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Des petits ARN non codants dérivant d'ARN de transfert (tRF) ont été identifiés dans tous les domaines de la vie, et de plus en plus de fonctions importantes leur sont attribuées chez de nombreux organismes. Dans ce travail mené sur la plante modèle Arabidopsis, nous avons d’abord montré que la population en tRF varie en fonction des tissus et des conditions de stress. Concernant leur biogenèse, les endoribonucléases responsables du clivage des ARNt ont été identifiées, il s'agit des RNases T2, RNS1, 2 et 3. Afin de réaliser une étude structure/fonction, une approche d’expression en système de levure a été initiée pour permettre l’obtention de quantité suffisante de RNS1 purifiée. L’étude des fonctions des tRF montre que certains d’entre eux sont associés à AGO1, qu'ils semblent cibler entre-autres des éléments transposables et qu’ils pourraient avoir une localisation nucléaire. Enfin, deux tRF, le tRF-5D (Ala) et le tRF-5D (Asn) inhibent efficacement la traduction in vitro. Une association de tRF-5D (Ala) aux polyribosomes de plantules d'Arabidopsis a pu être visualisée, suggérant que certains tRF puissent agir en tant que régulateur global de la traduction. / Small non-coding RNAs derived from transfer RNAs (tRFs) have been identified in all domains of life, and more and more important functions are attributed to them in many organisms. In this work on the model plant Arabidopsis, we first showed that the tRF population varies according to tissues and stress conditions. With regard to their biogenesis, the endoribonucleases responsible for tRNA cleavage were identified, it is the RNases T2, RNS1, 2 and 3. In order to carry out a structure / function analysis, heterologous expression in yeast has been developed with the hope to get sufficient amount of purified RNS1. The question of tRF functions has also been studied. It has been shown that some tRFs are associated with AGO1, that they often seem to target transposable elements and could have a nuclear localization. Finally, the study of the involvement of the tRFs in the regulation of translation was tackled. Two tRFs, tRF-5D (Ala) and tRF-5D (Asn) efficiently inhibit translation in vitro. An association of tRF-5D (Ala) with polyribosomes of Arabidopsis seedlings could be visualized suggesting that some plant tRFs could as global regulator of the translation process.

SUMMARY: Cancers represent one of the main causes of death worldwide. Together with surgery and radiotherapy, chemotherapy constitutes a main therapeutic tool in cancer treatment. However, combat remains challenging because of the intrinsic and/ or acquired resistance mechanisms displayed by cancers to these agents. In order to maintain their continuous growth, multiplication and dissemination, cancer cells display a number of biological hallmarks. Growing evidence of the remarkable association of the protein synthesis process with the onset and progression of cancer has led to extensive revision and research on the role of translation in this disease as well as its potential in therapy. Initiation of translation is especially dysregulated in cancer. Thus, strategies targeting different translation steps, ranging from upstream inhibitors - like mTOR inhibitors - to direct inhibition of specific translation initiation factors, represent potential and selective recent alternatives to conventional chemotherapies. In this work, we have investigated the antiproliferative effects of the previously synthetized harmine derivative CM16, with a particular emphasis on its effects on the protein synthesis of cancer cells. We confirmed CM16 cytostatic effects and showed its selectivity towards cancerous cells. The correlation of the growth inhibition profile of CM16 in the NCI 60-cell-line with those of other protein synthesis inhibitors led us to investigate such potential inhibition in vitro. CM16 induced inhibition of protein synthesis and it seems to specifically affect the initiation phase of translation, as it affected the organization of ribosome and polysomes. Phosphorylation on the initiation factor 2α (eIF2α) could be partly responsible for the inhibitory effect observed, as evidenced in this work. Also, the transcriptomic comparison of cell