La aplicación de la PCR al diagnóstico de las enfermedades infecciosas vienesiendo una realidad en los últimos años. No obstante, su aplicación como instrumentodiagnóstico rutinario en los laboratorios clínicos requiere de la adecuación de la técnica alas características peculiares de estos laboratorios que necesitan procesar un elevadonúmero de muestras y dar respuesta en el menor tiempo posible a múltiples situacionesclínicas.El objeto de este estudio es encontrar y evaluar un diseño de diagnóstico por PCRque permita conjugar las ventajas de las técnicas de amplificación con las necesidades ycaracterísticas de un laboratorio clínico.Con esta finalidad hemos escogido una serie de patologías infecciosas queconsideramos importantes y frecuentes en medio hospitalario (infecciones respiratorias,tuberculosis, infecciones bacterianas del SNC, infecciones en inmunodeprimidos), asícomo otras patologías menos frecuentes pero cuyo diagnóstico está cubiertodeficitariamente por la Microbiología tradicional. Sobre este tipo de pacientes hemosaplicado y evaluado la PCR como técnica diagnóstica utilizando aquellas metodologías yequipamientos que se adaptan mejor a las características de un laboratorio clínico.Los resultados obtenidos demuestran que la PCR, en el nivel de desarrollo en quese encuentra actualmente, mejora en todos los casos el diagnóstico obtenido por losmétodos clásicos, aporta en ocasiones un método diagnóstico alternativo mucho mássencillo y rápido que aquellos, ofrece los resultados en un tiempo útil para el clínico ytodo ello puede conseguirse sin alterar la actividad rutinaria del laboratorio ni lospresupuestos ordinarios del mismo.