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Estudo das interações de Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo / Study of the interactions between Utp25 and other proteins of the SSU processome complexMarques da Cruz, Ana Maria Martins 15 July 2016 (has links)
A síntese de ribossomos é um dos principais processos celulares e na levedura Saccharomyces cerevisiae são necessários 75 snoRNAs e mais de 200 proteínas não-ribossomais para que o ribossomo seja corretamente formado. Para o processamento do precursor dos RNAs ribossomais, chamado pré-rRNA 35S, ocorre o pareamento deste com o U3 snoRNA e outros snoRNAs e diversas proteínas se associam de maneira orquestrada e transitória, formando o complexo SSU processomo. Tal complexo é necessário para o processamento da região 5\' do pré-rRNA 35S e para a correta montagem e maturação da subunidade menor ribossomal. Estudos anteriores do nosso laboratório identificaram a proteína nucleolar Utp25, essencial em S. cerevisiae, como integrante do complexo SSU processomo. Foi demonstrado que a depleção de Utp25 afeta a formação da subunidade menor ribossomal e que Utp25 interage com as proteínas Sas10 e Mpp10, componentes do SSU processomo, além de Utp25 co-imunoprecipitar o snoRNA U3. A partir desses dados, este trabalho teve como objetivo identificar interações da proteína Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo e investigar o papel de tais interações na formação e funcionamento do mesmo. Para purificação do complexo SSU processomo nós utilizamos o método Tandem Affinity Purification-tag (TAP-tag) utilizando TAP-Utp25 como isca. Após análise do purificado resultante por espectrometria de massas, obtivemos como resultado as proteínas Rrp5, Snu13 e Nop56, sendo as duas últimas pertencentes ao subcomplexo U3 snoRNP. / The ribosome synthesis is one of the main cellular processes and in the yeast Saccharomyces cerevisiae 75 snoRNAs and more than 200 non-ribosomal proteins are involved in ribosome maturation. During processing, the pre-rRNA 35S base pairs with the U3 snoRNA and other snoRNAs and several proteins associate, forming the SSU processome complex. This complex is required for the processing of the pre-rRNA 35S 5\' region and for the correct assembly and maturation of the ribosome small subunit. Previous studies from our laboratory identified the nucleolar protein Utp25, essential in S. cerevisiae, as a member of the SSU processome complex. Utp25 depletion affects small ribosomal subunit formation. Utp25 interacts with proteins Sas10 and Mpp10, components of the SSU processome, and Utp25 co-immunoprecipitates U3 snoRNA. From these data, this study aimed to identify Utp25 interactions with other components of the SSU processome complex and to investigate the role of these interactions in this complex formation and function. For the SSU processome complex purification we used the Tandem Affinity Purification-tag method (TAP-tag) and TAP-Utp25 as the bait. After the resulting purified analysis by mass spectrometry, we obtained as results the Rrp5, Snu13 and Nop56 proteins, the last two being U3 snoRNP subcomplex components.
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Estudo das interações de Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo / Study of the interactions between Utp25 and other proteins of the SSU processome complexAna Maria Martins Marques da Cruz 15 July 2016 (has links)
A síntese de ribossomos é um dos principais processos celulares e na levedura Saccharomyces cerevisiae são necessários 75 snoRNAs e mais de 200 proteínas não-ribossomais para que o ribossomo seja corretamente formado. Para o processamento do precursor dos RNAs ribossomais, chamado pré-rRNA 35S, ocorre o pareamento deste com o U3 snoRNA e outros snoRNAs e diversas proteínas se associam de maneira orquestrada e transitória, formando o complexo SSU processomo. Tal complexo é necessário para o processamento da região 5\' do pré-rRNA 35S e para a correta montagem e maturação da subunidade menor ribossomal. Estudos anteriores do nosso laboratório identificaram a proteína nucleolar Utp25, essencial em S. cerevisiae, como integrante do complexo SSU processomo. Foi demonstrado que a depleção de Utp25 afeta a formação da subunidade menor ribossomal e que Utp25 interage com as proteínas Sas10 e Mpp10, componentes do SSU processomo, além de Utp25 co-imunoprecipitar o snoRNA U3. A partir desses dados, este trabalho teve como objetivo identificar interações da proteína Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo e investigar o papel de tais interações na formação e funcionamento do mesmo. Para purificação do complexo SSU processomo nós utilizamos o método Tandem Affinity Purification-tag (TAP-tag) utilizando TAP-Utp25 como isca. Após análise do purificado resultante por espectrometria de massas, obtivemos como resultado as proteínas Rrp5, Snu13 e Nop56, sendo as duas últimas pertencentes ao subcomplexo U3 snoRNP. / The ribosome synthesis is one of the main cellular processes and in the yeast Saccharomyces cerevisiae 75 snoRNAs and more than 200 non-ribosomal proteins are involved in ribosome maturation. During processing, the pre-rRNA 35S base pairs with the U3 snoRNA and other snoRNAs and several proteins associate, forming the SSU processome complex. This complex is required for the processing of the pre-rRNA 35S 5\' region and for the correct assembly and maturation of the ribosome small subunit. Previous studies from our laboratory identified the nucleolar protein Utp25, essential in S. cerevisiae, as a member of the SSU processome complex. Utp25 depletion affects small ribosomal subunit formation. Utp25 interacts with proteins Sas10 and Mpp10, components of the SSU processome, and Utp25 co-immunoprecipitates U3 snoRNA. From these data, this study aimed to identify Utp25 interactions with other components of the SSU processome complex and to investigate the role of these interactions in this complex formation and function. For the SSU processome complex purification we used the Tandem Affinity Purification-tag method (TAP-tag) and TAP-Utp25 as the bait. After the resulting purified analysis by mass spectrometry, we obtained as results the Rrp5, Snu13 and Nop56 proteins, the last two being U3 snoRNP subcomplex components.
