L'éclosion de rougeole de 2011 a affecté 8 régions du Québec, mais 65% des cas résidaient dans deux territoires de CLSC. Pour prévenir de nouvelles éclosions, une campagne de vaccination a été menée dans toutes les écoles du Québec. Cette étude rétrospective, basée sur le ficher provincial de vaccination, a montré qu’avant l’éclosion, la couverture vaccinale à deux doses était inférieure dans les deux CLSC les plus touchés (81%) que dans le reste de la région (87%, p<0,001). L’âge à la première dose y était plus tardif (moyenne 16 vs 14 mois, p<0,001). Après la vaccination scolaire provinciale, 85% des étudiants avaient reçu 2 doses de vaccin, 4,2% une dose mais 11% n’avaient aucune information vaccinale. La concentration des cas de rougeole de 2011 pourrait s’expliquer en partie par une couverture vaccinale légèrement plus faible qu’ailleurs. Malgré une grande campagne de vaccination scolaire, 11% restaient sans preuve de vaccination.

En 2005, le comité sur l’immunisation du Québec recommandait de passer du programme de vaccination contre l’hépatite B (HB) des préadolescents à celui des nourrissons lorsqu’un vaccin hexavalent serait disponible. Pour déterminer l’impact d’un tel changement, un bilan épidémiologique de l’HB a été réalisé à partir des cas déclarés au fichier des maladies à déclarations obligatoires. De 2005 à 2009, une vaccination des nourrissons aurait potentiellement pu prévenir 0,0335 (IC 95%: 0.0334-0.0336) cas aigus par 100 000 personnes-années chez les moins de 20 ans. De 2010 à 2013, aucun cas aigu n’a été rapporté dans ce groupe d’âge. Le programme de vaccination actuel des préadolescents est hautement efficace. En 2014, changer ce programme pour une vaccination des nourrissons avec un vaccin hexavalent n’apporterait pas de bénéfice épidémiologique mais permettrait d’augmenter la couverture vaccinale de 8-12%. / In 2005, the Quebec immunization committee recommended to replace the hepatitis B (HB) school-based immunization program by an infant program when an hexavalent vaccine would become available. To estimate the potential impact of such a program change, we summarized the HB epidemiology based on reported cases retrieved from the provincial registry of notifiable diseases. Between 2005 and 2009, 0.0335 (95% CI: 0.0334-0.0336) acute case per 100,000 person-years reported in 0-19 year-olds could have potentially been prevented by an infant immunization program. Between 2010 and 2013, no acute cases were reported in this age group. The current vaccination program is highly effective. In 2014, changing for an infant vaccination program using the hexavalent vaccine can hardly bring additional epidemiological benefit but may increase the vaccine coverage rate by 8-12%.

En 2018, la province de Québec a modifié son calendrier de vaccination contre les virus du papillome humain (VPH), remplaçant le calendrier comportant 2 doses de vaccin nonavalent par un calendrier de vaccination mixte, comportant une dose de vaccin nonavalent suivie d’une dose de vaccin bivalent. Toutefois, l’efficacité clinique et la durée de protection conférées par ce calendrier mixte ne sont pas connues avec précision, impliquant une incertitude quant à son impact populationnel sur l’incidence des maladies associées aux VPH. L’impact populationnel du calendrier mixte au Québec a été évalué à l’aide d’une étude de modélisation mathématique. Le modèle utilisé (HPV-ADVISE) est basé sur les individus et simule la dynamique de transmission des VPH à l’échelle populationnelle. Les mesures d’impact considérées incluent la réduction prédite par le modèle du taux d’incidence et du nombre total de cas des maladies attribuables aux VPH. L’effet de l’incertitude quant à l’efficacité vaccinale et la durée de protection sur l’impact du calendrier mixte a été exploré à l’aide d’analyses de sensibilité univariées. Pour les lésions cancéreuses et précancéreuses, les simulations ont globalement prédit une faible différence d’impact entre les scénarios les plus plausibles du calendrier mixte et le calendrier comportant 2 doses de vaccin nonavalent, conséquence de l’importance inférieure du fardeau attribuable aux génotypes 31/33/45/52/58 comparativement aux génotypes 16/18. L’impact sur l’incidence des condylomes s’est avéré beaucoup plus sensible à la durée de protection qu’à l’efficacité vaccinale. Pour les scénarios jugés plausibles, la réduction à long terme du taux d’incidence des condylomes a été prédite entre ~ 50 % (durée de protection de 20 ans) et 90 % (protection à vie, efficacité de 75 à 100 %). Cette grande variabilité dans les prédictions du modèle suggère qu’une surveillance populationnelle des infections à VPH et des condylomes suite à l’implantation du calendrier mixte pourrait être indiquée. / In 2018, the province of Québec (Canada) modified its vaccination schedule against human papilloma virus (HPV), replacing the 2-dose nonavalent schedule by a mixed schedule, comprising a single dose of nonavalent vaccine followed by a single dose of bivalent vaccine. However, clinical efficacy and duration of protection conferred by this mixed schedule are not known precisely, implying a level of uncertainty with respect to its population-level impact on HPV-associated diseases. The population-level impact of mixed HPV vaccination in Québec was examined with a mathematical modeling study. We used an individual-based model (HPV-ADVISE) that simulates HPV transmission dynamics at the population level. Impact measures that were considered in this study include model-predicted percentage reduction in incidence rate and in total number of cases of diseases attributable to HPV infections. The effect of uncertainty regarding vaccine efficacy and duration of protection on mixed schedule populational impact was explored with deterministic univariate sensitivity analyses. For precancerous and cancerous lesions attributable to HPV infections, the model globally predicted a small impact difference between the more plausible scenarios for the mixed schedule and the 2-dose nonavalent schedule. This is a consequence of the lesser populational importance of the disease burden attributable to genotypes 31/33/45/52/58 compared to genotypes 16/18. The impact on condyloma (anogenital warts) incidence proved much more sensitive to duration of protection compared to vaccine efficacy. For plausible mixed schedule scenarios, long-term percentage reduction of condyloma incidence rate was predicted between ~ 50 % (20 years protection scenario) and 90 % (lifelong protection and 75 % to 100 % efficacy scenarios). The high variability in model predictions within plausible scenarios suggests that populational surveillance of HPV infections and condyloma incidence following the introduction of the mixed schedule could be indicated.

L’impact des programmes de vaccination repose, en partie, sur la proportion des personnes ciblées qui reçoivent les vaccins recommandés, soit la couverture vaccinale. Au Québec dans les dix dernières années, le programme de vaccination chez les enfants avant l’âge de 24 mois a subi plusieurs changements, qui peuvent avoir eu un impact sur les couvertures vaccinales et les retards vaccinaux. Un retard vaccinal à une visite influence l’administration à temps des doses subséquentes. Plusieurs études ont documenté l’impact d’un retard à la première visite sur le statut vaccinal, mais l’impact des retards aux autres visites a été peu décrit. Depuis 2006, des enquêtes postales sont réalisées à tous les deux ans auprès d’enfants de 1 an et 2 ans afin d’évaluer la couverture vaccinale. Ces enquêtes prévoient jusqu’à 4 contacts auprès des participants potentiels pour maximiser la participation ainsi qu’une validation auprès des vaccinateurs des données vaccinales obtenues avec le carnet pour les enfants avec un statut vaccinal incomplet. Nous avons utilisé les données des enquêtes de 2006 à 2016 afin d’évaluer l’impact de l’ajout de nouveaux vaccins, des retards vaccinaux et des méthodes de collecte de l’information vaccinale sur l’estimation de la couverture vaccinale. Les analyses ont été réalisées auprès de 7183 enfants nés au Québec, dont 3508 enfants de la cohorte 2 ans. Nous avons observé que la couverture vaccinale à 24 mois pour les antigènes présents au calendrier depuis 2006 n’a pas diminué avec l’ajout des nouveaux antigènes et qu’elle a même augmenté pour les enquêtes réalisées en 2014 et 2016. En 2016, la couverture vaccinale à l’âge de 24 mois pour les antigènes déjà au programme était de 88,3 % et de 78,2 % lorsque tous les antigènes étaient considérés. La couverture vaccinale pour les nouveaux antigènes augmentait progressivement après leur introduction, mais demeurait inférieure à celle pour les antigènes déjà au programme. Nous avons également observé que la prévalence des retards vaccinaux augmentait selon les visites prévues à 2, 4, 6 et 12 mois et que l’impact des retards vaccinaux sur le statut vaccinal à l’âge de 24 mois était important pour les visites de vaccination après celle de 2 mois. Parmi les enfants avec un statut vaccinal incomplet à 24 mois, 16,1 % étaient attribuables à un retard à 2 mois, 10,6 % à un retard à 4 mois, 14,0 % à un retard à 6 mois et 31,8 % à un retard à 12 mois. Toutefois, environ les trois quarts des enfants qui présentaient un retard à la visite de 2 mois avaient un retard à une visite subséquente. Des facteurs associés à un statut vaccinal incomplet à 24 mois et à la présence de retards vaccinaux ont été identifiés afin de définir les populations les plus vulnérables qui pourraient bénéficier d’un suivi particulier. En