Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-15T13:55:34Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Emanuell Ribeiro.pdf: 867180 bytes, checksum: 80e2808ea4dba856924c7c1f89d4c29b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T13:55:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Emanuell Ribeiro.pdf: 867180 bytes, checksum: 80e2808ea4dba856924c7c1f89d4c29b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / With more than 5,700 species described, Neotropical ichthyofauna is considered the most diverse vertebrate fauna of the world. Neotropical fishes represent 20% of all fish species in the world. Therefore any attempt to understand evolution of vertebrates must rely on the understanding of the diversification of fishes in the Amazon basin and adjacent regions. Among the drainages that comprise the Amazon basin, the Xingu and Tapajós are particularly notable for the large number of rapids and waterfalls, which occur in the transition area between the Brazilian Shield and the Amazonian plain. The environment of the rapids is characterized by a set of extreme environmental features, requiring morphophysiological and behavioral specializations of the associated ichthyofauna. With approximately 250 valid species, the tribe Ancistrini has strong association with rapidly moving waters, and are an important component of the rheophilic fish fauna of the Xingu- Tapajós aquatic ecoregion. The Xingu and Tapajós Rivers are considered historically under-sampled, and the high number of species that have been described in recent years is indicative of the need to expand the taxonomic studies in this ecoregion. The recent infrastructure investments by the federal government into the construction oof hydroelectric developments raises to the state of urgency the need to increase the number of studies aimed to describe and elucidate the processes that generated these communities. For these reasons, the present study aimed to characterize the molecular diversity and phylogenetic structure of ancistrine communities of the Xingu-Tapajós aquatic ecoregion with the goal of clarifying the historical and ecological processes responsible for the current pattern of species co-occurrence. Analyses of DNA barcodes revealed the existence of 46 species of Ancistrini in the ecoregion, that are distributed in 16 genera, one of them probably being a new genus. The high concordance between morphologically and molecularly identified species indicates the reliability of the methodology of DNA barcoding for the identification/delimitation of species, making it a useful tool for the necessary acceleration of the description of new species of Neotropical ichthyofauna. The importance of biotic interactions suggested by analysis of phylogenetic community structure meets the theories proposed for the formation of communities of fish in lotic environments. However some evidence suggests that this difference may be the result of bias related to the taxonomic and geographical scales of the current study. / Com mais de 5.700 espécies descritas a ictiofauna neotropical é considerada a mais diversa fauna de vertebrados. Os peixes neotropicais representam 20% de todas as espécies de peixes do mundo. Deste modo qualquer tentativa de se entender a completa evolução dos vertebrados deve incluir a diversificação dos peixes na bacia amazônica e regiões adjacentes. Dentre as drenagens que compõem a bacia amazônica, os rios Xingu e Tapajós se destacam pelo grande número de corredeiras e cachoeiras, que ocorrem na área de transição entre o escudo brasileiro e a planície amazônica. Os ambientes de corredeira apresentam um conjunto de características extremas à ictiofauna, requerendo dessa especializações morfofisiológicas e comportamentais. Com aproximadamente 250 espécies válidas, a tribo Ancistrini apresenta forte relação aos ambientes de águas correntosas e são um importante componente da ictiofauna reofílica da ecorregião aquática Xingu-Tapajós. O Xingu e Tapajós são considerados rios historicamente pouco amostrados, e o elevado número de espécies que vem sendo descritas nos últimos anos é um indicativo da necessidade de ampliação de estudos taxonômicos nessa ecorregião. Os recentes investimentos do governo federal na construção de empreendimentos hidroelétricos eleva a um estado de urgência a necessidade do aumento de estudos que visem descrever e elucidar os processos que geraram essas comunidades. Por esses motivos, o presente estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade molecular e estrutura filogenética das comunidades de Ancistrini da ecorregião aquática Xingu- Tapajós a fim de esclarecer os processos ecológicos e históricos responsáveis pelo atual padrão de co-ocorrência de espécies. As análises de DNA barcodes revelaram a existência de 46 espécies de Ancistrini na ecorregião, essas estão distribuídas por 16 gêneros, sendo um deles um provável gênero novo. A elevada concordância do banco de dados molecular e as espécies morfologicamente identificadas, indica a confiabilidade da metodologia de DNA barcoding na identificação/delimitação de espécies, sendo assim uma ferramenta útil ao necessário aceleramento da descrição de novas espécies da ictiofauna neotropical. A importância das interações bióticas sugerida pelas análises de estruturação filogenética de comunidades vai de encontro às teorias propostas para formação de comunidades de peixes em ambientes lóticos. Entretanto algumas evidências apontam que essa diferença pode ser resultado de viés relacionados às escalas taxonômicas e geográficas utilizadas nesse estudo.