De nos jours, les systèmes d'aide à la navigation occupent une place de plus en plus importante dans la vie quotidienne. Toutefois, leur potentiel est mal exploité pour le déplacement des personnes à mobilité réduite (PMR). À cet égard, le projet MobiliSIG a vu le jour. Son objectif est de développer une solution d'assistance multimodale mobile selon les principes de la conception cognitive pour la navigation des PMR. Au cœur de cette solution se trouve une base de données d'accessibilité dont l'usage permettra de proposer des itinéraires adaptés aux profils des utilisateurs. Cependant, vu que l'environnement évolue et que certains obstacles ont un caractère spatio-temporel, l'outil développé doit être doté d'un système qui lui permettra de rester continuellement à jour. L'objectif global assigné à notre projet est la conception d'un système automatique de mise à jour (MÀJ) continuelle des données d'accessibilité en temps quasi-réel à partir de données multi-sources hétérogènes. Pour ce faire, tout d'abord, nous avons passé en revue la littérature inhérente aux concepts relatifs à notre problématique. Ensuite, nous avons créé et implémenté une ontologie d'obstacles/facilitateurs sur la base des facteurs environnementaux de la classification PPH afin d'identifier et de bien cibler les données spatio-temporelles d'accessibilité. Par la suite, nous avons déterminé les besoins et fonctionnalités utiles à notre système de MÀJ à travers la présentation et l'analyse des spécifications des données d'accessibilité et de différents scénarios de cas d'utilisations. Finalement, en s'inspirant des concepts fondamentaux des processus ETL et des architectures orientées services, nous avons proposé une solution composée d'une couche d'extraction automatique de multi-sources; une couche de transformation qui répond au besoin du multi-formats; une application web pour les collaborateurs; et un service web de MÀJ chargé des tâches de traitement automatique et en temps quasi-réel de l'information reçue de multi-sources en effectuant l'analyse syntaxique et sémantique, la géolocalisation, le géocodage, la projection du système de référence le cas échéant, la validation et le contrôle d'unicité avant de procéder au chargement. Les résultats des tests et validations du prototype développé ont permis de confirmer l'atteinte de l'objectif de la recherche.

Doctorat en philosophie et lettres / info:eu-repo/semantics/nonPublished

La théorie des fonctions des croyances offre des outils puissants pour modéliser et traiter les informations imparfaites. En effet, cette théorie peut représenter l'incertitude,l'imprécision et l'ignorance. Dans ce contexte, les données sont stockées dans des bases de données spécifiques qu'on appelle les bases de données crédibilistes. Une base de donnée crédibiliste a deux niveaux d'incertitudes: (i) l'incertitude au niveau des attributs qui se manifeste à travers des degrés de véracité sur les hypothèses des attributs; (ii) l'incertitude au niveau des tuples représentée par des intervalles de confiance sur l'existence des tuples au sein de la table en question. D'autre part, la base de donnée crédibiliste peut être modélisée sous deux formes: (i) la forme compacte caractérisée par un ensemble d'attributs et un ensemble de tuples; (ii) la forme des mondes possibles représentée par un ensemble de base de données candidates où chaque base candidate est une représentation possible de la base de donnée compacte. Interroger la représentation des mondes possibles est une étape fondamentale pour valider les méthodes d'interrogation sur la base compacte crédibiliste. En effet, un modèle de base de donnée est dit système fort si le résultat de l'interrogation de sa représentation compacte est équivalent au résultat de l'interrogation de sa représentation des mondes possibles.Cette thèse est une étude sur les fondements des bases de données crédibilistes. Les contributions sont résumées comme suit:(i) La modélisation et l'interrogation de la base crédibiliste (EDB): Nous mettons en pratique le modèle compacte de la base de données (EDB) en proposant une implémentation objet-relationnelle, ce qui permet d'introduire l'interrogation de ce modèle avec les opérateurs relationnels. D'autres part, nous présentons le formalisme, les algorithmes et les expérimentations d'autres types de requêtes :les top-k évidentiel et le skyline évidentiel que nous appliquons sur des données réelles extraites de la plateforme Tripadvisor.(ii) La modélisation de la base de données sous sa forme des mondes possibles: Nous modélisons la forme de mondes possibles de la base de données (EDB) en traitant les deux niveaux d'incertitudes (niveau attributs et niveau tuples).(iii) La modélisation et l'interrogation de la base de données crédibiliste (ECD): Après avoir prouvé que le modèle des bases de données (ED B) n'est pas un système de représentation fort, nous développons le modèle de la base de données crédibiliste conditionnelle nommée (ECD). Nous présentons le formalisme de l’interrogation sur les deux formes (compacte et mondes possibles) de la base de données (ECD). Finalement, nous discutons les résultats de ces méthodes d'interrogation et les spécificités du modèle (ECD). / The theory of belief functions (a.k.a, the Evidence Theory) offers powerful tools to mode! and handle imperfect pieces of information. Thus, it provides an adequate framework able to represent conjointly uncertainty, imprecision and ignorance. In this context, data are stored in a specific database model called evidential databases. An evidential database includes two levels of uncertainty: (i) the attribute level uncertainty expressed via some degrees of truthfulness about the hypotheses in attributes; (ii) the tuple level uncertainty expressed through an interval of confidence about the existenceof the tuple in the table. An evidential database itself can be modeled in two forms:(i) the compact form represented as a set of attributes and a set of tuples; (ii) the possible worlds' form represented as a set of candidate databases where each candidate is a possible representation of the imperfect compact database. Querying the possible worlds' form is a fundamental step in order to check the querying methods over the compact one. In fact, a model is said to be a strong representation system when results of querying its compact form are equivalent to results of querying its non compact form.This thesis focuses on foundations of evidential databases in both modeling and querying. The main contributions are summarized as follows:(i) Modeling and querying the compact evidential database (EDB): We implement the compact evidential database (EDB) using the object-relational design which allows to introduce the querying of the database model under relational operators. We also propose the formalism, the algorithms and the experiments of other typesof queries: the evidential top-k and the evidential skyline that we apply over a real dataset extracted from TripAdvisor.(ii) Modeling the possible worlds' form of (EDB): We model the possible worlds' form of the evidential database (EDB) by treating both levels of uncertainty (the tuple leve! and the attribute level).(iii) Modeling and querying the evidential conditional database (ECD): After provingt hat the evidential database (EDB) is not a strong representation system, we develop a new evidential conditional database model named (ECD). Thus, we present the formalism of querying the compact and the possible worlds' forms of the (ECD) to evaluate the querying methods under relational operators. Finally, we discuss the results of these querying methods and the specificities of the (ECD)model.

