La présente étude vise d'une part, à fournir et définir les paramètres de base nécessaires au développement de la lixiviation fongique des métaux et d'autre part, à améliorer sa rentabilité économique par l'utilisation d'une source de substrat économique. Pour ce faire, différents essais en flacons ont été réalisés en laboratoire. En premier lieu, ces essais ont permis de mettre au point une procédure de lixiviation, notamment le choix d'une méthode de lixiviation adaptée à la lixiviation de deux résidus miniers d'origines différentes. En second lieu, le perméat de lactosérum a été sélectionné parmi 7 résidus agroalimentaires comme une nouvelle source de substrat pour remplacer le sucrose habituellement utilisé au laboratoire lors des essais de lixiviation fongique. Par la suite, l'influence de divers paramètres de production des acides organiques (qui sont les agents de lixiviation) et de lixiviation des métaux sur la solubilisation de 6 métaux lourds (Cu, Fe, Mn, Ni, Pb et Zn) a été évaluée. L'influence de la distribution géochimique des métaux a été étudiée en particulier. Les résultats obtenus montrent que la lixiviation fongique offre la possibilité de récupérer à des concentrations commercialement attractives les métaux lourds retenus dans les importantes quantités de résidus miniers rejetés par l'industrie minière. Elle se révèle ainsi comme une biotechnologie prometteuse qui s'intègre au développement durable non seulement en préservant l'environnement et la santé publique des conséquences néfastes de la présence des métaux lourds, mais aussi en permettant la valorisation de ces derniers comme une source secondaire de matières premières, ainsi que celle du perméat de lactosérum comme une source de substrat pour la biosynthèse des acides organiques.