se basant seulement sur les données du carnet, la couverture vaccinale aurait été sous-estimée de 5,5 % à 23,7 % dépendamment de l’année de l’enquête. Nous avons aussi comparé la couverture vaccinale à 24 mois entre les répondants à chacune des 4 étapes de la collecte des données. La proportion d’enfants complètement vaccinés était significativement plus élevée de 7,8 % chez les enfants des parents ayant répondu au 1er contact comparativement à ceux ayant répondu au 3e contact, mais seulement 2,1 % plus élevée que celle estimée parmi tous les répondants. L’ajout de répondants à chacune des étapes a permis d’augmenter le taux de réponse de l’enquête, mais a eu un impact limité sur la validité des estimés. Pour terminer, les enquêtes de couverture vaccinale sont essentielles pour évaluer la pénétration des programmes de vaccination et leur évolution dans le temps. L’évaluation des retards vaccinaux permet d’avoir un meilleur portrait de la vulnérabilité de la population. Il faudrait également considérer les autres visites dans la planification des interventions visant à réduire les délais dans l’administration des vaccins en plus de la visite de 2 mois. La validation des données de vaccination auprès d’autres sources doit être poursuivie afin de limiter la possibilité d’un biais d’information, mais peut être restreinte aux enfants avec un statut incomplet. Afin de mieux évaluer les bénéfices de réaliser plusieurs tentatives de contacts, il serait utile que les enquêtes de couverture vaccinales similaires à celle réalisée dans le cadre de ce projet présentent la couverture vaccinale estimée auprès des répondants à chacune des étapes. / The impact of vaccination programs depends upon the proportion of the target population who have received the recommended vaccines, i.e. vaccination coverage. In Quebec (Canada), during the last ten years, many new vaccines were added in the vaccination schedule for children under 24 months of age and this may have decreased the vaccination coverage and increased vaccine delays. Vaccine delay at one visit had an impact of on-time administration of subsequent doses. Many studies had shown that vaccine delays at first vaccines on the vaccination status, but there are scarce data regarding the impact of vaccine delays at other visits. Since 2006, vaccination coverage surveys are conducted every two years among children aged 1 and 2 years of age. These studies included up to four attemps to contact eligible individuals and data from vaccine booklets were supplemented by data from vaccine providers for children with missing doses. We used data collected from 2006 to 2016 to evaluate the impact of the addition of new vaccines in the early childhood schedule, the impact of vaccine delays and the impact of methods used to collect vaccination information. Analyses were realised with the 7183 children born in Québec; including 3508 children from the 2-year cohort. We observed that vaccination coverage by 24 months did not decrease with the addition of new vaccines for antigens included in the schedule since 2006 and was in fact higher in 2014 and 2016. In 2016, vaccination coverage for antigens in the schedule since 2006 was of 88.3% and of 78.2% including all recommended antigens. The vaccination coverage for new antigens increased rapidly after their introduction but remained lower than vaccination coverage for antigens in the schedule since 2006. We observed that the prevalence of vaccine delays increased by vaccination visits at 2, 4, 6 and 12 months and that the impact of vaccine delays on incomplete vaccination status by 24 months was important for delays after the 2-month visit. Among children with an incomplete vaccination status by 24 months, 16.1% were attributable with a first vaccine delay (2 mois), 10.6% at 4 months, 14.0% at 6 months and 31.8% at 12 months. However, about 75% of children with a vaccine delay at 2 months also had vaccine delays at later visits. Factors associated with an incomplete vaccination status by 24 months and with vaccine delays were assessed to identify more vulnerable populations who may required a particular follow-up. Without validation among vaccine providers in our study, the vaccination coverage by 24 months would have been underestimated from 5.5% to 23.7 depending on the survey year. We have compared vaccination coverage by 24 months between each contacts among potential respondents. We observed that the proportion fully vaccinated by 24 months of age was significantly 7.8% higher in children whose parents responded to the first rather than the third contact, but it was only 2.1% higher when comparing respondents to contact 1 and all respondents. Conducting multiple contact attempts increased the overall response rate, but had limited impact on the validity of