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Impact des pauses transcriptionnelles sur le repliement des riborégulateurs

Chauvier, Adrien January 2017 (has links)
Pour s’adaptater à l’environnement et répondre aux besoins énergétiques, tous les organismes doivent pouvoir contrôler l’expression de certains gènes. La trancription constitue le premier échelon de cette régulation en déterminant le niveau d’ARNm produit au cours du temps. Chez les procaryotes, une seule ARNp est responsable de la synthèse de l’ensemble des ARN de la cellule et celle-ci est soumise à différents types de régulation. Ce contrôle peut s’effectuer à tous les niveaux par des processus faisant intervenir bon nombre de facteurs externes ou intrinsèques à la transcription comme les pauses de l’ARNp. Les riborégulateurs sont des ARN structurés majoritairement retrouvés dans la région 5’ non traduite des ARNm bactériens qui vont réguler l’expression du gène situé en aval. Suite à la liaison d’un métabolite particulier, appelé ligand, le riborégulateur change de conformation induisant une réponse directe qui déterminera si un gène est exprimé ou non. Au cours de mes travaux j’ai établi le lien qu’il existait entre les pauses de l’ARNp au cours de la transcription et la structure des riborégulateurs. En prenant pour modèles deux riborégulateurs liant le TPP, j’ai identifié une conformation des riborégulateurs qui est réfractaire à la liaison du ligand. Cette structure appelée «Anti-P1» se forme lorsque l’ARNp pause à la fin du riborégulateur, ce qui détermine une fenêtre de liaison cotranscriptionnelle du ligand.

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