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Detecção e caracterização moleculares de Astrovirus bovino na região centro-sul do Brasil / Molecular detection and characterization of bovine Astrovirus in centralsouth region of Brazil

Marcelo Candido 25 August 2014 (has links)
As doenças entéricas associadas com diarreia, desidratação e perda de peso constituem um dos principais problemas da bovinocultura mundial, contribuindo para expressivos índices de morbidade e mortalidade, principalmente entre neonatos. Nesse contexto, exigências para o aprimoramento do diagnóstico laboratorial de doenças entéricas de natureza infectocontagiosa, tornaram-se constantes, face às perdas econômicas vinculadas. Entre os principais enteropatógenos virais, de distribuição mundial e história recente, destaca-se o astrovírus bovino (BoAstV), cuja primeira identificação data de 1978. BoAstV entérico induz diarreia principalmente entre neonatos e imunocomprometidos, tendo uma prevalência acima de 60% nas 5 primeiras semanas de vida dos animais. Devido à carência de dados a respeito da prevalência desse vírus no Brasil, o presente estudo foi realizado objetivando a detecção e caracterização moleculares de cepas de BoAstV em amostras fecais de bovinos com e sem diarreia de diferentes idades. O estudo foi conduzido a partir de 272 animais em diferentes estados do Brasil, obtendo-se 14,3% de positividade através de RT-PCR, sendo que 11 amostras, provenientes dos estados de São Paulo, Minas Gerais e Rio Grande do Sul, foram submetidas ao sequenciamento nucleotídico. A similaridade entre as sequências deduzidas de aminoácidos das amostras obtidas foi maior do que 86,8%, quando comparadas umas com as outras, e situou-se entre 86,2 a 94,8% quando comparadas com sequências de outros BoAstV descritos. Nas reconstruções filogenéticas, 9 amostras agruparam-se conjuntamente em clado distinto de outros BoAstV, uma amostra (BoAstV-155-BRA) formou ramo parafilético a clado que agrupa tanto outros BoAstV como astrovírus de cervídeos e a amostra restante (BoAstV-267-BRA) formou ramo basal aos astrovírus bovinos e suínos. No entanto, o posicionamento das 2 amostras divergentes (BoAstV-155-BRA e BoAstV-267-BRA) não derivou de episódios de seleção positiva ou recombinação. Em síntese, os resultados obtidos indicam, de maneira inédita, a circulação de variantes de BoAstV entérico em rebanhos de estados da região centro-sul do Brasil. / Enteric diseases associated with diarrhea, dehydration and weight loss is one of the major problems of cattle worldwide, contributing to significant morbidity and mortality, especially among newborns. In this context, demands for improving the laboratory diagnosis of infectious enteric diseases, became constant, given the economic losses involved. Among the major viral enteropathogens of worldwide distribution and recent history, highlight the bovine astrovirus (BoAstV), whose first mention dates from 1978. Enteric BoAstV induce diarrhea especially among newborns and immunocompromised animals, having a prevalence above 60% in the first 5 weeks of life. Due to lack of data concerning the occurrence of this virus in Brazil, the present study was aimed at molecular detection and characterization of BoAstV strains in fecal samples from cattle with and without diarrhea of different ages. The study was conducted on 272 animals from different states of Brazil, obtaining positivity of 14.3% by RT-PCR, and 11 samples from the states of São Paulo, Minas Gerais and Rio Grande do Sul were subjected to nucleotide sequencing. The similarity between the deduced amino acid sequences of the samples was greater than 86.8% when compared with each other and was between 86.2 to 94.8% compared with sequences of other BoAstV described. In phylogenetic reconstructions, 9 samples were grouped together in a separate clade from other BoAstV, a sample (BoAstV-155-BRA) formed a paraphyletic branch to a clade that groups both other BoAstV and deer astrovirus and the remaining sample (267-BRA-BoAstV ) formed a basal branch to bovine and porcine astrovirus. However, the positioning of the two different samples (BoAstV-155-BRA and BoAstV-267-BRA) did not derive from episodes of positive selection or recombination. In summary, the results indicate, in an unprecedented manner, the circulation of enteric BoAstV variants in herds of cattle form states of the south-central region of Brazil.
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Detecção e caracterização moleculares de Astrovirus bovino na região centro-sul do Brasil / Molecular detection and characterization of bovine Astrovirus in centralsouth region of Brazil