Thèse diffusée initialement dans le cadre d'un projet pilote des Presses de l'Université de Montréal/Centre d'édition numérique UdeM (1997-2008) avec l'autorisation de l'auteur. / Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal. / De nos jours, les entreprises manipulent de gros volumes d'information toujours plus complexes, aussi bien dans leur nature que dans leur structure. Ces informations peuvent être regroupées en deux catégories : les données opérationnelles qui sont utilisées pour la gestion des entreprises et les connaissances corporatives qui constituent le savoir-faire de l'entreprise. Cette dernière catégorie fait actuellement l'objet d'importants travaux de recherche portant sur la représentation des savoir-faire de l'entreprise. Il s'agit alors de représenter d'une part les connaissances formelles comme les processus d'affaires, les procédures ou les politiques (mission, règlements, normes) et d'autre part les connaissances informelles comme les meilleures pratiques ou encore la culture de l'entreprise. Dans les systèmes de gestion traditionnels, les données opérationnelles sont structurées conformément à des modèles classiques (système comptable, système de paie, etc.) et évoluent peu. Par opposition, les connaissances corporatives sont souvent non structurées ou semi-structurées, elles évoluent beaucoup et elles nécessitent la description de la connaissance sur ces données (métadonnées). Dans ce contexte, les systèmes de gestion de bases de données existants (relationnels ou orientés objet) sont peu adaptés car les traitements des données et des métadonnées diffèrent. Dans cette thèse, nous proposons une approche basée sur le traitement uniforme des données et métadonnées. Nos travaux portent sur la spécification d'un formalisme capable de représenter d'une manière uniforme ces deux types de données. Ces travaux de métamodélisation sont basés sur les graphes conceptuels, un formalisme puissant, fondé sur la logique et permettant de modéliser les objets du discours par des concepts et des relations conceptuelles. À partir de ce formalisme, nous proposons un langage et un ensemble d'opérateurs permettant de modéliser et de manipuler d'une manière uniforme les différents niveaux de représentation de la connaissance. Ce formalisme et ce langage constituent un premier pas vers la réalisation d'outils permettant aux entreprises de capitaliser sur leur savoir-faire. Cette approche a été validée d'une manière théorique à travers la modélisation des modèles d'expertise de la méthode CommonKADS. En n une validation pratique a été réalisée par la constitution de mémoires d'entreprise contenant le savoir-faire et les meilleurs pratiques dans des domaines tels que l'aéronautique, les technologies de l'information et les banques.

