L’objectif de ce travail de thèse était (i) de quantifier la charge de travail (CT) et son évolution au cours de la saison, et (ii) d’étudier ses effets sur la performance, les qualités physiques, le risque de blessures, les caractéristiques psychologiques et biochimiques de rugbymen à XV professionnels. En premier lieu, nous nous sommes intéressés à la quantification de la demande métabolique lors de matchs officiels de haut niveaux (étude 1). Les principaux résultats de cette étude montrent que l’approche de la puissance métabolique constitue une alternative à l’approche traditionnelle pour quantifier les efforts de course de haute intensité. En second lieu, une étude préliminaire (étude 2) a permis d’étudier les évolutions de CT (GPS & RPE), des qualités physiques et des caractéristiques biochimiques, tout au long d’une saison chez des arrières. Un deuxième protocole expérimental (études 3 & 4) a permis de compléter les résultats de l’étude 2, en analysant notamment l’influence de CT sur l’évolution des caractéristiques psychologiques, du taux de blessures et de la performance en match. Les études 2, 3 et 4 montrent que CT est significativement (p < 0.05) plus élevée pendant la première partie de la saison (présaison et début du championnat). Ces études montrent également que la CT compétitive et le nombre d’impacts sévères (>8G) sont les principaux paramètres de CT influençant les réponses physiologiques des joueurs. Ces paramètres influencent les caractéristiques psychologiques, les marqueurs des dommages musculaires (CK) et le nombre de duels gagnés en compétition. Ces études montrent aussi qu’un volume d’entraînement élevé associé à une faible intensité d’entraînement influencent négativement les performances neuromusculaires (Tests DJ et CMJ). Enfin, l’addition d’entraînements avec contacts et l’accumulation de CT compétitive peut favoriser l’apparition d’un état de fatigue avancée (surcharge non-fonctionnelle), illustrée par une diminution significative (p < 0.05) des ratios T/C et IGF-1/C. / The aim of this thesis was to quantify the workload (WL) and its evolution over the course of a competitive season, as its influence on performance, physical abilities, injury risk, biochemical and psychological characteristics of professional Rugby union (RU) players. Firstly, we were interested in the quantification of metabolic demands during elite RU games. The main results showed that metabolic power approach represents an interesting alternative to traditional approach to quantify the high-intensity running efforts during RU games. Secondly, preliminary study (study 2) allow to quantify changes in WL (GPS & RPE), physical abilities and biochemical characteristics, throughout a season in back players. Another experimental (studies 3 & 4) protocol allow to complete the results of the 2nd study by integrating the analysis of the changes in psychological characteristics, in injury rates and in game performance. The studies 2, 3 and 4 showed that WL was significantly (p < 0.05) higher during the first part of the season. These studies also demonstrated that competitive WL and the number of severe impacts (>8G) are the main WL parameters that most influence the physiological adaptations in elite RU players. These parameters affect the psychological characteristics, markers of muscle damages (CK) et the number of offensive duels won during the games. These studies also showed that a high volume combined to low-intensity of training contribute to decrease neuromuscular performance (CMJ, DJ tests). Finally, the combination of training including contacts and accumulation of competitive WL may contribute to the appearance of overreaching states (or non-functional overreaching), illustrating by significant decrease in T/C and IGF-1/C ratios.

Le diagnostic et le suivi des infections par le VIH, VHB et VHC restent un défi dans les pays à faibles ressources qui sont par ailleurs les plus touchés. Il est urgent de pouvoir disposer d'outils de biologie simples, fiables et peu chers pour le contrôle de ces infections virales. Le défi est immense d'un point de vue clinique et politique de santé. L'objectif de ce travail de recherche effectué dans le cadre de la présente thèse est de développer et valider des stratégies et de nouveaux outils de biologie adaptés au diagnostic et au suivi des hépatites virales et de l'infection VIH dans les pays à ressources limitées. Dans un premier temps, nous avons investigué sur les résultats de sérologie VIH discordants, car en biologie et en pratique clinique, il est important d'établir le statut sérologique réel des personnes dépistées avec des résultats clairs pour une prise de décision adéquate à l'échelle individuelle. Dans ce travail, nous avons trouvé que les résultats discordants par l'algorithme de dépistage des femmes enceintes au Burkina Faso, étaient dans 94% des cas de faux positifs dus au test Determine™ HIV-1/2 et 4% de faux négatifs liés au test Genie II™ HIV-1/HIV-2. En matière de santé publique, les femmes présentant ce type de résultat peuvent être considérées comme séronégatives dans les centres où des investigations supplémentaires ne sont pas possibles, surtout dans les pays comme le Burkina Faso où la prévalence de l'infection est basse avec une faible diversité génétique. Dans un second temps, nous avons focalisé nos travaux sur la faisabilité d'une stratégie de dépistage qui combine la détection des trois infections (VIH, VHB et VHC) sur une seule carte DBS. Dans cette étude pilote, nous avons démontré que le DBS collecté en parallèle au test rapide VIH dans un centre de dépistage