El objetivo principal de esta investigación fue evaluar operacionalmente la baciloscopía usando la Reacción en Cadena de la Polimerasa para Tuberculosis (TB – PCR). Se evaluaron 144 muestras de esputo obtenidas de la Dirección de Salud Lima Este. En todas las muestras se realizó la baciloscopía usando la técnica clásica de Ziehl – Neelsen, lo que fue verificado mediante el cultivo Ogawa y las láminas fueron evaluadas con TB – PCR usando la secuencia de inserción IS6110. Después de la amplificación se obtuvo un fragmento de 123 pares de base correspondiente a la secuencia de inserción IS6110. Del total de muestras examinadas por el método de Ziehl – Neelsen, 54 fueron positivas y 90 fueron negativas (37.5% y 62.5% respectivamente). En las mismas muestras analizadas usando PCR, 67 fueron positivas (46.5%) y 77 fueron negativas (53.4%), mientras que para la prueba del cultivo 66 fueron positivas y 78 negativas (45.8% y 54.2% respectivamente). Los procedimientos bacteriológicos de rutina (examen directo y cultivo), pueden ser una herramienta significativa para el diagnóstico de tuberculosis pulmonar y otras enfermedades micobacterianas; pero hay una significativa subestimación de los casos de TB, especialmente usado la tinción clásica de Ziehl – Neelsen cuando esta es evaluada con TB-PCR como referencia. / The main objective of this research was to evaluate operationally baciloscopy using Polimerase Chain Reaction of for tuberculosis (TB- PCR). It was evaluated 144 sputum samples obtained from Direccion de Salud Lima Este. To all the samples they were practiced baciloscopy using the classical technique of Ziehl-Neelsen, which was verified with the Ogawa cultivation and the slides were evaluated with TB PCR using the insertion sequence IS6110. After the amplification it was obtained a fragment of 123 couples of bases corresponding to the sequence of insertion IS6110. Of the total of samples examined by the Ziehl-Neelsen method, 54 were positive and 90 were negative (37.5% and 62.5% respectively). In the same samples tested using TB PCR, 67 were positive (46.5%) and 77 were negative (53.4%); while for cultivation test 66 were positive and 78 negative (45.8% and 54.2% respectively). The routine bacteriological procedures (direct exam and cultivation) can be a very powerful tool for the diagnosis of lung tuberculosis and other mycobacterium diseases; but there is a significant understimate on all TB cases, especially using the Classical Ziehl Neelsen staining when it is evaluated with TB-PCR as reference.