique de la CAH et des pondérations dans le Group-lasso. Cela permet de réduire considérablement la complexité algorithmique induite par la flexibilité. / This thesis takes place in the context of variable selection in the high dimensional setting using penalizedregression in presence of redundancy between explanatory variables. Among all variables, we supposethat only a few number is relevant for predicting the response variable. In this high dimensional setting,performance of classical lasso-based approaches decreases when redundancy increases as they do not takeit into account. Firstly aggregating variables can overcome this problem but generally requires calibrationof additional parameters. The proposed approach combines variables aggregation and selection in order to improve interpretabilityand performance. First, a hierarchical clustering procedure provides at each level a partition of the variablesinto groups. Then the Group-lasso is used with the set of groups of variables from the different levels ofthe hierarchical clustering and a fixed regularization parameter. Choosing this parameter provides a list ofcandidates groups potentially coming from different levels. The final choice of groups is done by a multipletesting procedure. The proposed procedure exploits the hierarchical structure from hierarchical clustering and some weightsin Group-lasso. This allows to greatly reduce the algorithm complexity induced by the possibility to choosegroups coming from different levels of the hierarchical clustering.
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Arbres de décision et forêts aléatoires pour variables groupées / Decisions trees and random forests for grouped variables

Poterie, Audrey 18 October 2018 (has links)
Dans de nombreux problèmes en apprentissage supervisé, les entrées ont une structure de groupes connue et/ou clairement identifiable. Dans ce contexte, l'élaboration d'une règle de prédiction utilisant les groupes plutôt que les variables individuelles peut être plus pertinente tant au niveau des performances prédictives que de l'interprétation. L'objectif de la thèse est de développer des méthodes par arbres adaptées aux variables groupées. Nous proposons deux approches qui utilisent la structure groupée des variables pour construire des arbres de décisions. La première méthode permet de construire des arbres binaires en classification. Une coupure est définie par le choix d'un groupe et d'une combinaison linéaire des variables du dit groupe. La seconde approche, qui peut être utilisée en régression et en classification, construit un arbre non-binaire dans lequel chaque coupure est un arbre binaire. Ces deux approches construisent un arbre maximal qui est ensuite élagué. Nous proposons pour cela deux stratégies d'élagage dont une est une généralisation du minimal cost-complexity pruning. Les arbres de décision étant instables, nous introduisons une méthode de forêts aléatoires pour variables groupées. Outre l'aspect prédiction, ces méthodes peuvent aussi être utilisées pour faire de la sélection de groupes grâce à l'introduction d'indices d'importance des groupes. Ce travail est complété par une partie indépendante dans laquelle nous nous plaçons dans un cadre d'apprentissage non supervisé. Nous introduisons un nouvel algorithme de clustering. Sous des hypothèses classiques, nous obtenons des vitesses de convergence pour le risque de clustering de l'algorithme proposé. / In many problems in supervised learning, inputs have a known and/or obvious group structure. In this context, elaborating a prediction rule that takes into account the group structure can be more relevant than using an approach based only on the individual variables for both prediction accuracy and interpretation. The goal of this thesis is to develop some tree-based methods adapted to grouped variables. Here, we propose two new tree-based approaches which use the group structure to build decision trees. The first approach allows to build binary decision trees for classification problems. A split of a node is defined according to the choice of both a splitting group and a linear combination of the inputs belonging to the splitting group. The second method, which can be used for prediction problems in both regression and classification, builds a non-binary tree in which each split is a binary tree. These two approaches build a maximal tree which is next pruned. To this end, we propose two pruning strategies, one of which is a generalization of the minimal cost-complexity pruning algorithm. Since decisions trees are known to be unstable, we introduce a method of random forests that deals with groups of inputs. In addition to the prediction purpose, these new methods can be also use to perform group variable selection thanks to the introduction of some measures of group importance, This thesis work is supplemented by an independent part in which we consider the unsupervised framework. We introduce a new clustering algorithm. Under some classical regularity and sparsity assumptions, we obtain the rate of convergence of the clustering risk for the proposed alqorithm.

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