La mise en registre 3D (opération parfois appelée alignement) est un processus de transformation d’ensembles de données 3D dans un même système de coordonnées afin d’en aligner les éléments communs. Deux ensembles de données alignés ensemble peuvent être les scans partiels des deux vues différentes d’un même objet. Ils peuvent aussi être deux modèles complets, générés à des moments différents, d’un même objet ou de deux objets distincts. En fonction des ensembles de données à traiter, les méthodes d’alignement sont classées en mise en registre rigide ou non-rigide. Dans le cas de la mise en registre rigide, les données sont généralement acquises à partir d’objets rigides. Le processus de mise en registre peut être accompli en trouvant une seule transformation rigide globale (rotation, translation) pour aligner l’ensemble de données source avec l’ensemble de données cible. Toutefois, dans le cas non-rigide, où les données sont acquises à partir d’objets déformables, le processus de mise en registre est plus difficile parce qu’il est important de trouver à la fois une transformation globale et des déformations locales. Dans cette thèse, trois méthodes sont proposées pour résoudre le problème de mise en registre non-rigide entre deux ensembles de données (représentées par des maillages triangulaires) acquises à partir d’objets déformables. La première méthode permet de mettre en registre deux surfaces se chevauchant partiellement. La méthode surmonte les limitations des méthodes antérieures pour trouver une grande déformation globale entre deux surfaces. Cependant, cette méthode est limitée aux petites déformations locales sur la surface afin de valider le descripteur utilisé. La seconde méthode est s’appuie sur le cadre de la première et est appliquée à des données pour lesquelles la déformation entre les deux surfaces est composée à la fois d’une grande déformation globale et de petites déformations locales. La troisième méthode, qui se base sur les deux autres méthodes, est proposée pour la mise en registre d’ensembles de données qui sont plus complexes. Bien que la qualité que elle fournit n’est pas aussi bonne que la seconde méthode, son temps de calcul est accéléré d’environ quatre fois parce que le nombre de paramètres optimisés est réduit de moitié. L’efficacité des trois méthodes repose sur des stratégies via lesquelles les correspondances sont déterminées correctement et le modèle de déformation est exploité judicieusement. Ces méthodes sont mises en oeuvre et comparées avec d’autres méthodes sur diverses données afin d’évaluer leur robustesse pour résoudre le problème de mise en registre non-rigide. Les méthodes proposées sont des solutions prometteuses qui peuvent être appliquées dans des applications telles que la mise en registre non-rigide de vues multiples, la reconstruction 3D dynamique, l’animation 3D ou la recherche de modèles 3D dans des banques de données. / Three-dimensional registration (sometimes referred to as alignment or matching) is the process of transforming many 3D data sets into the same coordinate system so as to align overlapping components of these data sets. Two data sets aligned together can be two partial scans from two different views of the same object. They can also be two complete models of an object generated at different times or even from two distinct objects. Depending on the generated data sets, the registration methods are classified into rigid registration or non-rigid registration. In the case of rigid registration, the data is usually acquired from rigid objects. The registration process can be accomplished by finding a single global rigid transformation (rotation, translation) to align the source data set with the target data set. However, in the non-rigid case, in which data is acquired from deformable objects, the registration process is more challenging since it is important to solve for both the global transformation and local deformations. In this thesis, three methods are proposed to solve the non-rigid registration problem between two data sets (presented in triangle meshes) acquired from deformable objects. The first method registers two partially overlapping surfaces. This method overcomes some limitations of previous methods to solve large global deformations between two surfaces. However, the method is restricted to small local deformations on the surface in order to validate the descriptor used. The second method is developed from the framework of the first method and is applied to data for which the deformation between the two surfaces consists of both large global deformation and small local deformations. The third method, which exploits both the first and second method, is proposed to solve more challenging data sets. Although the quality of alignment that is achieved is not as good as the second method, its computation time is accelerated approximately four times since the number of optimized parameters is reduced by half. The efficiency of the three methods is the result of the strategies in which correspondences are correctly determined and the deformation model is adequately exploited. These proposed methods are implemented and compared with other methods on various types of data to evaluate their robustness in handling the non-rigid registration problem. The proposed methods are also promising solutions that can be applied in applications such as non-rigid registration of multiple views, 3D dynamic reconstruction, 3D animation or 3D model retrieval.

En droit positif belge, il n'existe aucun principe général permettant l'appropriation de l'information.

