Le modèle de gestion de la qualité de l'eau SWAT pourra assister les acteurs de l'eau dans la mise en application de politiques de gestion de l'eau à l'échelle du bassin versant au Canada. Cependant, il y a peu d'applications du modèle SWAT sous des conditions climatiques caractéristiques du sud-est du Canada. Un protocole de mise en place du modèle SWAT est proposé. La performance des fonctions hydrologiques du modèle a fait l'objet d'une évaluation en distinguant les saisons hydrologiques hiver et été. Les sources d'incertitude dans les données de calibration pour la saison hivernale et dans la structure du modèle de fonte de SWAT ont fait l'objet d'une analyse détaillée. La capacité des fonctions hydrologiques de SWAT à converger vers un jeu unique de paramètres et à assurer que les voies d'entraînement des indicateurs de la qualité des eaux sont adéquatement modélisées est discutée. / The river basin model SWAT could assist stakeholders in the setting up of integrated watershed management policies in Canada. However, there is a lack of SWAT's applications under climatic conditions characteristic of Southeastern Canada. An implementation protocol of the SWAT model is proposed. The performance of the hydrologic component has been evaluated in distinguishing the hydrologic seasons winter and summer. The sources of uncertainty in the calibration data of the winter season, and in the structure of the SWAT snowmelt algorithm have been the object of a detailed analysis. The capabilities of the SWAT hydrologic component to converge towards a unique parameter set and to guarantee that the flow paths of water quality indicators are correctly modeled is addressed.