Candido, Marcelo 25 August 2014 (has links)
As doenças entéricas associadas com diarreia, desidratação e perda de peso constituem um dos principais problemas da bovinocultura mundial, contribuindo para expressivos índices de morbidade e mortalidade, principalmente entre neonatos. Nesse contexto, exigências para o aprimoramento do diagnóstico laboratorial de doenças entéricas de natureza infectocontagiosa, tornaram-se constantes, face às perdas econômicas vinculadas. Entre os principais enteropatógenos virais, de distribuição mundial e história recente, destaca-se o astrovírus bovino (BoAstV), cuja primeira identificação data de 1978. BoAstV entérico induz diarreia principalmente entre neonatos e imunocomprometidos, tendo uma prevalência acima de 60% nas 5 primeiras semanas de vida dos animais. Devido à carência de dados a respeito da prevalência desse vírus no Brasil, o presente estudo foi realizado objetivando a detecção e caracterização moleculares de cepas de BoAstV em amostras fecais de bovinos com e sem diarreia de diferentes idades. O estudo foi conduzido a partir de 272 animais em diferentes estados do Brasil, obtendo-se 14,3% de positividade através de RT-PCR, sendo que 11 amostras, provenientes dos estados de São Paulo, Minas Gerais e Rio Grande do Sul, foram submetidas ao sequenciamento nucleotídico. A similaridade entre as sequências deduzidas de aminoácidos das amostras obtidas foi maior do que 86,8%, quando comparadas umas com as outras, e situou-se entre 86,2 a 94,8% quando comparadas com sequências de outros BoAstV descritos. Nas reconstruções filogenéticas, 9 amostras agruparam-se conjuntamente em clado distinto de outros BoAstV, uma amostra (BoAstV-155-BRA) formou ramo parafilético a clado que agrupa tanto outros BoAstV como astrovírus de cervídeos e a amostra restante (BoAstV-267-BRA) formou ramo basal aos astrovírus bovinos e suínos. No entanto, o posicionamento das 2 amostras divergentes (BoAstV-155-BRA e BoAstV-267-BRA) não derivou de episódios de seleção positiva ou recombinação. Em síntese, os resultados obtidos indicam, de maneira inédita, a circulação de variantes de BoAstV entérico em rebanhos de estados da região centro-sul do Brasil. / Enteric diseases associated with diarrhea, dehydration and weight loss is one of the major problems of cattle worldwide, contributing to significant morbidity and mortality, especially among newborns. In this context, demands for improving the laboratory diagnosis of infectious enteric diseases, became constant, given the economic losses involved. Among the major viral enteropathogens of worldwide distribution and recent history, highlight the bovine astrovirus (BoAstV), whose first mention dates from 1978. Enteric BoAstV induce diarrhea especially among newborns and immunocompromised animals, having a prevalence above 60% in the first 5 weeks of life. Due to lack of data concerning the occurrence of this virus in Brazil, the present study was aimed at molecular detection and characterization of BoAstV strains in fecal samples from cattle with and without diarrhea of different ages. The study was conducted on 272 animals from different states of Brazil, obtaining positivity of 14.3% by RT-PCR, and 11 samples from the states of São Paulo, Minas Gerais and Rio Grande do Sul were subjected to nucleotide sequencing. The similarity between the deduced amino acid sequences of the samples was greater than 86.8% when compared with each other and was between 86.2 to 94.8% compared with sequences of other BoAstV described. In phylogenetic reconstructions, 9 samples were grouped together in a separate clade from other BoAstV, a sample (BoAstV-155-BRA) formed a paraphyletic branch to a clade that groups both other BoAstV and deer astrovirus and the remaining sample (267-BRA-BoAstV ) formed a basal branch to bovine and porcine astrovirus. However, the positioning of the two different samples (BoAstV-155-BRA and BoAstV-267-BRA) did not derive from episodes of positive selection or recombination. In summary, the results indicate, in an unprecedented manner, the circulation of enteric BoAstV variants in herds of cattle form states of the south-central region of Brazil.
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Diagnóstico de situação das práticas de manejo sanitário em sistemas de produção de bovinos de corte

Pereira, Fabrine Bigatão [UNESP] 08 June 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-08Bitstream added on 2014-06-13T19:06:52Z : No. of bitstreams: 1 pereira_fb_me_araca.pdf: 217017 bytes, checksum: 8fb60d4d11b4db0ce05a5ae9859bbffd (MD5) / Foram entrevistados 21 produtores rurais com o objetivo de avaliar quais as práticas de manejo sanitário adotadas nos sistemas de produção de bovinos de corte, em propriedades rurais localizadas no Estado de São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Rondônia. A pesquisa foi realizada através de abordagem qualitativa, com a colheita dos dados obtida por meio de questionário e entrevista pessoal junto aos proprietários rurais. Foram questionadas as atitudes e procedimentos sanitários correntes nesses sistemas de produção tais como: orientação veterinária, práticas sanitárias preventivas e de vigilância epidemiológica, conhecimento dos riscos sanitários para a produção segura de alimentos, alimentação dos animais, vacinas e vacinações, sistema de registros, medidas com os neonatos, produtos utilizados no ambiente e nos animais, período de carência, treinamento de funcionários, destino dos animais mortos, entre outras. Dentre os dados obtidos constatou-se que apenas 30% das propriedades possuíam assistência veterinária, 67% afirmaram respeitar o período de carência dos produtos, embora nenhum dos produtores soube mencionar estes períodos. Em 48% das propriedades eram os médicos veterinários que prescreviam medicamentos aos animais, dois proprietários relataram comprar e utilizar produtos veterinários vencidos nos animais e 48% já receberam algum tipo de treinamento na propriedade. Diante deste cenário, evidencia-se que os produtores rurais deveriam estar melhor preparados para inserção de seus produtos em um mercado altamente exigente e competitivo. Nesse contexto, agregar valor ao produto depende, sobretudo, da condição sanitária dos rebanhos. / We interviewed 21 farmers in order to access which sanitary practices adopted in the production systems of beef cattle on farms located in São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul and Rondonia. The survey was conducted through a qualitative approach to the collection of data obtained through questionnaire and personal interview with the landowners. We questioned the attitudes and sanitation procedures in these current production systems such as veterinary assistance, preventive health practices and disease surveillance, knowledge of health hazards for the safe production of food, animal feed, vaccine and Immunizations, registration system, measures with newborns, products used in the environment and animals, grace period, employee training, destination of the dead animals, among others. Along with the data found that only 30% of properties owned veterinary care, 67% said they meet the expiration dates of the products, although it was not mentioned on the products if there were any. In only 48% of properties were veterinarians who prescribed drugs to animals. Only two of the owners confirmed buying and using expired products in animals and only 48% have received some training on the property. In this setting, it is evident that farmers should be better prepared for insertion of its products in a highly demanding and competitive market. In this context, add value to the product depends mainly on the condition of sanitation of the herds.
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Fatores de risco para a infecção pelo vírus da leucose enzoótica bovina no sítio histórico e patrimônio cultural Kalunga / Risk factors for the infection by the bovine enzootic leukosis virus in the Kalunga historical site and cultural patrimony