estimates. To conclude, vaccination coverage studies are essential to evaluate the impact of vaccination programs and trends over the years. Monitoring of vaccine delays provide more information regarding the susceptibility of the population. Intervention to improve timeliness should address delays at each visit and not only focus on the first visit. In addition, validation of vaccination data among other sources is necessary to limit the presence of information bias in vaccination coverage studies, but may be restricted to children incompletely vaccinated. To better evaluate the benefit of multiple contacts it would be useful for future similar vaccination surveys to present the coverage obtained from respondants to each contact.

L'éclosion de cas de pneumonie sévère causée par le S. pneumoniae de type 1 avait motivé la réalisation d'une campagne d'immunisation de masse avec le vaccin polysaccharidique 23-valent, et plus 83 % de la cible étaient vaccinés. L'objectif de ce travail est d'évaluer l'impact de cette campagne chez le groupe d'âge 10-64 ans au Nunavik. Le devis de l'étude consistait en une analyse d'une série d'observations pendant les périodes pré-épidémique, épidémique et post-intervention. Les bases de données des maladies à déclaration obligatoire et des hospitalisations sont utilisées pour identifier 24 cas d'infections invasives et 405 cas d'hospitalisation attribués au S. pneumoniae. La modélisation de Poisson a été utilisée pour les analyses, et les tests de Wald, du Chi2 et Fisher pour les inférences statistiques. L'incidence des IIP était de 3,7 par 100 000 personnes-mois entre janvier 1997 et décembre 2004. Un taux d'incidence élevé était surtout observé pendant la période épidémique (11,0 par 100 000 personnes-mois) contrairement aux périodes pré-épidémique et post intervention où de faibles taux ont été constatés (respectivement 1,8 et 1,7 par 100 000). Le sérotype 1 était totalement absent avant l'épidémie. L'incidence des IIP liées au sérotype 1 a fortement diminué après l'intervention. Il en était de même pour tous les sérotypes inclus dans le vaccin. L'incidence des hospitalisations augmentait avec l'âge (p<0,001) et était plus élevée chez les femmes (p=0,021). Le taux d'hospitalisation observé pendant la période épidémique n'a pas diminué de manière significative après l'intervention, aussi bien pour l'ensemble des hospitalisations que pour les hospitalisations en diagnostic principal, en analyse univariée et en multivariée. A la suite de la campagne d'immunisation de masse, l'incidence des IIP liées aux sérotypes inclus dans le VPP-23v a sensiblement diminué, contrairement au taux d'hospitalisation. / An outbreak of severe pneumonia caused by type 1 S. pneumoniae prompted a mass immunization campaign using the 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine, and more than 83 % of the target population was vaccinated. The objective of this study is to evaluate, among the age group 10-64 years, the impact of the mass immunization campaign using. The study consisted of an analysis of a series of observations during the preepidemic, epidemic and post-intervention periods. Denominalized databanks of reportable diseases and hospitalizations were used to identify 24 cases of invasive infections and 405 cases of hospitalization attributed to S. pneumoniae. The statistical unit was the monthly frequency of invasive pneumococcal infections, or hospitalizations related to the pneumoeoccus. Poisson modelization of the rates was used for the analyses, and the Wald, Chi2 and Fisher tests for the statistical inferences. The incidence of invasive pneumococcal infections was 3.7 per 100 000 person-months between January 1997 and December 2004. An elevated incidence rate was especially observed during the epidemic period (11.0 per 100 000 person-months) compared to preepidemic and post-intervention periods where weak rates were observed (1.8 and 1.7 per 100 000 persons, respectively). The epidemic was attributed to serotype 1 which was completely absent previously. The incidence of IPI caused by serotype 1 diminished significantly after the intervention. The same situation prevailed for ail serotypes included in the vaccine. The incidence of hospitalizations increased with age (p<0.001) and were higher among women (p=0.021). The increase in the hospitalization rate observed during the epidemic period did not diminish significantly after the intervention, for both the totality of the diagnoses and the principal diagnoses, using univariate and multivariate analyses. After the mass immunization campaign, the incidence of invasive infections caused by serotypes included in the vaccine diminished markedly; however, there was no significant effect observed on the hospitalizations related to the pneumoeoccus.

