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High performance trace replay event simulation of parallel programs behavior / Ferramenta de alto desempenho para análise de comportamento de programas paralelos baseada em rastos de execução

Korndorfer, Jonas Henrique Muller January 2016 (has links)
Sistemas modernos de alto desempenho compreendem milhares a milhões de unidades de processamento. O desenvolvimento de uma aplicação paralela escalável para tais sistemas depende de um mapeamento preciso da utilização recursos disponíveis. A identificação de recursos não utilizados e os gargalos de processamento requere uma boa análise desempenho. A observação de rastros de execução é uma das técnicas mais úteis para esse fim. Infelizmente, o rastreamento muitas vezes produz grandes arquivos de rastro, atingindo facilmente gigabytes de dados brutos. Portanto ferramentas para análise de desempenho baseadas em rastros precisam processar esses dados para uma forma legível e serem eficientes a fim de permitirem uma análise rápida e útil. A maioria das ferramentas existentes, tais como Vampir, Scalasca e TAU, focam no processamento de formatos de rastro com semântica associada, geralmente definidos para lidar com programas desenvolvidos com bibliotecas populares como OpenMP, MPI e CUDA. No entanto, nem todas aplicações paralelas utilizam essas bibliotecas e assim, algumas vezes, essas ferramentas podem não ser úteis. Felizmente existem outras ferramentas que apresentam uma abordagem mais dinâmica, utilizando um formato de arquivo de rastro aberto e sem semântica específica. Algumas dessas ferramentas são Paraver, Pajé e PajeNG. Por outro lado, ser genérico tem custo e assim tais ferramentas frequentemente apresentam baixo desempenho para o processamento de grandes rastros. O objetivo deste trabalho é apresentar otimizações feitas para o conjunto de ferramentas PajeNG. São apresentados o desenvolvimento de um estratégia de paralelização para o PajeNG e uma análise de desempenho para demonstrar nossos ganhos. O PajeNG original funciona sequencialmente, processando um único arquivo de rastro que contém todos os dados do programa rastreado. Desta forma, a escalabilidade da ferramenta fica muito limitada pela leitura dos dados. Nossa estratégia divide o arquivo em pedaços permitindo seu processamento em paralelo. O método desenvolvido para separar os rastros permite que cada pedaço execute em um fluxo de execução separado. Nossos experimentos foram executados em máquinas com acesso não uniforme à memória (NUMA).Aanálise de desempenho desenvolvida considera vários aspectos como localidade das threads, o número de fluxos, tipo de disco e também comparações entre os nós NUMA. Os resultados obtidos são muito promissores, escalando o PajeNG cerca de oito a onze vezes, dependendo da máquina. / Modern high performance systems comprise thousands to millions of processing units. The development of a scalable parallel application for such systems depends on an accurate mapping of application processes on top of available resources. The identification of unused resources and potential processing bottlenecks requires good performance analysis. The trace-based observation of a parallel program execution is one of the most helpful techniques for such purpose. Unfortunately, tracing often produces large trace files, easily reaching the order of gigabytes of raw data. Therefore tracebased performance analysis tools have to process such data to a human readable way and also should be efficient to allow an useful analysis. Most of the existing tools such as Vampir, Scalasca, TAU have focus on the processing of trace formats with a fixed and well-defined semantic. The corresponding file format are usually proposed to handle applications developed using popular libraries like OpenMP, MPI, and CUDA. However, not all parallel applications use such libraries and so, sometimes, these tools cannot be useful. Fortunately, there are other tools that present a more dynamic approach by using an open trace file format without specific semantic. Some of these tools are the Paraver, Pajé and PajeNG. However the fact of being generic comes with a cost. These tools very frequently present low performance for the processing of large traces. The objective of this work is to present performance optimizations made in the PajeNG tool-set. This comprises the development of a parallelization strategy and a performance analysis to set our gains. The original PajeNG works sequentially by processing a single trace file with all data from the observed application. This way, the scalability of the tool is very limited by the reading of the trace file. Our strategy splits such file to process several pieces in parallel. The created method to split the traces allows the processing of each piece in each thread. The experiments were executed in non-uniform memory access (NUMA) machines. The performance analysis considers several aspects like threads locality, number of flows, disk type and also comparisons between the NUMA nodes. The obtained results are very promising, scaling up the PajeNG about eight to eleven times depending on the machine.
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High performance trace replay event simulation of parallel programs behavior / Ferramenta de alto desempenho para análise de comportamento de programas paralelos baseada em rastos de execução

