Thèse de doctorat : Sciences de la Vie et de la Terre : Strasbourg 1 : 2008. / Thèse soutenue sur un ensemble de travaux. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 28 p.

Thesis (M.Sc.)--York University, 2006. Graduate Programme in Chemistry. / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 128-131). Also available on the Internet. MODE OF ACCESS via web browser by entering the following URL: http://gateway.proquest.com/openurl?url_ver=Z39.88-2004&res_dat=xri:pqdiss&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:dissertation&rft_dat=xri:pqdiss:MR29561

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La mammite bovine (inflammation des glandes mammaires), est la maladie la plus fréquente chez les vaches laitières et la plus coûteuse pour les producteurs laitiers. Plusieurs microorganismes peuvent causer la mammite mais Staphylococcus aureus en est le plus souvent responsable. En exprimant une panoplie de gènes de virulence, la bactérie est capable d’éviter l’action du système immunitaire. Sa capacité à résister au traitement antibiotique, soit en exprimant des gènes de résistance ou en se localisant à l’intérieur des cellules hôtes, est également documentée. Toutes ses raisons font que S. aureus peut causer des mammites chroniques et que le besoin de trouver de nouvelles stratégies thérapeutiques est bien réel. Beaucoup d’études ont été menées pour trouver de nouvelles molécules ou des vaccins pour traiter cette pathologie. La plupart d’entre elles ont été réalisées in vitro ou dans des modèles murins, lesquels ne représentent pas exactement la réalité d’une infection de glande mammaire de vache laitière. Le présent projet de doctorat a proposé une approche davantage reliée à la réalité de cette infection. Nous avons donc voulu identifier les gènes exprimés par S. aureus durant la mammite bovine afin de mieux orienter la recherche de cibles thérapeutiques. Pour y parvenir, nous avons effectué des infections expérimentales de vaches laitières, développé une méthode d’isolement des bactéries du lait, procédé aux analyses transcriptomiques et identifié des gènes exprimés par la bactérie lors de l’infection. Cette approche n’avait encore jamais été tentée dans le contexte de la mammite bovine à cause des nombreux défis techniques que nous avons relevés. Les gènes de S. aureus identifiés lors du présent projet ont mené à différentes découvertes. D’abord, nous avons pu vérifier l’importance de deux de ces gènes pour la virulence de la bactérie lors de l’infection. Ensuite, c’est cette analyse transcriptomique qui est à la base du développement d’un vaccin dont l’efficacité est en cours d’analyse, et du développement d'une nouvelle classe d’antibiotique qui vise un gène exprimé lors de la mammite. Ces deux dernières percées font chacune l’objet d’un brevet d’invention. Nous sommes donc partis de l’hypoThèse que les gènes exprimés par S. aureus lors de la mammite bovine sont essentiels ou importants pour sa virulence ou sa survie et que ceux-ci représentent de bons candidats au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques. Cette Thèse rapporte précisément un tel constat.

Staphylococcus aureus (S. aureus) is a bacterium commonly found on the skin and associated with minor skin and soft tissue infections. It is possible for S. aureus to infect the bloodstream, which can lead to serious illness and possibly death. Endothelial cells line all blood vessels in the body and serve as the last defense against pathogens attempting to invade the bloodstream. We have found that S. aureus requires a cellular pathway, called the phosphoinositide 3-kinase (PI3K) pathway, to be active in order to invade endothelial cells. PI3K has multiple isoforms and we hypothesize that one isoform, p1 l Oa, is specifically utilized for infection. We have gathered strong evidenceto suggest that p 1 l Oa plays a significant role in the infection process of S. aureus; however more experiments are needed to conclude that our hypothesis is supported. / Department of Biology

Abstract Sepsis is a serious clinical condition that is characterized by a systemic inflammatory response syndrome resulting from a known or suspected infection. The major clinical symptoms involve an abnormal WBC count, elevated body temperature, respiration and pulse rate. Reported cases with high mortality rate range between 13 - 20 million. In order to treat Sepsis, the detection of bacteria in blood culture is extremely crucial. Treating patients with broad spectrum antibiotics is usually related to adverse effects, drug resistance, increased mortality, and high cost. In the past decades, researches had detected that E. coli and S. aureus are the major role players that cause sepsis. These microbes are molecularly tested by methods like MALDI TOF, FISH and Microarrays.   In this analysis, DNA fluorescence in situ hybridization (FISH) assessment for the identification of S. aureus, one of the most frequent blood pathogens, was optimized in the labs of Högskolan i Skövde. As a result, the growth of S. aureus was observed very carefully, optimizing the FISH procedure for gram positive bacteria was done and the sensitivity, stability and specificity of the DNA probe were examined under variant conditions like the continuous decrease in the bacteria cells number and utilizing a mixture of different types of bacteria cells. / Data mining strategies and molecular techniques for microbial detection in severe sepsis

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xiv, 131 leaves : ill. ; 28 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Biochemistry, 1975

Thesis (M.P.H.) -- University of Adelaide, Dept. of Public Health, 1999. / Bibliography: leaves 117-136.

Thesis (Ph.D.) -- University of Adelaide, Department of Biochemistry, 1975.