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-06-15T13:37:05Z No. of bitstreams: 2 Ronnayana Silva_mestrado_BADPI_2013.pdf: 2137182 bytes, checksum: a56fd4464e1ee5cd89ba1113364ec766 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T13:37:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Ronnayana Silva_mestrado_BADPI_2013.pdf: 2137182 bytes, checksum: a56fd4464e1ee5cd89ba1113364ec766 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-04-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Dekeyseria Rapp Py-Daniel, 1985 comprises six species (D. amazonica, D. brachyura, D. picta, D. niveata, D. pulcher e D. scaphirhyncha) with uncertain taxonomic boundaries. Based on examination of approximately 400 specimens from different ichthyological collections and recently sampled material, all the species were reviewed taxonomically, (D expanding the characterization of three of them (D. amazonica, D. picta D. scaphirhyncha), and proposing new synonyms . brachyura and D. pulchra as synonyms of D. picta, and D. niveata as synonym of D. scaphirhyncha). Besides, two new species are preliminarily described for the genus (Dekeyseria sp. 1 and Dekeyseria sp. 2). Dekeyseria is diagnosed by head and body depressed, snout completely plated, three series of plates on the caudal peduncle and three series of lateral plates on the body with hypertrophied odontodes. The study of their characteristics resulted on the recognition of ontogenetic variation and sex dimorphism for some species. The species of the genus are usually associated to submerged logs in calm waters of streams and lakes and also boulders, although not abundant, they are widely distributed in the entire Amazon basin, including five Brazilian states, and also in the Rio Orinoco drainage, in Venezuela and Colombia. / Dekeyseria Rapp Py-Daniel, 1985 compreende seis espécies nominais (D. amazonica, D. brachyura, D. niveata, D. picta, D. pulcher e D. scaphirhyncha), cujos limites taxonômicos não são bem estabelecidos. Através do exame de aproximadamente 400 exemplares proveniente de diferentes coleções ictiológicas e de coletas recentes, todas as espécies foram revisadas, ampliando a caracterização de três delas (D. amazonica, D.picta e D. scaphirhyncha), e propondo novas sinonímias (D. brachyura e D. pulchra como sinônimos júnior de Dekeyseria picta, e D. niveata sinônimo júnior de D. scaphirhyncha). Além disso, são preliminarmente descritas duas novas espécies para o gênero (Dekeyseria sp. 1 e Dekeyseria sp. 2). Dekeyseria é diagnosticada por possuir cabeça e corpo deprimidos, focinho coberto por placas, três séries de placas no pedúnculo caudal e três séries de placas laterais com odontódeos. A observação de suas características permitiu a apresentação da variação ontogenética e dimorfismo sexual para algumas de suas espécies. As espécies do gênero encontram-se normalmente associadas a troncos submersos, áreas de remanso e lagos, podendo também estar associadas à pedrais, e são distribuídas ao longo de toda bacia amazônica, abrangendo cinco estados brasileiros, e parte da bacia do rio Orinoco, na Venezuela e Colômbia.

O grupo Acanthicus (Siluriformes, Loricariidae) é composto por quatro gêneros: Acanthicus, Megalancistrus, Leporacanthicus e Pseudacanthicus. O monofiletismo do grupo composto por estes géneros foi previamente suportado por dados morfológicos e moleculares. Com o intuito de elucidar as relações filogenéticas entre as espécies do grupo Acanthicus foram analisados 21 representantes do grupo interno e mais 12 táxons de Ancistrini como grupos externos, com base em 121 caracteres fenotípicos de diferentes complexos anatômicos. A análise de parcimônia resultou em duas árvores igualmente parcimoniosas com 453 passos (CI= 0,32 RI= 0,66). O monofiletismo do grupo Acanthicus foi corroborado com base em 11 sinapomorfias, três destas exclusivas: crista do hiomandibular contínua a do quadrado; extremidade distal dos dentes do pré-maxilar acentuadamente curvada e quilhas na lateral do corpo bastante desenvolvidas. As relações entre os táxons do grupo Acanthicus mais Spectracanthicus resultaram na seguinte topologia: ((Spectracanthicus) (Megalancistrus, Acanthicus) (Leporacanthicus, Pseudacanthicus))). A nomenclatura genérica do grupo foi reformulada seguindo a hipótese filogenética e a revisão taxonômica resultou no reconhecimento de 18 espécies válidas no grupo Acanthicus, nove destas novas. No gênero Pseudacanthicus, P. fordii foi considerado sinônimo de P. serratus e P. histrix sinônimo de P. spinosus; ademais seis novas espécies foram