<i>Arabidopsis thaliana</i> trichomes exhibit strong birefringence under polarized light, a characteristic of cell walls containing large amounts of highly ordered cellulose microfibrils. The <i>tbr1</i> mutant of <i>Arabidopsis</i> lacks trichome birefringence and is deficient in secondary cell wall cellulose synthesis (Potikha and Delmer, 1995). The <I>TBR</i> gene was identified by recombinational mapping, candidate gene sequencing and molecular complementation using genomic cosmid clones, as well as a p35S:<I>TBR</i> genomic DNA construct, fully rescuing the mutant phenotype in both cases. The only mutant allele available (<i>tbr-1</i>) carries a substitution (G to E) in a conserved aminoacid domain of the protein. <br><br> <I>TBR</i> gene structure was proved to have a longer size than the one found to be annotated at the time of identification in the data-base. A full cDNA clone containing the full transcript was available and also complementation experiments using different gene fragments (annotated and suggested) leaded to the result that TBR gene is indeed, longer. <I>TBR</i> encodes a novel plant-specific protein with predicted plasma membrane localization, therefore being consistent with idea that is required for-, or is a novel component of a functional cellulose synthase complex. <I>TBR</i> is part of an Arabidopsis gene/protein family, (TBL-trichome birefringence like) which, depending on homology, comprises up to 20 members, none of which has a biological or biochemical function attributed.<br><br> T-DNA insertion lines in <I>TBR</i> gene and two close homologues have been screened by PCR, but no homozygous were found and no trichomes phenotype was identified. Promoter-GUS lines were produced for <I>TBR</i>, as well as for its two closest homologues (one being a segmentally duplicated gene on chromosome III), using 1.6-2 kb of promoter sequence upstream of the annotated start codons. The <I>TBR</i> promoter was the only one of the three that yielded trichome expression, this probably explaining the phenotype of the <i>TBR</i> mutant. Moreover, <I>TBR</i> is expressed in leaves, in growing lateral roots, and in vascular tissues of young <i>Arabidopsis</i> seedlings and plantlets. Later on, the expression appears in inflorescens, stems, flowers and green siliques. This expression pattern is largely overlapping with those of the two analyzed homologues and it corresponds with data of RT-PCR expression profiling performed for <I>TBR</i> and the two analyzed homologues in different tissues, at different developmental stages. Biochemical analysis of cell wall (leaves and trichomes), as GC and MALDI-TOF, were performed, but revealed no major differences between tbr1 and wild type plants. Scanning electron microscopy analysis and cell wall polysaccharides antibody labeling showed a clear difference in the trichomes cell wall structure between mutant plant and wild type. / Genetische Kartierung und molekulare Charakterisierung der tbr-Mutante in <i>Arabidopsis thaliana</i>. <br><br> Arabidopsis Trichome zeigen eine starke Doppelbrechung unter polarisiertem Licht, ein charakteristisches Merkmal der Sekundärzellwand, die aus großen Mengen parallel angeordneten Zellulose-Mikrofibrillen besteht. In der Arabidopsis tbr-Mutante ist die Synthese der Sekundärzellwand fehlerhaft. Die Trichome der tbr-Mutante zeigen unter polarisiertem Licht den Doppelbrechungseffekt nicht (Potikha and Delmer, 1995). <br><br> TBR ist ein pflanzenspezifisches Protein, das in der Plasmamembran lokalisiert ist. Diese Tatsache lässt vermuten, dass TBR eine Rolle bei der Zellulose-Synthese spielt oder Teil des Zellulose-Synthese Komplexes ist. Die TBR Genfamilie besteht aus 20 Genen, deren biologische oder biochemische Funktion nicht bekannt ist.<br><br> Das TBR Gen wurde durch „recombinational mapping“ und Sequenzierung identifiziert. Die molekulare Komplementation erfolgte unter Verwendung von Cosmidklonen und einem p35S:TBR genomischen DNA-Konstrukt und konnte den Wildtypphänotyp wieder vollständig herstellen. Die tbr-1 Mutante trägt einen Basenaustausch (G nach A) in einer hochkonservierten Aminosäuresequenz im Protein. In einer Arabidopsis T-DNA Linie mit Insertion in einem Exon konnten in einem PCR-Screen nur heterozygote Pflanzen identifiziert werden. Diese zeigten alle im polarisierten Licht den Doppelbrechungseffekt nicht. Ein möglicher Hinweis für den Phänotyp der tbr-Mutante könnte die Expressionsanalyse durch ein Promotor-GUS Konstrukt sein. Hierfür wurde eine 1,6 kb Sequenz, die upstream des TBR Startcodons liegt verwendet. Es zeigte sich, dass die Expression in den sowohl in den Trichomen zu finden war, als auch in Blättern, der Seitenwurzel und in vaskulären Gewebe junger Arabidopsis Keimlinge. In späteren Entwicklungsstadien ist eine Expression in den Stämmen, Blüten und grünen Schoten sichtbar. Diese Ergebnisse konnten durch RT-PCR Expressionsprofile und anhand der AtGenExpress Daten verifiziert werden. Zellwandanalysen durch GC und MALDI-TOF der Blätter und Trichome zeigten keine signifikanten Unterschiede zwischen der tbr-Mutante und Wildtyppflanzen. In den Pektinen der primären Zellwand konnten Unterschiede durch Immunolabeln der Zellwände festgestellt werden. <br><br> Lokalisationsanalysen wurden mit Hilfe von C- und N-terminalen GFP-Konstrukten durchgeführt. Es konnte kein Signal detektiert werden. Mit Hilfe der Konstrukte konnte jedoch der Wildtyp Phänotyp wieder hergestellt werden. <br> Es konnte also gezeigt werden, dass durch die genetische Kartierung und molekulare Charakterisierung des TBR Gens, ein an der Synthese der Zellulose beteiligtes Gen gefunden wurde.

