Nous avons mis au point un nouveau protocole expérimental multi-générationnel permettant d’étudier la plasticité du copépode Eurytemora affinis dans le cadre d’un scénario de changement climatique. Cette espèce cryptique a été capable de se développer à des fortes températures et/ou salinités en montrant des effets de contrôle maternel et trans-générationnels sur ses traits de cycle de vie. Compte tenu de l’importance de la reproduction, nous avons étudié la stratégie reproductive des femelles, des mâles et de leur interaction. Nous avons mis en évidence, la présence de trade-off entre la fécondité et la taille de l’œuf chez le copépode. Nous avons également montré une nette différence entre les populations transatlantiques d’E. affinis. L’analyse détaillée des rôles du mâle et de la femelle dans la reproduction des copépodes a été illustrée pour la population d’E. affinis provenant de la Seine. Nos résultats ont révélé que ; le mâle contribue activement à la reproduction puisqu’il est capable d’identifier les femelles prêtes à s’accoupler, la femelle est capable de s’accoupler avec plusieurs mâles et d’utiliser pour une même portée le matériel génétique de plusieurs pères. Il semble qu’un sex-ratio en faveur des males offre des avantages avérés à la population d’E. affinis de l’estuaire de la Seine. Les résultats de cette thèse confirment le grand potentiel de ce copépode comme modèle biologique et soulignent l’importance d’intégrer la plasticité des organismes vivants et leur capacité d’adaptation aux variations de la température ainsi que d’autres facteurs environnementaux dans le cadre des effets du changement climatique sur les écosystèmes. / We developed a new multigenerational experimental protocol allowing to study the plasticity of the copepod Eurytemora affinis within the framework of a climate change scenario. This cryptic species was capable to develop under high temperatures and/or salinities, showing trans-generational and maternal control effects on its life cycle traits. By considering the importance of the reproduction, we studied the reproductive strategy of females, males and their interaction. We underlined the presence of trade-off between the fecundity and the offspring size in copepods. We also showed a clear difference between the transatlantic populations of E. affinis.The detailed analysis of the respective roles of the male and the female in the reproduction of copepods was illustrated for the population of E. affinis from the Seine. Our results revealed that; the male contributed actively to the reproduction being able to identify females ready to mate; the female was capable of multiple mating and of using the genetic material of several fathers for the same clutch. It seems that a sex-ratio in favor of males offered clear advantages to the population of E. affinis from the Seine estuary.The results of this thesis confirmed the high potential of this copepod as biological model and underlined the importance of integrating the plasticity of the living organisms and their capacity of adaptation to temperature variations or any other environmental factors within the framework of the effects of climate change on the ecosystems.