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Caracterização funcional das proteínas Nop17p e Rsa1p de Saccharomyces cerevisiae / Functional characterization of the Saccharomyces cerevisiae proteins Nop17p and Rsa1pPrieto, Marcela Bach 19 September 2014 (has links)
Nop17p e Rsa1p são proteínas nucleolares em Saccharomyces cerevisiae, as quais foram identificadas pela sua associação a dois complexos celulares: os snoRNPs de box C/D, através de interação com as subunidades Nop58p e Snu13p, respectivamente, e o R2TP/Hsp90p. Nop17p parece ser responsável por direcionar a chaperona Hsp90p durante a montagem dos snoRNPs, e a associação de Rsa1p a estes complexos ainda não tem uma função estabelecida. Neste trabalho, nós mostramos que a ausência de ambas as proteínas afetam a estabilidade da proteína Nop58p dos snoRNPs e afetam a localização do snoRNA U3. Em relação à ordem de interação das proteínas do core de snoRNps de box C/D, Nop17p associa-se de maneira transiente a Nop1p/Snu13p, seguida da ligação de Nop58p ao complexo. Quanto à rede de interação do R2TP, obtivemos o mutante Nop17(N307S), que não mais interage com Tah1p. Este mutante interage com a subunidade Rvb1p do R2TP, mas não se associa com outras proteínas parceiras de Nop17p(WT). Apesar da importância da interação Nop17p-Tah1p, sua interrupção não afeta o crescimento celular, o que sugere a possibilidade de outro fator estar envolvido na associação entre Nop17p e Hsp90p. / Nop17p and Rsa1p are Saccharomyces cerevisiae nucleolar proteins, which were identified for its association with two cellular complexes: box C/D snoRNPs, through interaction with the core subunits Nop58p and Snu13p respectively, and the R2TP/Hsp90p. Nop17p seems to be responsible for directing Hsp90p to the assembly of snoRNPs. The Rsa1p association to these complexes still have no defined function. In this work, we showed that both proteins absence affect Nop58p stability and causes a mislocalization of the U3 snoRNA. Relativel to the order of assembly of the box C/D snoRNPs core proteins, Nop17p associates transiently with Nop1p/Snu13p, followed by the Nop58p joining to the complex. To study in more detail the protein interactions within the R2TP complex, we obtained the Nop17(N307S) mutant, which no longer interacts withTah1p, but still interacts withRvb1p, another R2TP subunit. Nop17(N307S) does not interact with other Nop17p(WT) partners. Despite the importance of the Nop17p-Tah1p association, the disruption of this interaction does not affect cell growth, suggesting the involvement of a second factor on the Nop17p and Hsp90p association.
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Caracterização funcional das proteínas Nop17p e Rsa1p de Saccharomyces cerevisiae / Functional characterization of the Saccharomyces cerevisiae proteins Nop17p and Rsa1pMarcela Bach Prieto 19 September 2014 (has links)
Nop17p e Rsa1p são proteínas nucleolares em Saccharomyces cerevisiae, as quais foram identificadas pela sua associação a dois complexos celulares: os snoRNPs de box C/D, através de interação com as subunidades Nop58p e Snu13p, respectivamente, e o R2TP/Hsp90p. Nop17p parece ser responsável por direcionar a chaperona Hsp90p durante a montagem dos snoRNPs, e a associação de Rsa1p a estes complexos ainda não tem uma função estabelecida. Neste trabalho, nós mostramos que a ausência de ambas as proteínas afetam a estabilidade da proteína Nop58p dos snoRNPs e afetam a localização do snoRNA U3. Em relação à ordem de interação das proteínas do core de snoRNps de box C/D, Nop17p associa-se de maneira transiente a Nop1p/Snu13p, seguida da ligação de Nop58p ao complexo. Quanto à rede de interação do R2TP, obtivemos o mutante Nop17(N307S), que não mais interage com Tah1p. Este mutante interage com a subunidade Rvb1p do R2TP, mas não se associa com outras proteínas parceiras de Nop17p(WT). Apesar da importância da interação Nop17p-Tah1p, sua interrupção não afeta o crescimento celular, o que sugere a possibilidade de outro fator estar envolvido na associação entre Nop17p e Hsp90p. / Nop17p and Rsa1p are Saccharomyces cerevisiae nucleolar proteins, which were identified for its association with two cellular complexes: box C/D snoRNPs, through interaction with the core subunits Nop58p and Snu13p respectively, and the R2TP/Hsp90p. Nop17p seems to be responsible for directing Hsp90p to the assembly of snoRNPs. The Rsa1p association to these complexes still have no defined function. In this work, we showed that both proteins absence affect Nop58p stability and causes a mislocalization of the U3 snoRNA. Relativel to the order of assembly of the box C/D snoRNPs core proteins, Nop17p associates transiently with Nop1p/Snu13p, followed by the Nop58p joining to the complex. To study in more detail the protein interactions within the R2TP complex, we obtained the Nop17(N307S) mutant, which no longer interacts withTah1p, but still interacts withRvb1p, another R2TP subunit. Nop17(N307S) does not interact with other Nop17p(WT) partners. Despite the importance of the Nop17p-Tah1p association, the disruption of this interaction does not affect cell growth, suggesting the involvement of a second factor on the Nop17p and Hsp90p association.
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