Flour-etyl-L-tyrosin positronemissionstomografi (FET-PET) undersökning är en undersökningsmetod som har hög sensitivitet och specificitet vid diagnostisering av bland annat tumör och tumörrecidiv. För att bestämma FET-upptaget i tumören kan tumör till bakgrundsförhållande (TBR) beräknas. TBR är förhållandet mellan upptag i tumör och upptaget i grå och vit substans. Syftet med studien var att kartlägga hur olika rekonstruktioner påverkar värdet av TBR vid FET-PET undersökningar genom att studera TBR vid olika tidsintervall och sex olika rekonstruktioner. Vid genomförande av studien inkluderades 15 patienter med FET-upptag som genomgått FET-PET undersökning i Klinisk Neurofysiologi på Skånes Universitetssjukhus (SUS) i Lund. Hela undersökningstiden 30 minuter, sista 20 minuter samt sista 15 minuter testades för att se om dagens bildtagningsprotokoll går att optimera. Rekonstruktionsmetoderna QClear (QC) och Ordered Subset Expectation Maximization (OSEM) användes i studien. Vid beräkning av TBR-värden användes standardiserade upptagsvärden (SUV). För att beräkna TBR ritades region av intresse (ROI), ROIthreshold samt ROIsfär, över tumörområdet samt i frisk grå och vit substans i den kontralaterala hemisfären, för att bestämma FET-upptaget i förhållande till varandra. TBR beräknades utifrån maximala (SUVmax) och medelvärdet (SUVmedel) i ROI och benämns som TBRmax och TBRmedel. Resultatet av studien visade att ett lägre -värde för QC erhåller högre TBR-värden. TBR-värdena för rekonstruktionsmetoden OSEM låg mellan TBR-värdena för QC-rekonstruktionerna. Medelvärdet av den procentuella skillnaden, av alla patienter, mellan TBR-värden och de olika tiderna, för respektive rekonstruktionsmetod låg mellan 5-10 %. Detta indikerar att mängden injicerad aktivitet till patienten alternativt undersökningstiden kan minskas. Den maximala procentuella skillnaden av TBRmax och TBRmedel för ROIthreshold respektive ROIsfär mellan de olika rekonstruktionerna för alla tre tiderna och alla 15 patienterna, låg mellan 25-40 %. Medelvärdet av den procentuella skillnaden av TBRmax och TBRmedel för ROIthreshold respektive ROIsfär mellan de olika rekonstruktionerna för alla tre tiderna och alla 15 patienterna, låg mellan 15-25 %. Slutsatsen för denna studie är att den kvantitativa bedömningen av TBR-värdet varierar beroende på använd rekonstruktionsmetod. / Flourethyl-L-tyrosine positron emission tomography (FET-PET) examination is an examination method that has high sensitivity and specificity in diagnosing tumors and tumor recurrence. Tumor-to-background-ratio (TBR) could be calculated to determine FET-uptake in the tumor. TBR is the ratio between uptake in tumor and uptake in gray and white matter. The purpose of the study was to identify how different reconstructions affect the value of TBR in FET-PET examinations by studying the TBR-value at different time intervals and six different reconstructions algorithms. In the study, 15 patients were included, all with FET-uptake and all had performed a FET-PET examination at the department of Clinical Neurophysiology at Skåne University Hospital (SUS) in Lund. The entire examination time 30 minutes, the last 20 minutes and the last 15 minutes were tested to evaluate if the imaging protocol used today can be optimized. The reconstruction methods used in the study were QClear (QC) and Ordered Subset Expectation Maximization (OSEM). Standardized uptake values (SUV) were used during the calculation of TBR-values. To calculate TBR, the region of interest (ROI), ROIthreshold and ROIsphere were drawn. ROIthreshold and ROIsphere were drawn over the tumor area and in grey- and white matter in the contralateral hemisphere, to determine FET-uptake in relation to each other. The TBR-value was calculated based on maximum- (SUVmax) and mean values (SUVmedel) in ROI and is referred as TBRmax and TBRmean. The results of the study showed that a lower -value for QC obtains higher TBR-values. The TBR-values for the OSEM reconstruction method were between the TBR-values of the QC reconstruction methods. The mean value of the percentage difference, of all patients, between TBR-values and the different times, for each reconstruction method were between 5-10 %. These results indicate that the amount of injected activity to the patient or the examination time can be reduced. The maximum difference in percentage of TBRmax and TBRmean for ROIthreshold respective ROIsphere between the reconstructions for the tree times and all the 15 patients, were between 25-40 %. The mean percentage difference of TBRmax and TBRmean for ROIthreshold respective ROIsphere between the reconstructions for the tree times and all the 15 patients, were between 15-25 %. The conclusion of this study is that the TBR-value will vary with different reconstruction methods.