models displaying different levels of sensitivity to CM16 suggested that EIF1AX, EIF3E and EIF3H could drive, at least partly, their sensitivity to this compound. Proteomic study of glioma cells treated or not with CM16 was then conducted. Although the proteins of the genes mentioned above were not identified by this technic, we evidenced tiny but significant changes in Hs683 glioma cell proteomic profile through LC-MS shotgun approach. Thanks to 2-DE gel comparison, proteins differentially expressed in these conditions were identified, such as HspB1, Ebp1, BTF3, galectin, cofilin, dUTPase, PGAM1 and CK-18. These might be involved in the antiproliferative and protein synthesis inhibitory activities of CM16, particularly when considering their roles in cancer cell biology, bringing additional insights to the elucidation of the mechanism of action of this harmine derivative in cancer cells. / RÉSUMÉ: Les cancers figurent parmi les principales causes de mortalité dans le monde. Avec la chirurgie et la radiothérapie, la chimiothérapie reste une des principales manières de lutter contre le cancer. Néanmoins, en raison des mécanismes de résistance intrinsèques et / ou acquis à ces agents, le traitement du cancer reste difficile. Pour assurer leur prolifération, leur dissémination et le développement de la maladie, les cellules cancéreuses présentent certaines caractéristiques biologiques. La mise en évidence de liens remarquables entre la synthèse protéique et l'apparition et la progression du cancer a conduit à une révision et à une recherche plus approfondie de la dérégulation de la traduction au sein des cellules cancéreuses ainsi que de son potentiel en tant que cible thérapeutique. La phase d’initiation de la traduction est particulièrement dérégulée dans le cancer. Ainsi, les stratégies ciblant différentes étapes de la traduction, depuis l’inhibition des voies de signalisation en amont du processus - comme les inhibiteurs de mTOR - à l'inhibition directe des facteurs spécifiques d'initiation de la traduction, représentent de potentielles alternatives sélectives aux chimiothérapies actuelles. Dans le cadre de ce travail, nous avons étudié les effets antiprolifératifs du composé CM16, un dérivé de l'harmine préalablement synthétisé, et, en particulier, ses effets sur la synthèse des protéines des cellules cancéreuses. Nous avons confirmé les effets cytostatiques du composé CM16 et avons montré sa sélectivité vis-à-vis des cellules cancéreuses. Le profil de réponse des 60 lignées cellulaires cancéreuses du panel du NCI s’est avéré corréler avec ceux d'autres inhibiteurs connus de la synthèse protéique, ce qui nous a conduits à investiguer in vitro cette potentielle inhibition. Le CM16 inhibe la synthèse protéique et semble affecter spécifiquement la phase d'initiation de la traduction étant donné que nous avons observé une désorganisation des ribosomes et polysomes. L’induction de la phosphorylation du facteur d'initiation 2α (eIF2α) pourrait en partie être responsable de l'effet inhibiteur de la synthèse protéique. La comparaison transcriptomique des modèles du NCI présentant des degrés divers de sensibilité au CM16 suggère que EIF1AX, EIF3E et EIF3H puissent, au moins en partie, être impliquées dans la sensibilité des cellules cancéreuses au composé CM16. Nous avons ensuite réalisé une étude du profil protéomique des cellules de gliomes traitées ou non par le CM16. Bien que les cibles identifiées ci-dessus n’ont pu être identifiées par cette technique, de légères mais significatives différences dans le protéome des cellules de gliomes traitées avec le CM16 ont été mises en évidence par LC-MS shotgun. Grâce à étude comparative de gels en deux dimensions, des protéines différentiellement exprimées dans ces conditions ont été identifiées, telles que HspB1, Ebp1, BTF3, galectine 1, cofiline, dUTPase, PGAM1 et CK-18. Celles-ci pourraient être impliquées dans les effets antiprolifératifs et inhibiteurs sur la synthèse protéique induits par le CM16, notamment suite à leurs rôles dans la biologie tumorale, contribuant ainsi à l'élucidation du mécanisme d'action de ce dérivé harmine dans les cellules cancéreuses. / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Pharmacie) / info:eu-repo/semantics/nonPublished