descritas para as bacias dos rios Aripuanã, Tocantins, Tapajós, Curuá-Una e Xingu. Oligancistrus foi considerado sinônimo de Spectracanthicus e foram descritas três novas espécies das bacias dos rios Tapajós, Tocantins e Xingu. / The Acanthicus group (Siluriformes, Loricariidae) is currently composed of four genera: Acanthicus, Megalancistrus, Leporacanthicus e Pseudacanthicus. The monophyly of the group has been previously supported by both morphological and molecular data. To investigate the relationships among the Acanthicus group species, 21 taxa of the ingroup and 12 taxa of other Ancistrini as out-groups were studied on the basis of 121 phenotipic characters of different anatomical complexes. Parsimony analysis resulted in two most parsimonious trees with 453 steps (CI= 0,32 RI= 0,66). Monophyly of the Acanthicus group was corroborated by 11 synapomorphies, three of which exclusive: hiomandibular ridge contiguous with ridge of the quadrate, distal edge of premaxillary teeth strongly curved with well-developed keels. Relationships of the Acanthicus group plus Spectracanthicus resulted in the following topology: (Spectracanthicus ((Megalancistrus, Acanthicus) (Leporacanthicus, Pseudacanthicus))). Genus-level nomenclature of the group was reformed on the basis of the phylogenetic hypothesis and of a taxonomic revision which resulted in the recognition of 18 valid species in the Acanthicus group, nine of which new. In the genus Pseudacanthicus, P. fordii was recognized as a junior synonym of P. serratus and P. histrix of P. spinosus, with six new species from the Aripuanã, Tocantins, Tapajós, Curuá-Una and Xingu Rivers Basins. Oligancistrus was recognized as a junior synonym of Spectracanthicus and three new species were described in the latter, from the Tapajós, Tocantins and Xingu River Basins.

O grupo Acanthicus (Siluriformes, Loricariidae) é composto por quatro gêneros: Acanthicus, Megalancistrus, Leporacanthicus e Pseudacanthicus. O monofiletismo do grupo composto por estes géneros foi previamente suportado por dados morfológicos e moleculares. Com o intuito de elucidar as relações filogenéticas entre as espécies do grupo Acanthicus foram analisados 21 representantes do grupo interno e mais 12 táxons de Ancistrini como grupos externos, com base em 121 caracteres fenotípicos de diferentes complexos anatômicos. A análise de parcimônia resultou em duas árvores igualmente parcimoniosas com 453 passos (CI= 0,32 RI= 0,66). O monofiletismo do grupo Acanthicus foi corroborado com base em 11 sinapomorfias, três destas exclusivas: crista do hiomandibular contínua a do quadrado; extremidade distal dos dentes do pré-maxilar acentuadamente curvada e quilhas na lateral do corpo bastante desenvolvidas. As relações entre os táxons do grupo Acanthicus mais Spectracanthicus resultaram na seguinte topologia: ((Spectracanthicus) (Megalancistrus, Acanthicus) (Leporacanthicus, Pseudacanthicus))). A nomenclatura genérica do grupo foi reformulada seguindo a hipótese filogenética e a revisão taxonômica resultou no reconhecimento de 18 espécies válidas no grupo Acanthicus, nove destas novas. No gênero Pseudacanthicus, P. fordii foi considerado sinônimo de P. serratus e P. histrix sinônimo de P. spinosus; ademais seis novas espécies foram descritas para as bacias dos rios Aripuanã, Tocantins, Tapajós, Curuá-Una e Xingu. Oligancistrus foi considerado sinônimo de Spectracanthicus e foram descritas três novas espécies das bacias dos rios Tapajós, Tocantins e Xingu. / The Acanthicus group (Siluriformes, Loricariidae) is currently composed of four genera: Acanthicus, Megalancistrus, Leporacanthicus e Pseudacanthicus. The monophyly of the group has been previously supported by both morphological and molecular data. To investigate the relationships among the Acanthicus group species, 21 taxa of the ingroup and 12 taxa of other Ancistrini as out-groups were studied on the basis of 121 phenotipic characters of different anatomical complexes. Parsimony analysis resulted in two most parsimonious trees with 453 steps (CI= 0,32 RI= 0,66). Monophyly of the Acanthicus group was corroborated by 11 synapomorphies, three of which exclusive: hiomandibular ridge contiguous with ridge of the quadrate, distal edge of premaxillary teeth strongly curved with well-developed keels. Relationships of the Acanthicus group plus Spectracanthicus resulted in the following topology: (Spectracanthicus ((Megalancistrus, Acanthicus) (Leporacanthicus, Pseudacanthicus))). Genus-level nomenclature of the group was reformed on the basis of the phylogenetic hypothesis and of a taxonomic revision which resulted in the recognition of 18 valid species in the Acanthicus group, nine of which new. In the genus Pseudacanthicus, P. fordii was recognized as a junior synonym of P. serratus and P. histrix of P. spinosus, with six new species from the Aripuanã, Tocantins, Tapajós, Curuá-Una and Xingu Rivers Basins. Oligancistrus was recognized as a junior synonym of Spectracanthicus and three new species were described in the latter, from the Tapajós, Tocantins and Xingu River Basins.

