Las poblaciones de jutía conga ocupan un amplio espectro de hábitas (formaciones vegetales) en Cuba, pero no existen estudios sobre variaciones morfológicas entre poblaciones que incluyan los posibles factores determinantes de las mismas, a efectos de inferir caracteres adaptativos que pudieran considerarse para delimitar diferentes unidades de significación evolutiva para la conservación de la especie. El presente trabajo tiene como objetivo general determinar la relación entre variables morfológicas adaptativas, y factores climáticos y de estructura de la vegetación, en poblaciones de jutía conga que viven en las formaciones vegetales de manglar, bosque y vegetación xerofítica en Cuba. Consideramos que si las condiciones de los distintos hábitats en cuanto al clima y tipo de vegetación son suficientemente diferentes entre ellos, entonces la morfometria y morfofisiología de las poblaciones de jutía conga que los habitan presentarán adaptaciones locales diferenciadas en relación con dichos hábitats, y estos representarían unidades de manejo diferenciadas para la conservación de la especie. Se estudiaron las variaciones morfométricas y morfofisiológicas en ocho poblaciones de jutía conga (Capromys pilorides) de hábitats diferentes (manglar, vegetación de costa de cayo, bosque de ciénaga, matorral xeromorfo y bosque semideciduo) en los meses de febrero, marzo y abril (finales de la seca) y agosto, septiembre y octubre (finales de la lluvia). Para ello se capturaron 768 individuos adultos de jutía conga, 417 hembras y 351 machos. Las poblaciones estudiadas fueron: Área Protegida de Recursos manejados Las Picuas, Najasa e Isla, Parque Nacional Jardines de la Reina, Ciénaga de Zapata y Península de Guanahacabibes, Refugio de Fauna Cayo Saetía y Reserva Ecológica Hatibonico. A cada ejemplar capturado se efectuó un grupo de mediciones que constituyen variables adaptativas; estas variables se utilizaron para elaborar índices con el fin de determinar el grado de adaptación local y el grado de diferenciación entre las poblaciones. Posteriormente, a partir de esta información se establecieron categorías infraespecíficas para la conservación. Se analizaron 22 variables morfométricas y morfofisiológicas. Nueve variables se consideraron en sus valores absolutos: peso corporal (PC), peso del hígado (PH), largo corporal total (LT), largo cabeza tronco (LCT), largo de la cola (Co), pie izquierdo con uña (Pi), grosor de la médula (GM), corteza (GC) renal y largo de la última porción del intestino grueso (LIG). Trece variables se consideraron en sus valores relativos, ponderadas con respecto al LT y LCT para obtener los siguientes índices: Robustez (Ro), condición física (CF), peso por milímetro lineal (PL), pie relativo (PiR), cola relativa (CoR), índice de absorción de agua, dos índices de reabsorción de agua, tres índices de nutrición, índice largo del pie/ largo de la cola y el índice de dimorfismo sexual. Para todas las variables consideradas se estudió también la respuesta diferencial adaptativa entre sexos dentro de cada población. Para identificar procesos de adaptación se utilizó un índice climático de Martonne como indicador de las condiciones locales. Los resultados mostraron diferencias estadísticamente significativas entre las poblaciones de los hábitats bosque y manglar en cuanto a las variables absolutas y relativas, con valores de incremento del LCT entre poblaciones a medida que se pasaba del manglar al bosque. Se detectó una fuerte asociación entre LCT, PC y Pi, así como de los índices de absorción, reabsorción y nutrición con respecto al índice climático de Martonne, lo que refleja un proceso de adaptación local. Se discuten los resultados en relación a la protección y uso sostenible de la especie sobre la base de la determinación de cinco grupos de unidades de manejo para la conservación, conformados por las poblaciones de los siguientes hábitats: manglar, ciénaga y vegetación xerofítica, bosque con individuos de hábitos arborícolas y bosque con individuos de hábitos terrestres.