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Determination of the Halogenated Skeleton Constituents of the Marine Demosponge Ianthella basta

Ueberlein, Susanne, Machill, Susanne, Schupp, Peter J., Brunner, Eike 17 July 2017 (has links) (PDF)
Demosponges of the order Verongida such as Ianthella basta exhibit skeletons containing spongin, a collagenous protein, and chitin. Moreover, Verongida sponges are well known to produce bioactive brominated tyrosine derivatives. We recently demonstrated that brominated compounds do not only occur in the cellular matrix but also in the skeletons of the marine sponges Aplysina cavernicola and I. basta. Further investigations revealed the amino acid composition of the skeletons of A. cavernicola including the presence of several halogenated amino acids. In the present work, we investigated the skeletal amino acid composition of the demosponge I. basta, which belongs to the Ianthellidae family, and compared it with that of A. cavernicola from the Aplysinidae family. Seventeen proteinogenic and five non-proteinogenic amino acids were detected in I. basta. Abundantly occurring amino acids like glycine and hydroxyproline show the similarity of I. basta and A. cavernicola and confirm the collagenous nature of their sponging fibers. We also detected nine halogenated tyrosines as an integral part of I. basta skeletons. Since both sponges contain a broad variety of halogenated amino acids, this seems to be characteristic for Verongida sponges. The observed differences of the amino acid composition confirm that spongin exhibits a certain degree of variability even among the members of the order Verongida.
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Isolierung und Charakterisierung der Chitin-basierten Skelette der marinen Schwämme Aplysina cavernicola und Ianthella basta

Ueberlein, Susanne 26 January 2016 (has links) (PDF)
Die Schwammskelette der Ordnung Verongida zeichnen sich durch das Fehlen mineralischer Komponenten aus. Stattdessen bestehen sie aus Spongin, einem kollagenartigen Protein, und Chitin. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurden die aus solch einem Chitin-Protein-Komplex bestehenden Skelette der Schwammspezies Aplysina cavernicola und Ianthella basta aus der Ordnung Verongida untersucht. Aufgrund ihrer morphologischen Unterschiede wurde für jede Schwammart eine eigene Methode zur Isolierung der Schwammskelette entwickelt. Die isolierten Skelette konnten anschließend mit verschiedenen Methoden wie REM, ATR-FTIR-Spektroskopie und NMR-Spektroskopie charakterisiert werden. Weiterhin wurde eine Methode zur Extraktion und Analyse der in den Skeletten befindlichen Aminosäuren mittels GC-MS entwickelt. Die Untersuchungen zeigten deutlich, dass es sich bei Spongin um ein kollagenartiges und halogeniertes Protein handelt, welches je nach Schwammart Unterschiede in der Aminosäurezusammensetzung aufweist. Darüber hinaus gelang es zum ersten Mal das Chitin aus dem Chitin-Protein-Komplex mittels Phosphorsäure zu entfernen. Aus den gewonnenen Erkenntnissen konnte abschließend ein Modell zum Aufbau des Chitin-Protein-Komplexes in der Schwammspezies Aplysina cavernicola entwickelt werden.
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Determination of the Halogenated Skeleton Constituents of the Marine Demosponge Ianthella basta

Ueberlein, Susanne, Machill, Susanne, Schupp, Peter J., Brunner, Eike 17 July 2017 (has links)
Demosponges of the order Verongida such as Ianthella basta exhibit skeletons containing spongin, a collagenous protein, and chitin. Moreover, Verongida sponges are well known to produce bioactive brominated tyrosine derivatives. We recently demonstrated that brominated compounds do not only occur in the cellular matrix but also in the skeletons of the marine sponges Aplysina cavernicola and I. basta. Further investigations revealed the amino acid composition of the skeletons of A. cavernicola including the presence of several halogenated amino acids. In the present work, we investigated the skeletal amino acid composition of the demosponge I. basta, which belongs to the Ianthellidae family, and compared it with that of A. cavernicola from the Aplysinidae family. Seventeen proteinogenic and five non-proteinogenic amino acids were detected in I. basta. Abundantly occurring amino acids like glycine and hydroxyproline show the similarity of I. basta and A. cavernicola and confirm the collagenous nature of their sponging fibers. We also detected nine halogenated tyrosines as an integral part of I. basta skeletons. Since both sponges contain a broad variety of halogenated amino acids, this seems to be characteristic for Verongida sponges. The observed differences of the amino acid composition confirm that spongin exhibits a certain degree of variability even among the members of the order Verongida.
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Isolierung und Charakterisierung der Chitin-basierten Skelette der marinen Schwämme Aplysina cavernicola und Ianthella basta

Ueberlein, Susanne 07 January 2016 (has links)
Die Schwammskelette der Ordnung Verongida zeichnen sich durch das Fehlen mineralischer Komponenten aus. Stattdessen bestehen sie aus Spongin, einem kollagenartigen Protein, und Chitin. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurden die aus solch einem Chitin-Protein-Komplex bestehenden Skelette der Schwammspezies Aplysina cavernicola und Ianthella basta aus der Ordnung Verongida untersucht. Aufgrund ihrer morphologischen Unterschiede wurde für jede Schwammart eine eigene Methode zur Isolierung der Schwammskelette entwickelt. Die isolierten Skelette konnten anschließend mit verschiedenen Methoden wie REM, ATR-FTIR-Spektroskopie und NMR-Spektroskopie charakterisiert werden. Weiterhin wurde eine Methode zur Extraktion und Analyse der in den Skeletten befindlichen Aminosäuren mittels GC-MS entwickelt. Die Untersuchungen zeigten deutlich, dass es sich bei Spongin um ein kollagenartiges und halogeniertes Protein handelt, welches je nach Schwammart Unterschiede in der Aminosäurezusammensetzung aufweist. Darüber hinaus gelang es zum ersten Mal das Chitin aus dem Chitin-Protein-Komplex mittels Phosphorsäure zu entfernen. Aus den gewonnenen Erkenntnissen konnte abschließend ein Modell zum Aufbau des Chitin-Protein-Komplexes in der Schwammspezies Aplysina cavernicola entwickelt werden.

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