Cette thèse s'intéresse en premier lieu à l'évaluation des effets fonctionnels des erreurs survenant dans la mémoire SRAM de configuration de certains FPGAs. La famille Virtex II Pro de Xilinx est utilisée comme premier cas pratique d'expérimentation. Des expérimentations sous faisceau laser nous ont permis d'avoir une bonne vue d'ensemble sur les motifs d'erreurs réalistes qui sont obtenus par des sources de perturbations réelles. Une méthodologie adaptée d'injection de fautes a donc été définie pour permettre une meilleure évaluation, en phase de conception, de la robustesse d'un circuit implanté sur ce type de technologie. Cette méthodologie est basée sur de la reconfiguration dynamique. Le même type d'approche a ensuite été évalué sur plusieurs cibles technologiques, ce qui a nécessité le développement de plusieurs environnements d'injection de fautes. L'étude a pour la première fois inclus la famille AT40K de ATMEL, qui permet un type de reconfiguration unique et efficace. Le second type de contribution concerne l'augmentation à faible coût de la robustesse de circuits implantés sur des plateformes FPGA SRAM. Nous proposons une approche de protection sélective exploitant les ressources du FPGA inutilisées par l'application. L'approche a été automatisée sur plusieurs cibles technologiques (Xilinx, Altera) et l'efficacité est analysée en utilisant les méthodes d'injection de fautes précédemment développées. / This thesis focuses primarily on the evaluation of the functional effects of errors occurring in the SRAM configuration memory of some FPGAs. Xilinx Virtex II Pro family is used as a first case study. Experiments under laser beam allowed us to have a good overview of realistic error patterns, related to real disturbance sources. A suited fault injection methodology has thus been defined to improve design-time robustness evaluations of a circuit implemented on this type of technology. This methodology is based on runtime reconfiguration. The approach has then been evaluated on several technological targets, requiring the development of several fault injection environments. The study included for the first time the ATMEL AT40K family, with a unique and efficient reconfiguration mode. The second type of contribution is focused on the improvement at low cost of the robustness of designs implemented on SRAM-based FPGA platforms. We propose a selective protection approach exploiting resources unused by the application. The approach has been automated on several technological targets (Xilinx, Altera) and the efficiency has been analyzed by taking advantage of the fault injection techniques previously developed.