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Detecção e classificação de nódulos de câncer de pulmão para diagnóstico assistido por computador

ALMEIDA, Raphael Lima Nobre de 07 March 2016 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-08-30T12:16:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação - Raphael Lima Nobre de Almeida.pdf: 3877614 bytes, checksum: fb5c13466242f36f8e80a7bfdbe436ab (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-30T12:16:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertação - Raphael Lima Nobre de Almeida.pdf: 3877614 bytes, checksum: fb5c13466242f36f8e80a7bfdbe436ab (MD5) Previous issue date: 2016-03-07 / O câncer de pulmão tem se mostrado o mais agressivo e mortal dentre os tipos de câncer existentes. Uma das principais formas de combatê-lo eficientemente é através do diagnóstico precoce, porém, devido ao alto número de exames de tomografia analisados, vários casos tendem a passar despercebidos. Uma das maneiras de amenizar o problema é o uso de CAD para servir como segunda opinião no momento do diagnóstico. Esse trabalho apresenta um novo sistema CAD, tendo como resultado a indicação de nódulos presentes em exames de tomografia computadorizada do tórax de pacientes. O sistema proposto se baseia em propriedades matemáticas extraídas das regiões candidatas para determinar se elas são nódulos ou não, e a classificação é realizada usando um paralelo entre classificadores baseados em aprendizagem supervisionada e não-supervisionada. Foram estudados vários métodos CAD para definição de uma estrutura de processo automática, em todas as etapas, que primeiro realiza a segmentação da imagem do pulmão a partir de exames de tomografia computadorizada, depois extrai ROI contendo áreas com potencial presença de nódulos, e depois realiza a classificação das ROIs entre áreas com Nódulos e Não-nódulos. Uma base de dados pública de imagens de exames de pacientes LIDC, internacionalmente usada na concepção e testes de sistemas CAD, foi empregada. SOM e SVM foram investigados como classificadores. Como resultado, foram obtidos valores acima de 85% de acurácia, 88% de sensibilidade, 86% F-measure e 1,59 FP/Slice para o SVM e valores acima de 81% de acurácia e 86% de sensibilidade, 82% F-measure e 2,05 FP/Slice para o SOM, onde o FP/Slice significa a média de falsos positivos gerados por imagem. O sistema proposto apresentou resultados superiores em alguns aspectos quando comparados a metodos anteriores e ligeiramente inferior quando comparado com um sistema CAD de saída semelhante, mas que realiza a segmentação manual das regiões de interesse. A partir dos resultados, foi possível ratificar a viabilidade de sistemas CAD com um novo sistema para o diagnóstico de nódulos de câncer de pulmão. / Lung cancer has demonstrated to be the most aggressive and mortal among all kinds of cancer. One of the main manners to efficiently defeat it is the early diagnostic, although due the high number of exams of computed tomography analyzed by the radiologists, they tend to let scape some true cases. A suitable way to diminish this problem is using CAD systems to be used as a second opinion during diagnostic task. Therefore, this work presents a new CAD system , showing as result the indication of the present nodules in thoracic computed tomography exams. The proposed system is based on mathematical properties extracted from Região de Interesse (Region of Interest) (ROI)s to define if they are nodules or not, the classification is accomplished using a parallel between supervised and unsupervised learning techniques.It was studied a gamut of Sistemas para Diagnóstico Assistido por Computador (Computer Aided Diagnosis) (CAD) methods to determine a struct of process, and a base of comparison between the methods. The chosen database was (Lung Image Database Consortium) (LIDC), because it is a public base, internationally used and has diagnostic to each ROI. Mapa Auto-organizável de Kohonen (Self-Organizing Map) (SOM) and Máquina de Vetor de Suporte (Support Vector Machine) (SVM) was used as classifiers, to trace a study of results among them.As result, SVM achieved more than 85% of accuracy, 86% F-measure, 88% of sensibility and 1,59 of FP/Slice. About SOM, the best parametric configuration resulted in more than 81% of accuracy, 85% of sensibility, 82% F-measure and 2,05 of FP/Slice. Thus, it was possible to deduce that the proposed system presents better score when compared with equivalents methods, and lightly worse when compared with a CAD that has ROIs segmented manually. Based on gathered results, it was possible to ratify the importance and the possibility of CAD applications, as well as presents a new system able to perform equivalent task.
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Desenvolvimento de uma ferramenta para automatizar redução de artefato metálico em imagens de tomografias computadorizadas

Paulino, José Alberto Souza 08 May 2017 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-10-23T13:03:47Z No. of bitstreams: 1 PDF - José Alberto Souza Paulino.pdf: 32306126 bytes, checksum: d8a3a4c1c537e36b743590e029308f8c (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-10-26T16:55:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - José Alberto Souza Paulino.pdf: 32306126 bytes, checksum: d8a3a4c1c537e36b743590e029308f8c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T16:55:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - José Alberto Souza Paulino.pdf: 32306126 bytes, checksum: d8a3a4c1c537e36b743590e029308f8c (MD5) Previous issue date: 2017-05-08 / This research proposes to evaluate and implement a solution for metal artifact reduc- tion in computed tomography, this one aiming to meet a demand from the prototyping laboratory of the Núcleo de Tecnologias Estratégicas em Saúde (Nutes) da Univer- sidade Estadual da Paraíba, where impressions of biomodels are made for surgical planning. The CT affected by metal artifacts need to be corrected prior to the printing process, this manual intervention implies excessive delay for delivery of the biomodels. The development of the proposed solution is based on the sinogram correction method which according to Mouton et al (2013) and Gjesteby (2016) is the most utilized method for reducing metal artifacts and makes uses of linear interpolation to correction the cor- rupted data. In order to validate the preference for linear interpolation in the state of the art, others interpolative techniques were implemented and evaluated; Fist through simulations and then by a form for qualitative evaluation, upon which statistical tests were applied. The results obtained confirm the use of interpolation as the best option for the reconstruction of data corrupted by metallic artifacts. / Esta pesquisa se propõe a avaliar e implementar uma solução para redução de artefatos metálicos em tomografias computadorizadas, solução esta que visa atender uma demanda do laboratório de prototipagem do Núcleo de Tecnologias Estratégicas em Saúde (Nutes) da Universidade Estadual da Paraíba, onde são realizadas impressões de biomodelos para planejamentos cirúrgicos. As tomografias afetadas por artefatos metálicos necessitam de correção antes do processo de impressão, esta intervenção realizada de forma manual implica em demora excessiva para entrega dos biomodelos. O desenvolvimento da solução proposta baseia-se no método de correção de sinograma que, de acordo com Mouton et al (2013) e Gjesteby (2016), é o método mais difundido para redução de artefatos metálicos e faz uso da técnica de interpolação linear para correção dos dados corrompidos. Objetivando validar a preferência pelo uso da interpolação linear no estado da arte, foram implementadas outras técnicas interpolativas as quais foram submetidas a avaliação; Primeiro por meio de simulações e depois via fomulário para avaliação qualitativa, na qual foram aplicados testes estatísticos. Os resultados obtidos ratificam o uso da interpolação linear como melhor opção para reconstrução de dados corrompidos pelos artefatos metálicos.

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