Plusieurs espèces d’oiseaux forestiers qui se reproduisent en Amérique du Nord ont des effectifs en déclin et nécessitent donc un suivi à long terme afin de respecter nos engagements en matière de biodiversité. De celles-ci une forte proportion est représentée par des espèces spécialistes de divers types d’habitats ouverts, c’est-à-dire sans couvert arborescent. Des habitats ouverts sont créés chaque année par les coupes totales en forêt boréale, mais ils sont en nette diminution dans les forêts plus méridionales de l’Est de l’Amérique du Nord depuis quelques décennies. Suite à l’importante médiatisation menée par plusieurs groupes de pression pour décrier la perte des forêts surannées et vierges, les coupes totales pratiquées par les forestiers sont de plus en plus mal perçues. Pourtant, les coupes totales, en tant que milieux ouverts, peuvent constituer d’importants habitats fauniques. Afin de déterminer leur importance pour la conservation, il est essentiel de mieux connaître leur utilisation par la faune. Cette étude s’est penchée sur une espèce faunique de milieux ouverts, la Paruline à calotte noire (Wilsonia pusilla). Les populations de cette espèce subissent une importante diminution depuis les 40 dernières années. Nous avons donc mesuré l’occurrence de cette espèce dans 43 sites d’aulnaies et 90 sites de coupes totales, sur le territoire de la Forêt Montmorency, Québec. Nous avons également mesuré 5 paramètres phénotypiques (poids, longueur de rectrice, longueur du bec, longueur de la calotte et longueur de l’aile) afin de vérifier s’il existait une différence entre les individus capturés dans les deux milieux. Finalement, nous avons vérifié quels étaient les facteurs du paysage qui influençaient l’occurrence de l’oiseau dans un site, et ce à quatre rayons différents (50m, 100m, 200m et 400m). Nous avons trouvé une proportion équivalente de Paruline à calotte noire dans les aulnaies que dans les coupes totales. Nous n’avons trouvé aucune différence phénotypique entre les individus capturés dans les deux habitats. La quantité de milieux ouverts autours des sites était fortement associée avec la présence de Parulines à calotte noire et ce, aux quatre rayons étudiés. La présence d’aulnaies buissonnantes et la quantité de régénération entre 2 et 4 m étaient aussi associées à la présence de l’espèce. Ces résultats jettent une nouvelle lumière sur l’habitat de l’espèce et identifient les coupes totales comme des milieux potentiellement importants pour le maintien des populations. Cependant, le rôle joué par les coupes totales devra être précisé grâce à des données sur la reproduction. / Many bird species breeding in North America require long term tracking because of their unknown or declining population status. Of those, an important proportion is represented by species associated with open habitats. Open habitats are created every year by clear-cutting in boreal forest but they have been decreasing since last two decades in deciduous and mixed forests of Eastern North America. Due to the important media coverage with conservation NGOs accusing clear-cutting and other types of timber harvest for the loss of old forest and associated species, perception of perturbation of forest made by man is mostly negative. However, clear-cuts, as open habitats, may be important to wildlife. To understand their conservation value, it is necessary to better understand their use by wildlife. The present study focused on a species dependent on open areas, Wilson’s Warbler (Wilsonia pusilla). Populations of this species have been declining importantly since the last 40 years. We evaluated species occurrence in 43 alder sites and 90 clear-cut sites, at the Forêt Montmorency, Québec. We also measured 5 physical traits of captured males (weight, rectrix length, beak length, cap length and wing length) in order to establish if there is a difference between birds found in the two different habitats. Finally, we evaluated which factors of the landscape affected the occurrence of bird in a site, at four different radii (50, 100, 200 and 400 m). We found an equal proportion of Wilson’s Warbler in both habitats and no phenotypic difference was found. Percentage of open area around site was strongly associated with the presence of Wilson’s Warblers, at each radius. Presence of patchy alder and percentage of regeneration between 2 and 4 m high were also associated with the species’ occurrence. Those results throw new light on the habitat of Wilson’s Warblers and highlight the potential role of clear-cuts for the maintenance of its populations. However, the role of clear-cuts will need to addressed with data on reproduction.