Korndorfer, Jonas Henrique Muller January 2016 (has links)
Sistemas modernos de alto desempenho compreendem milhares a milhões de unidades de processamento. O desenvolvimento de uma aplicação paralela escalável para tais sistemas depende de um mapeamento preciso da utilização recursos disponíveis. A identificação de recursos não utilizados e os gargalos de processamento requere uma boa análise desempenho. A observação de rastros de execução é uma das técnicas mais úteis para esse fim. Infelizmente, o rastreamento muitas vezes produz grandes arquivos de rastro, atingindo facilmente gigabytes de dados brutos. Portanto ferramentas para análise de desempenho baseadas em rastros precisam processar esses dados para uma forma legível e serem eficientes a fim de permitirem uma análise rápida e útil. A maioria das ferramentas existentes, tais como Vampir, Scalasca e TAU, focam no processamento de formatos de rastro com semântica associada, geralmente definidos para lidar com programas desenvolvidos com bibliotecas populares como OpenMP, MPI e CUDA. No entanto, nem todas aplicações paralelas utilizam essas bibliotecas e assim, algumas vezes, essas ferramentas podem não ser úteis. Felizmente existem outras ferramentas que apresentam uma abordagem mais dinâmica, utilizando um formato de arquivo de rastro aberto e sem semântica específica. Algumas dessas ferramentas são Paraver, Pajé e PajeNG. Por outro lado, ser genérico tem custo e assim tais ferramentas frequentemente apresentam baixo desempenho para o processamento de grandes rastros. O objetivo deste trabalho é apresentar otimizações feitas para o conjunto de ferramentas PajeNG. São apresentados o desenvolvimento de um estratégia de paralelização para o PajeNG e uma análise de desempenho para demonstrar nossos ganhos. O PajeNG original funciona sequencialmente, processando um único arquivo de rastro que contém todos os dados do programa rastreado. Desta forma, a escalabilidade da ferramenta fica muito limitada pela leitura dos dados. Nossa estratégia divide o arquivo em pedaços permitindo seu processamento em paralelo. O método desenvolvido para separar os rastros permite que cada pedaço execute em um fluxo de execução separado. Nossos experimentos foram executados em máquinas com acesso não uniforme à memória (NUMA).Aanálise de desempenho desenvolvida considera vários aspectos como localidade das threads, o número de fluxos, tipo de disco e também comparações entre os nós NUMA. Os resultados obtidos são muito promissores, escalando o PajeNG cerca de oito a onze vezes, dependendo da máquina. / Modern high performance systems comprise thousands to millions of processing units. The development of a scalable parallel application for such systems depends on an accurate mapping of application processes on top of available resources. The identification of unused resources and potential processing bottlenecks requires good performance analysis. The trace-based observation of a parallel program execution is one of the most helpful techniques for such purpose. Unfortunately, tracing often produces large trace files, easily reaching the order of gigabytes of raw data. Therefore tracebased performance analysis tools have to process such data to a human readable way and also should be efficient to allow an useful analysis. Most of the existing tools such as Vampir, Scalasca, TAU have focus on the processing of trace formats with a fixed and well-defined semantic. The corresponding file format are usually proposed to handle applications developed using popular libraries like OpenMP, MPI, and CUDA. However, not all parallel applications use such libraries and so, sometimes, these tools cannot be useful. Fortunately, there are other tools that present a more dynamic approach by using an open trace file format without specific semantic. Some of these tools are the Paraver, Pajé and PajeNG. However the fact of being generic comes with a cost. These tools very frequently present low performance for the processing of large traces. The objective of this work is to present performance optimizations made in the PajeNG tool-set. This comprises the development of a parallelization strategy and a performance analysis to set our gains. The original PajeNG works sequentially by processing a single trace file with all data from the observed application. This way, the scalability of the tool is very limited by the reading of the trace file. Our strategy splits such file to process several pieces in parallel. The created method to split the traces allows the processing of each piece in each thread. The experiments were executed in non-uniform memory access (NUMA) machines. The performance analysis considers several aspects like threads locality, number of flows, disk type and also comparisons between the NUMA nodes. The obtained results are very promising, scaling up the PajeNG about eight to eleven times depending on the machine.
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High performance trace replay event simulation of parallel programs behavior / Ferramenta de alto desempenho para análise de comportamento de programas paralelos baseada em rastos de execução