Peixoto, Sáudio Vieira 04 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-19T14:00:03Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Sáudio Vieira Peixoto - 2016.pdf: 3836457 bytes, checksum: a9f93d3fb8e43ae7ed41d388de796750 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-19T14:00:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Sáudio Vieira Peixoto - 2016.pdf: 3836457 bytes, checksum: a9f93d3fb8e43ae7ed41d388de796750 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-19T14:00:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Sáudio Vieira Peixoto - 2016.pdf: 3836457 bytes, checksum: a9f93d3fb8e43ae7ed41d388de796750 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In the present study, the frequency of cattle infected by leukosis virus was evaluated in the herds of the Kalunga Historical Site and Cultural Heritage (SHPCK) and the association with environmental, sanitary and socioeconomic characteristics was performed. The SHPCK is located among the municipalities of Cavalcante, Monte Alegre de Goiás, and Teresina de Goiás, in the state of Goiás, 79 animals were included and blood samples were collected from 2,612 bulls (Curraleiro Pé-Duro and Caracu), zebu cattle (Nellore, Gir and Tabapuã) and crossbred animals. Detection of leukosis antiviral antibodies was performed using the agar gel immunodiffusion technique (IDGA - TECPAR ®). The edaphoclimatic variables of the municipalities were obtained through the database of the Laboratory of Image Processing and Geoprocessing (LAPIG) of UFG, at each point recorded in the GPS. Altitude data were collected from the Shutter Radar Topographic Mission satellite and zootechnical and socioeconomic data were obtained through questionnaires applied to the owners. The frequency of enzootic bovine leukosis in SHPCK herds was 29.29%. Among the different age groups, the following frequencies were observed: 12.8% at ages from 0 to 24 months, 32.1% from 25 to 36 months and 41.5% at ages over 36 months. The association between the studied variables and the frequency of leukosis showed a significant correlation for the breeds, age groups, vaccines, type of pasture available to cattle, family income, normalized difference vegetation index (INDV) and maximum temperatures in the warmer month. / No presente estudo foi avaliada a frequência de bovinos infectados pelo vírus da leucose nos rebanhos do Sítio Histórico e Patrimônio Cultural Kalunga (SHPCK) e realizada a associação com características ambientais, sanitárias e socioeconômicas. O SHPCK situa-se entre os municípios de Cavalcante, Monte Alegre de Goiás e Teresina de Goiás, no Estado de Goiás; foram incluídas 79 propriedades e colhidas amostras de sangue de 2.612 bovinos de raças taurinas (Curraleiro Pé-Duro e Caracu), zebuínas (Nelore, Gir e Tabapuã) e mestiços. A detecção de anticorpos antivírus da leucose foi realizado por meio da técnica de imunodifusão em ágar gel (IDGA - TECPAR®). As variáveis edafoclimáticas dos municípios foram obtidas por meio do banco de dados do Laboratório de Processamento de Imagens e Geoprocessamento (LAPIG) da UFG, em cada ponto registrado no GPS. Foram colhidos dados relativos à altitude por meio do satélite Shutter Radar Topographic Mission e os dados zootécnicos e socioeconômicos foram obtidos por meio de questionários aplicados aos proprietários. A frequência de leucose enzoótica bovina nos rebanhos do SHPCK foi de 29,29%. Entre as diferentes faixas etárias foi observado as seguintes frequências: 12,8% em idades de 0 a 24 meses, 32,1% de 25 a 36 meses e 41,5% naqueles com mais de 36 meses. A associação entre as variáveis estudadas e a frequência da leucose apresentou correlação significativa para as raças, faixas etárias, vacinas, tipo de pastagens disponíveis aos bovinos, renda familiar, índice da vegetação por diferença normalizada (INDV) e temperaturas máximas no mês mais quente.

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