Les déclins de populations d'amphibiens ont généré de nombreux travaux sur les effets de la perte d'habitats variés, mais peu en milieux naturellement acides. Néanmoins, plusieurs tourbières du sud-est canadien sont perturbées par l'extraction de la tourbe. Dans le premier chapitre, j'ai comparé l'utilisation des milieux tourbeux par les amphibiens à celle des milieux non tourbeux. Dans les quatre chapitres subséquents, j'ai quantifié les effets de l'extraction de la tourbe sur l'utilisation des étangs de tourbières par les amphibiens et mesuré les contraintes liées à leurs déplacements sur des surfaces exploitées. Les résultats indiquent que les amphibiens utilisent les tourbières surtout comme sites d'estivage. De plus, l'intensité de l'exploitation influence la fréquentation des étangs, mais la quantité et la proximité d'habitats complémentaires (i.e., étangs adjacents, forêt) semblent réduire ces effets. Finalement, les surfaces arides associées à certaines activités anthropiques telles que l'exploitation des tourbières ou l'agriculture, entravent les déplacements des grenouilles, bien que ces effets puissent être atténués par la présence de canaux de drainage. / Global amphibian population declines have generated numerous studies on the effects of habitat loss, but few have been conducted in naturally-acidic environments. Nevertheless, many peatlands are undergoing peat extraction in southeastern Canada. Through five chapters, I have studied the use of bog habitats by amphibians, quantified the effects of peat extraction on amphibian occurrence at bog ponds, and measured the constraints associated with movements over mined surfaces. Bogs were less productive breeding sites than less acidic upland sites, but were used by adults and juveniles following breeding outside bogs. Bog ponds on surfaces actively mined for peat offered suboptimal habitats to green frogs (Rana clamitans), whereas bog ponds on surfaces drained for future peat mining, characterized by the presence of drainage ditches and vegetation, provided supplementary frog habitat. However, this positive effect was only temporary, as these surfaces were to be eventually mined. In a study conducted at a larger scale and focusing on bog ponds on unmined surfaces, I showed the importance of the amount and proximity of complementary habitats (i.e., adjacent ponds, forest) on the spatial distribution of amphibian presence at ponds. Moreover, frog movement experiments revealed that frogs translocated on barren peat surfaces had a lower probability of homing successfully than those translocated at a similar distance on an undisturbed surface, and that dehydration risks were the lowest on natural surfaces with vegetation cover. No reproduction occurred in drainage ditches, although frog survival in these structures was high. In addition, ditches did not impede the movements of individuals. Globally, results indicate that amphibians use bogs mostly as summering sites. Furthermore, peat mining intensity influences the occurrence of amphibians at ponds, but the proximity and amount of complementary habitats could mitigate these effects. Finally, barren surfaces associated with certain human disturbances such as peat mining and agriculture impede frog movements, although drainage ditches, particularly those containing water, may facilitate movements across these hostile environments.

Le stress hydro-thermique a été évalué pour la région du sud du Québec à l’aide des images SPOT VEGETATION (VGT) et NOAA AVHRR, pour deux saisons de croissance (1999 et 2000). Pour extraire la température de surface à l’aide des images AVHRR, l’algorithme ‘split-window’ (Coll et al., 1994b) a été choisi suite à la comparaison avec six algorithmes connus. Les réseaux de neurones artificiels ont été entraînés pour la détection des nuages sur les données quotidiennes synthèses (S1) et les données P. Cette analyse montre que les réseaux identifient les nuages avec plus de précision que le masque standard fourni avec les données. Les réseaux détectent non seulement les nuages épais et brillants, mais également les nuages minces et peu brillants. Comme autre application, les réseaux ont été employés pour estimer la température de l'air. Les variables d’entrées pour les réseaux étaient les cinq bandes de l'image AVHRR, l'altitude de surface, l'angle de zénith solaire, et le jour julien. Le réseau utilisant toutes les données d’entrée a fourni les meilleurs résultats, avec 22 noeuds dans la couche cachée. Le ‘normalized difference vegetation index’ (NDVI) et le ‘normalized difference water index’ (NDWI) sont déduits de SPOT VGT pour évaluer l’état hydrique végétal et la température de surface a été obtenu des images AVHRR pour l’état thermique. Ces deux indices de végétation forment un nouvel indice d’humidité normalisée (NMI) qui s’est révélé inversement corrélé à la température de surface. Un trapèze, exploitant les valeurs de la température de surface et du NMI, permet d’identifier le statut hydro-thermique du couvert végétal. Ces résultats sont validés par une comparaison avec les indices forêt-météo de la méthode canadienne. / The thermal-water stress of the vegetation canopy was evaluated for southern region Québec from SPOT VEGETATION (VGT) and NOAA AVHRR images, and for the 1999 and 2000 reproduction seasons. To retrieve surface temperatures from AVHRR images, the algorithm of Coll et al. (1994b) was found to be the optimal method for our study area by comparing six algorithms. Artificial Neural Networks (ANNs) were trained for cloud detection on daily synthesis (S1) and P data of the SPOT VGT system. The analysis demonstrated the superior classification of the network over the standard cloud masks provided with the data. The network detected not only bright thick clouds but also thin or darker clouds. As another application study, ANNs were employed for estimating air temperatures. The input variables for the networks were the five bands of the AVHRR image, surface altitude, the solar zenith angle, and Julian day. The network using all the input data provided the best results, with 22 nodes in the hidden layer. The Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) and the Normalized Difference Water Index (NDWI) were derived from SPOT VGT for evaluating vegetation water status and surface temperature was retrieved from AVHRR for the thermal status. The two vegetation indices were integrated for evaluating the vegetation condition and water status as a new index, namely the Normalized Moisture Index (NMI). A trapezoid was defined by the NMI and by surface temperature and the thermal-water status of the vegetation canopy was determined according to the four sectors of the trapezoid. The thermal-water status was validated by comparing it with the indices of the Canadian Forest Fire Weather Index System.