La forma en que se encuentran distribuidos los estudiantes al interior del sistema escolar tiene fuertes implicancias sobre los niveles de equidad que alcanza toda sociedad. Dicha problemática ha sido motivo de investigaciones previas en Chile, las que se han concentrado en la situación general del sistema escolar o de los estudiantes más vulnerables. En este estudio se analiza a la elite, enfocándose específicamente en las elites socioeconómicas y académicas, con el doble objetivo de, por un lado, evidenciar cómo se encuentran distribuidas por tipos de dependencia, y por otro, de cuantificar -mediante el uso de indicadores- el grado en que éstas se encuentran segregadas en algunos establecimientos en particular. En ambos casos se analiza la evolución durante el período 1999-2006, utilizando datos de la prueba SIMCE. Los resultados obtenidos dan cuenta de que los establecimientos particulares subvencionados con financiamiento compartido han permitido desconcentrar a las elites, producto del traslado de un grupo significativo de estos estudiantes desde colegios particulares pagados. Sin embargo, los índices no muestran señales que la segregación haya disminuido, lo que indica que, a pesar de dicha movilidad, los estudiantes de elite se mantuvieron segregados en algunas escuelas en particular. Al respecto, los resultados permiten concluir que los estudiantes de la elite socioeconómica se encuentran más segregados que los estudiantes de la elite académica, (entendida como mejores resultados en la prueba SIMCE de matemáticas). Mientras los primeros muestran señales de hiper-segregación prácticamente hasta el 30% de los estudiantes más aventajados, los segundos muestran señales en el margen y sólo a nivel de segundo medio. Adicionalmente, los estudiantes de la elite socioeconómica se encontraban al inicio del período mayormente segregados y aislados a nivel de cuarto básico que a nivel de segundo medio, brecha que tiende a desaparecer hacia el año 2006 producto de un fuerte aumento en la segregación en segundo medio. Respecto a los resultados del análisis de la elite académica, éstos muestran mayores (y estables) niveles de segregación y aislamiento a nivel de segundo medio que a nivel de cuarto básico, sugiriendo que existen factores en nuestro sistema escolar que estarían acentuando los niveles de segregación académica en edades más avanzadas de nuestros estudiantes.