Uma revisão taxonômica gênero Leporacanthicus Isbrücker & Nijssen, 1989 é apresentada, bem como uma hipótese filogenética de relacionamento das espécies, e de seu posicionamento dentro da tribo Ancistrini. Quatro espécies distribuídas no planalto Brasileiro e das Guianas, bacias Amazônica e do Orinoco são consideradas válidas: L.galaxias (rios Tocantins, Guamá e Orinoco); L. joselimai (rios Tapajós e Curuá-Una); L. heterodon (rio Xingu); e L. triactis (rio Orinoco). A análise resultou em dois cladogramas igualmente parcimoniosos com 336 passos (IC=0,43; IR=0,66), do qual foi gerado uma árvore de consenso estrito. O monofiletismo de Leporacanthicus é corroborado por 14 sinapomorfias; dentro do gênero foi obtida a seguinte topologia (L. galaxias (L. triactis (L. heterodon, L. joselimai))). Os resultados apresentados aqui sugerem que Pseudacanthicus representam o grupo irmão de Leporacanthicus, diferindo de propostas anteriores obtidas com caracteres morfológicos e/ou moleculares. / A taxonomic review of the genus Leporacanthicus Isbrücker & Nijssen, 1989 is presented, as well as a phylogenetic hypothesis of species relationships, and it position within the tribe Ancistrini. Four species distributed in the Brazilian and Guiana Shields, Amazon and Orinoco Basins, are recognized as valid: L.galaxias (rios Tocantins, Guam and Orinoco); L. joselimai (rios Tapajós and Curuá-Una), L. heterodon (rio Xingu); e L. triactis (rio Orinoco). The phylogenetic analysis resulted in two cladogramas equally parsimonious with 336 steps (CI=0,43; RI=0,66), from which a strict consensus tree was generated. The monophyletism of Leporacanthicus is corroborated by 14 synapomorphies; within the genus the following topology was obtained: (L. galaxias (L. triactis (L. heterodon, L. joselimai))). The results presented herein suggest that Pseudacanthicus is considered to be the sister-group of Leporacanthicus, differing from previous hypothesis obtained using molecular and/or morphological dada.

Uma revisão taxonômica gênero Leporacanthicus Isbrücker & Nijssen, 1989 é apresentada, bem como uma hipótese filogenética de relacionamento das espécies, e de seu posicionamento dentro da tribo Ancistrini. Quatro espécies distribuídas no planalto Brasileiro e das Guianas, bacias Amazônica e do Orinoco são consideradas válidas: L.galaxias (rios Tocantins, Guamá e Orinoco); L. joselimai (rios Tapajós e Curuá-Una); L. heterodon (rio Xingu); e L. triactis (rio Orinoco). A análise resultou em dois cladogramas igualmente parcimoniosos com 336 passos (IC=0,43; IR=0,66), do qual foi gerado uma árvore de consenso estrito. O monofiletismo de Leporacanthicus é corroborado por 14 sinapomorfias; dentro do gênero foi obtida a seguinte topologia (L. galaxias (L. triactis (L. heterodon, L. joselimai))). Os resultados apresentados aqui sugerem que Pseudacanthicus representam o grupo irmão de Leporacanthicus, diferindo de propostas anteriores obtidas com caracteres morfológicos e/ou moleculares. / A taxonomic review of the genus Leporacanthicus Isbrücker & Nijssen, 1989 is presented, as well as a phylogenetic hypothesis of species relationships, and it position within the tribe Ancistrini. Four species distributed in the Brazilian and Guiana Shields, Amazon and Orinoco Basins, are recognized as valid: L.galaxias (rios Tocantins, Guam and Orinoco); L. joselimai (rios Tapajós and Curuá-Una), L. heterodon (rio Xingu); e L. triactis (rio Orinoco). The phylogenetic analysis resulted in two cladogramas equally parsimonious with 336 steps (CI=0,43; RI=0,66), from which a strict consensus tree was generated. The monophyletism of Leporacanthicus is corroborated by 14 synapomorphies; within the genus the following topology was obtained: (L. galaxias (L. triactis (L. heterodon, L. joselimai))). The results presented herein suggest that Pseudacanthicus is considered to be the sister-group of Leporacanthicus, differing from previous hypothesis obtained using molecular and/or morphological dada.