volontaire permet d'une part de faire la confirmation du VIH par immunoblot, et d'autre part de compléter par le diagnostic des hépatites B et C par ELISA suivi de western blot et PCR pour la confirmation pour le VHC. Cette stratégie peut servir de modèle pour promouvoir et vulgariser le dépistage des hépatites virales B et C dans les pays à ressources limitées. Le DBS peut servir de contrôle et de confirmation du diagnostic du VIH, VHB et VHC. Par la suite, nous avons évalué la performance de deux tests de 4ème génération immunoluminométriques (Elecsys® HIV Combi PT assay, Roche Diagnostics et Liaison® XL Murex HIV Ab/Ag test, DiaSorin) sur des échantillons séchés sur papier filtre en comparaison au test de diagnostic rapide et aux échantillons de sérum frais prélevés chez les patients en primo-infection VIH. Ces travaux ont clairement montré que les deux tests de 4ème génération réalisés sur papier filtre offrent de bonnes performances dans le diagnostic de la primo-infection par rapport aux tests de diagnostic rapide sur sérum frais. Cette méthode peut être utilisée pour détecter précocement le VIH chez les personnes difficiles à atteindre et les populations vivant dans des zones périphériques des pays à ressources limitées. Enfin, nous avons mis au point une technique de PCR en temps réel de détection et de quantification de l'ADN du VHB. A cet effet, nous sommes partis de deux PCR « maison » ciblant deux régions génomiques différentes (gène X pour la qPCR 1 et gène S pour la qPCR 2) en comparaison à un test commercial de charge virale (Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan HBV Test, version 2.0, Roche Diagnostics). La qPCR 2 avec un seuil de détection à 91 UI/ml (vs 104 UI/ml pour la qPCR 1) a montré une meilleure performance dans la quantification de l'ADN du VHB. Cette qPCR 2 peu chère est aujourd'hui produite sous forme de kit par une start-up appelée OMUNIS. Ce kit en développement fera l'objet d'une évaluation multicentrique en France, en Afrique et en Asie du Sud-Est à travers un réseau de laboratoires sous la promotion de l'ANRS. / Diagnosis and management of hepatitis B, hepatitis C and HIV infections are a real challenge in middle and low-income countries. There is an urgent need for simple, reliable and inexpensive tools to control these infections in high prevalence sittings like Africa and Asia. The challenge is immense in clinical and public health policy hands. The main goal of this research work performed for our PhD is the development and validation of strategies and tools to diagnose and monitor HIV, HBV and HCV infections in resource-constrained countries. At a first step, we investigated the results of HIV discordant results, since it is important to establish the real HIV status of people tested with clear results for appropriate decision-making in biological and clinical practice. This work show that discordant results obtained in the algorithm of HIV screening among pregnant women in Burkina Faso, are false positive results in 94% of cases due to the Determine™ HIV-1/2 immunochromatographic test and false negative results in 4% of cases due to the Genie II ™ HIV-1 / HIV-2 test. In public health practice, women with this type of result can be considered as negative for HIV testing in centers where additional investigations are not possible, especially in countries like Burkina Faso with a low incidence and a low genetic diversity of HIV.In a second step, we focused our work on the feasibility of a screening strategy that detects HIV, HBV and HCV infections into a single card of DBS. In this pilot study, we demonstrated that DBS collected in parallel to HIV rapid testing in a voluntary counseling and testing center allows HIV confirmation using immunoblotting, and an additional testing by diagnosing HBV and HCV using ELISA followed by immunoblotting and PCR for HCV confirmation. This strategy can serve as a model to promote and scale-up the screening of HBV and HCV in resource-limited countries. DBS can be served as control and confirmation of HIV, HBV and HCV diagnosis. Furthermore, we evaluated the performance of two 4th generation chemiluminescent immunoassays (Elecsys HIV Combi PT assay, Roche Diagnostics and Liaison XL Murex HIV Ab/Ag test, DiaSorin) tested on filter paper samples in comparison to rapid diagnostic test and fresh serum samples from patients with acute HIV infection. These studies have clearly shown that the two 4th generation tests performed on filter paper offer good performance in terms of sensitivity for the diagnosis of HIV infection in its early phases compared with rapid diagnostic tests. This approach may be used in combination with HIV rapid tests in hard-to-reach individuals and populations living in remote areas of when an early HIV infection is suspected since rapid tests do not offer appropriate performance in this case.Finally, we developed a real-time PCR for HBV DNA detection and quantification. In this study, we evaluated two in-house PCR targeting two different regions of HBV genome (X gene for qPCR 1 and S gene for qPCR 2) in comparison with a commercial Roche HBV DNA test (Cobas AmpliPrep / Cobas TaqMan HBV Test, version 2.0, Roche Diagnostics) as a gold standard. The qPCR 2 with a low detection limit of 91 IU/ml (vs 104 IU/ml for 1 qPCR) showed a better performance in HBV DNA quantification. This inexpensive qPCR with best performance characteristics is producing by a start-up called OMUNIS. This kit will be evaluated in France, in Africa and in South and East Asia in a research study funded by ANRS (France REcherche Nord & sud Sida-hiv Hépatites).