Titre de l'écran-titre (visionné le 13 décembre 2023) / Dans ce présent mémoire, nous entreprenons l'identification des facteurs qui exercent la plus grande influence dans la prise de décision concernant l'adhésion au programme de vaccination contre la COVID-19, particulièrement en ce qui concerne l'administration de doses multiples. Afin de scruter le processus décisionnel, nous utilisons les régressions linéaires avec régularisation afin de discriminer certaines variables. Nous optons ensuite pour une première approche qui fait appel à des modèles économétriques, incluant le modèle logit ordonné et le modèle Hurdle Poisson. Une deuxième approche repose sur l'apprentissage statistique, en exploitant un arbre de décision, l'algorithme de l'eXtreme Gradient Boosting, une forêt aléatoire, une analyse fondée sur les vecteurs de support, et enfin, un réseau de neurones. Les variables sont classifiées en cinq catégories majeures : les variables socioéconomiques, celles liées aux symptômes infectieux de la COVID-19, celles associées au risque perçu de contracter la COVID-19, les variables relatives à l'expérience personnelle des individus face à la COVID-19, ainsi que les facteurs liés aux interactions des individus avec ce virus. Les données proviennent de la firme de sondage Léger Marketing Opinion. Nos analyses révèlent que les variables socioéconomiques jouent un rôle central dans la décision d'adhérer au programme de vaccination et aux doses multiples. Notamment, les individus âgés de 50 ans et plus, détenant minimalement un diplôme de premier cycle universitaire, et disposant d'un revenu supérieur à 100 000 $, se montrent plus enclins à participer à l'effort de couverture vaccinale de masse en consentant à la réception de doses multiples. Les autorités publiques et sanitaires ne doivent toutefois pas omettre l'analyse de l'entourage des individus afin d'améliorer l'efficacité des politiques publiques. / In this master thesis, we endeavor to identify the factors that are most likely to exert an influence on decision-making regarding adherence to the COVID-19 vaccination program and the acceptance of multiple-dose vaccine injections. To analyze the decision-making process, We use regularized linear regressions to build a parsimonious model. We then use two primary approaches. Firstly, we employ econometric models, specifically the ordered logit model and the Hurdle Poisson. Secondly, we use statistical learning, encompassing a decision tree, the eXtreme Gradient Boosting algorithm, a random forest, support vector analysis, and a neural network. The variables under investigation fall within five broad categories : socio-economic factors related to infectious symptoms of COVID-19, perceived risk of developing COVID-19, individual experience of COVID-19, and individual relationships with COVID-19. The data utilized for analysis were obtained from Léger Marketing Opinion. Our findings divulge that socio-economic variables play a pivotal role in the decision-making process to endorse the vaccination program. Individuals aged 50 and above, possessing at least an undergraduate degree, and earning an income exceeding $100,000, demonstrate a greater likelihood of participating in mass vaccination coverage and consenting to multiple doses of vaccine injections. Nonethless, we emphasize that public and health authorities must not disregard the importance of scrutinizing the attitudes of those around them, in order to improve the elaboration of public policies.