Korndorfer, Jonas Henrique Muller January 2016 (has links)
Sistemas modernos de alto desempenho compreendem milhares a milhões de unidades de processamento. O desenvolvimento de uma aplicação paralela escalável para tais sistemas depende de um mapeamento preciso da utilização recursos disponíveis. A identificação de recursos não utilizados e os gargalos de processamento requere uma boa análise desempenho. A observação de rastros de execução é uma das técnicas mais úteis para esse fim. Infelizmente, o rastreamento muitas vezes produz grandes arquivos de rastro, atingindo facilmente gigabytes de dados brutos. Portanto ferramentas para análise de desempenho baseadas em rastros precisam processar esses dados para uma forma legível e serem eficientes a fim de permitirem uma análise rápida e útil. A maioria das ferramentas existentes, tais como Vampir, Scalasca e TAU, focam no processamento de formatos de rastro com semântica associada, geralmente definidos para lidar com programas desenvolvidos com bibliotecas populares como OpenMP, MPI e CUDA. No entanto, nem todas aplicações paralelas utilizam essas bibliotecas e assim, algumas vezes, essas ferramentas podem não ser úteis. Felizmente existem outras ferramentas que apresentam uma abordagem mais dinâmica, utilizando um formato de arquivo de rastro aberto e sem semântica específica. Algumas dessas ferramentas são Paraver, Pajé e PajeNG. Por outro lado, ser genérico tem custo e assim tais ferramentas frequentemente apresentam baixo desempenho para o processamento de grandes rastros. O objetivo deste trabalho é apresentar otimizações feitas para o conjunto de ferramentas PajeNG. São apresentados o desenvolvimento de um estratégia de paralelização para o PajeNG e uma análise de desempenho para demonstrar nossos ganhos. O PajeNG original funciona sequencialmente, processando um único arquivo de rastro que contém todos os dados do programa rastreado. Desta forma, a escalabilidade da ferramenta fica muito limitada pela leitura dos dados. Nossa estratégia divide o arquivo em pedaços permitindo seu processamento em paralelo. O método desenvolvido para separar os rastros permite que cada pedaço execute em um fluxo de execução separado. Nossos experimentos foram executados em máquinas com acesso não uniforme à memória (NUMA).Aanálise de desempenho desenvolvida considera vários aspectos como localidade das threads, o número de fluxos, tipo de disco e também comparações entre os nós NUMA. Os resultados obtidos são muito promissores, escalando o PajeNG cerca de oito a onze vezes, dependendo da máquina. / Modern high performance systems comprise thousands to millions of processing units. The development of a scalable parallel application for such systems depends on an accurate mapping of application processes on top of available resources. The identification of unused resources and potential processing bottlenecks requires good performance analysis. The trace-based observation of a parallel program execution is one of the most helpful techniques for such purpose. Unfortunately, tracing often produces large trace files, easily reaching the order of gigabytes of raw data. Therefore tracebased performance analysis tools have to process such data to a human readable way and also should be efficient to allow an useful analysis. Most of the existing tools such as Vampir, Scalasca, TAU have focus on the processing of trace formats with a fixed and well-defined semantic. The corresponding file format are usually proposed to handle applications developed using popular libraries like OpenMP, MPI, and CUDA. However, not all parallel applications use such libraries and so, sometimes, these tools cannot be useful. Fortunately, there are other tools that present a more dynamic approach by using an open trace file format without specific semantic. Some of these tools are the Paraver, Pajé and PajeNG. However the fact of being generic comes with a cost. These tools very frequently present low performance for the processing of large traces. The objective of this work is to present performance optimizations made in the PajeNG tool-set. This comprises the development of a parallelization strategy and a performance analysis to set our gains. The original PajeNG works sequentially by processing a single trace file with all data from the observed application. This way, the scalability of the tool is very limited by the reading of the trace file. Our strategy splits such file to process several pieces in parallel. The created method to split the traces allows the processing of each piece in each thread. The experiments were executed in non-uniform memory access (NUMA) machines. The performance analysis considers several aspects like threads locality, number of flows, disk type and also comparisons between the NUMA nodes. The obtained results are very promising, scaling up the PajeNG about eight to eleven times depending on the machine.
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Enhancing storage performance in virtualized environments: a pro-active approach

Sivathanu, Sankaran 17 May 2011 (has links)
Efficient storage and retrieval of data is critical in today's computing environments and storage systems need to keep up with the pace of evolution of other system components like CPU, memory etc., for building an overall efficient system. With virtualization becoming pervasive in enterprise and cloud-based infrastructures, it becomes vital to build I/O systems that better account for the changes in scenario in virtualized systems. However, the evolution of storage systems have been limited significantly due to adherence to legacy interface standards between the operating system and storage subsystem. Even though storage systems have become more powerful in the recent times hosting large processors and memory, thin interface to file system leads to wastage of vital information contained in the storage system from being used by higher layers. Virtualization compounds this problem with addition of new indirection layers that makes underlying storage systems even more opaque to the operating system. This dissertation addresses the problem of inefficient use of disk information by identifying storage-level opportunities and developing pro-active techniques to storage management. We present a new class of storage systems called pro-active storage systems (PaSS), which in addition to being compatible with existing I/O interface, exerts a limit degree of control over the file system policies by leveraging it's internal information. In this dissertation, we present our PaSS framework that includes two new I/O interfaces called push and pull, both in the context of traditional systems and virtualized systems. We demonstrate the usefulness of our PaSS framework by a series of case studies that exploit the information available in underlying storage system layer, for overall improvement in IO performance. We also built a framework to evaluate performance and energy of modern storage systems by implementing a novel I/O trace replay tool and an analytical model for measuring performance and energy of complex storage systems. We believe that our PaSS framework and the suite of evaluation tools helps in better understanding of modern storage system behavior and thereby implement efficient policies in the higher layers for better performance, data reliability and energy efficiency by making use of the new interfaces in our framework.

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