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Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

La génomique comparée est essentiellement une forme de fouille de données dans des grandes collections de relations n-aires. La croissance du nombre de génomes sequencés créé un stress sur la génomique comparée qui croit, au pire géométriquement, avec la croissance en données de séquence. Aujourd'hui même des laboratoires de taille modeste obtient, de façon routine, plusieurs génomes à la fois - et comme des grands consortia attend de pouvoir réaliser des analyses tout-contre-tout dans le cadre de ses stratégies multi-génomes. Afin d'adresser les besoins à tous niveaux il est nécessaire de repenser les cadres algorithmiques et les technologies de stockage de données utilisés pour la génomique comparée. Pour répondre à ces défis de mise à l'échelle, dans cette thèse nous développons des méthodes originales basées sur les technologies NoSQL et MapReduce. À partir d'une caractérisation des sorts de données utilisés en génomique comparée et d'une étude des utilisations typiques, nous définissons un formalisme pour le Big Data en génomique, l'implémentons dans la plateforme NoSQL Cassandra, et évaluons sa performance. Ensuite, à partir de deux analyses globales très différentes en génomique comparée, nous définissons deux stratégies pour adapter ces applications au paradigme MapReduce et dérivons de nouveaux algorithmes. Pour le premier, l'identification d'événements de fusion et de fission de gènes au sein d'une phylogénie, nous reformulons le problème sous forme d'un parcours en parallèle borné qui évite la latence d'algorithmes de graphe. Pour le second, le clustering consensus utilisé pour identifier des familles de protéines, nous définissons une procédure d'échantillonnage itérative qui converge rapidement vers le résultat global voulu. Pour chacun de ces deux algorithmes, nous l'implémentons dans la plateforme MapReduce Hadoop, et évaluons leurs performances. Cette performance est compétitive et passe à l'échelle beaucoup mieux que les algorithmes existants, mais exige un effort particulier (et futur) pour inventer les algorithmes spécifiques. / Comparative genomics is essentially a form of data mining in large collections of n-ary relations between genomic elements. Increases in the number of sequenced genomes create a stress on comparative genomics that grows, at worse geometrically, for every increase in sequence data. Even modestly-sized labs now routinely obtain several genomes at a time, and like large consortiums expect to be able to perform all-against-all analyses as part of these new multi-genome strategies. In order to address the needs at all levels it is necessary to rethink the algorithmic frameworks and data storage technologies used for comparative genomics.To meet these challenges of scale, in this thesis we develop novel methods based on NoSQL and MapReduce technologies. Using a characterization of the kinds of data used in comparative genomics, and a study of usage patterns for their analysis, we define a practical formalism for genomic Big Data, implement it using the Cassandra NoSQL platform, and evaluate its performance. Furthermore, using two quite different global analyses in comparative genomics, we define two strategies for adapting these applications to the MapReduce paradigm and derive new algorithms. For the first, identifying gene fusion and fission events in phylogenies, we reformulate the problem as a bounded parallel traversal that avoids high-latency graph-based algorithms. For the second, consensus clustering to identify protein families, we define an iterative sampling procedure that quickly converges to the desired global result. For both of these new algorithms, we implement each in the Hadoop MapReduce platform, and evaluate their performance. The performance is competitive and scales much better than existing solutions, but requires particular (and future) effort in devising specific algorithms.

Le contexte international de la pharmacoépidémiologie, marqué par la mise en œuvre d’un nombre croissant d’études multi-sources, a fait émerger un certain nombre de questionnements autour de la gestion de données conflictuelles ou de l’impact des choix méthodologiques sur les résultats.Accroître la confiance dans ces études observationnelles et renforcer leur crédibilité face aux données issues des essais cliniques représente un enjeu majeur, qui dépend étroitement de la robustesse des conclusions produites. Dans ce domaine, la mesure de l’exposition médicamenteuse revêt donc une importance toute particulière, tant pour des études portant sur l’estimation d’un risque ou d’un critère d’efficacité, que lors de la description des modalités d’utilisation en vie réelle. L’exposition médicamenteuse reste un phénomène complexe qui se caractérise la plupart du temps par des cycles discontinus, marqués par des évolutions de doses et la présence de médicaments concomitants. Compte tenu des caractéristiques pharmacodynamiques et pharmacocinétiques / The multinational context of pharmacoepidemiology, and the resulting increased number ofmulti-sources studies have generated concerns in relation with conflicting results and the question of the impact of methodological choices on study results. Increasing the confidence in the conclusions derived from these observational studies is a crucial issue, which is closely related to the robustness of the evidence produced. In this area, impact of drug exposure measurement and risk window might be crucial.Drug exposure is mostly characterized by discontinuous episodes, marked by changes in doses and presence of concomitant medications. Considering the pharmacokinetic and pharmacodynamics characteristics specific to each individual drug, the way in which the drug exposure is presented is of great importance. However, methods used for handling drug exposure episodes in electronic healthcare databases are varying widely according studies. However, the impact of these methods