Le but de l'étude a été d'évaluer le fardeau associé à la varicelle et au zona au Québec à la suite de l'introduction du programme public de vaccination contre la varicelle à une puis à deux doses. La première dose contre la varicelle a été introduite dans le programme régulier d'immunisation québécois en 2006 et la deuxième dose a été mise en place en 2016. La revue de littérature a démontré que l'ajout d'une deuxième dose de vaccin pouvait permettre de réduire davantage les consultations, les hospitalisations et les décès liés à la varicelle et au zona (chez les 0-9 ans). Cette étude a utilisé un devis de recherche quantitatif à visée descriptive afin de dresser le portrait de la varicelle et du zona au Québec de 1996 à 2018. Elle a utilisé des données clinico-administratives de la Régie de l'assurance maladie du Québec (RAMQ), les données Maintenance et exploitation des données pour l'étude de la clientèle hospitalière (MED-ECHO), la Banque de données communes des urgences (BDCU) ainsi que le registre de décès de l'Institut de la statistique du Québec (ISQ) pour mesurer le fardeau de la varicelle et du zona au Québec. Entre la période pré-vaccinale (1996-2000) et la période de vaccination à une dose contre la varicelle (2006-2015), une baisse du taux de consultation pour varicelle de 93 % a été enregistrée. Il y a eu une réduction de 83 % du taux d'hospitalisation pour la varicelle entre la période vaccinale à deux doses (2017-2018) et la période vaccinale dans le secteur privé (2001-2005). Il y a eu une diminution de 76 % du taux d'hospitalisation pour le zona chez les 0-9 ans entre la période 2017-2018 et la période 2001-2005. Une poursuite de la surveillance est nécessaire pour mieux cerner l'impact de la deuxième dose. / The purpose of this study was to assess the burden associated with varicella and herpes zoster in Quebec following the introduction of the one and two-dose public varicella vaccination programs. The first dose of the varicella vaccine was introduced as part of the regular immunization program in 2006, and the second dose was introduced in 2016. A review of the literature conducted outside Quebec demonstrated that the addition of a second dose of vaccine could further reduce consultations, hospitalizations and deaths related to varicella and shingles (0-9 years old). This study used a quantitative, descriptive research design in order to evaluate the burden of varicella and shingles in Quebec from 1996 to 2018. It used clinico-administrative data from the Régie de l'assurance maladie du Québec (RAMQ), the Maintenance et exploitation des données pour l'étude de la clientèle hospitalière (MED-ECHO), the Banque de données communes des urgences (BDCU), and the Institut de la statistique du Québec (ISQ) death registry to measure the burden of varicella and herpes zoster in Quebec. Between the pre-vaccination era (1996-2000) and the one-dose varicella vaccination era (2006-2015), a 93 % decrease in the rate of varicella consultations was recorded. There was an 83% reduction in the hospitalization rate for varicella between the two-dose vaccine period (2017-2018) and the pre-vaccine period (1996-2000). There was a 76 % decrease in the hospitalization rate for shingles in 0-9 years olds between 2017-2018 and the private sector vaccine period (2001-2005). Continued surveillance is necessary in order to measure the impact of the second dose.

Au Québec, la vaccination des nourrissons n’est pas obligatoire. Dès lors, la décision revient aux parents d’accepter ou de refuser les vaccins. Cette décision relève d’un processus complexe qui implique différents facteurs qu’il m’a semblé pertinent d’étudier. Ce projet, mené auprès de vingt mères québécoises, vise à déterminer l’influence de la moralité populaire et les stratégies de gestions du risque sur la décision de vaccination des nourrissons québécois. Trois profils de participantes ont été établis, les mères favorables à la vaccination, les mères hésitantes et enfin, les mères défavorables à la vaccination. Pour chacun des profils, les composantes de la moralité, telles les normes et les valeurs ont été identifiées. De plus, les stratégies de gestion du risque envers les maladies infectieuses et la vaccination ont été documentées. Au sein des profils, une homogénéité quant aux moralités et aux stratégies de gestion du risque mises en place a pu être observée.