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Status taxonômico de Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Crustacea, Decapoda, Axiidea, Callianassidae) da costa brasileira: taxonomia, sistemática molecular, biologia populacional e reprodutiva / Taxonomic status of Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Crustacea, Decapoda, Axiidea, Callianassidae) from the Brazilian coast: taxonomy, molecular systematics, population biology and reproductive biology

Peiró, Douglas Fernando 21 November 2012 (has links)
Esta tese trata, primariamente, da definição do status taxonômico do amplamente conhecido corrupto de praia ou ghost shrimp Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Decapoda, Axiidea, Callianassidae) ocorrente na costa brasileira (Capítulo I). A definição deste táxon era um tanto incerta até o momento, levando-se em conta a grande similaridade morfológica entre as espécies que compõem o complexo C. major. Alguns estudos morfológicos, moleculares e larvais foram realizados anteriormente de forma isolada, e sem uma abrangência ao longo de toda sua área de distribuição. Entretanto, nenhum destes estudos foi conclusivo quanto à validade ou não do nome C. major ser aplicado à espécie brasileira. De forma complementar, esta tese objetivou o estudo sobre o investimento reprodutivo e sobre a ecologia populacional de uma de suas populações do litoral norte do Estado de São Paulo (Capítulos II e III, respectivamente). Os resultados desta tese são apresentados em capítulos separados, devido ao fato deles tratarem de assuntos distintos envolvendo a taxonomia/sistemática molecular, biologia reprodutiva e a ecologia populacional da espécie. Cada capítulo contém suas próprias sessões: Resumo, Introdução, Material & Métodos, Resultados, Discussão e Referências. Também, cada capítulo apresentado nesta tese é equivalente a um artigo submetido ou a ser submetido a revistas científicas e encontram-se formatados de acordo com as normas das revistas escolhidas. / This thesis is primarily about the taxonomic status of the ghost shrimp Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Decapoda, Axiidea, Callianassidae) from Brazilian coastlines (Chapter I). The taxonomic status of C. major complex was uncertain until now, due to the very large range of distribution and morphological characters shared among species. Some morphologic, molecular and larval studies were made in isolated perspective and without a distribution range overview before that. None of them were conclusive about the validity to name C. major been applied for the Brazilian species. In a complementary way, this thesis aimed the reproductive output and the population ecology of the species in a sandy beach in the North Shore, State of São Paulo, Brazil (Chapters II and III, respectively). The results of this thesis were presented in distinct chapters due to different approaches related to taxonomy/systematics, reproductive biology and population ecology of this species. Each chapter has its own sections: Abstract, Introduction, Material and Methods, Results, Discussion and References. Those chapters are equivalent to an article submitted or to be submitted to scientific journals, and are formatted according to the author guidelines of each journal.
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Status taxonômico de Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Crustacea, Decapoda, Axiidea, Callianassidae) da costa brasileira: taxonomia, sistemática molecular, biologia populacional e reprodutiva / Taxonomic status of Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Crustacea, Decapoda, Axiidea, Callianassidae) from the Brazilian coast: taxonomy, molecular systematics, population biology and reproductive biology

Douglas Fernando Peiró 21 November 2012 (has links)
Esta tese trata, primariamente, da definição do status taxonômico do amplamente conhecido corrupto de praia ou ghost shrimp Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Decapoda, Axiidea, Callianassidae) ocorrente na costa brasileira (Capítulo I). A definição deste táxon era um tanto incerta até o momento, levando-se em conta a grande similaridade morfológica entre as espécies que compõem o complexo C. major. Alguns estudos morfológicos, moleculares e larvais foram realizados anteriormente de forma isolada, e sem uma abrangência ao longo de toda sua área de distribuição. Entretanto, nenhum destes estudos foi conclusivo quanto à validade ou não do nome C. major ser aplicado à espécie brasileira. De forma complementar, esta tese objetivou o estudo sobre o investimento reprodutivo e sobre a ecologia populacional de uma de suas populações do litoral norte do Estado de São Paulo (Capítulos II e III, respectivamente). Os resultados desta tese são apresentados em capítulos separados, devido ao fato deles tratarem de assuntos distintos envolvendo a taxonomia/sistemática molecular, biologia reprodutiva e a ecologia populacional da espécie. Cada capítulo contém suas próprias sessões: Resumo, Introdução, Material & Métodos, Resultados, Discussão e Referências. Também, cada capítulo apresentado nesta tese é equivalente a um artigo submetido ou a ser submetido a revistas científicas e encontram-se formatados de acordo com as normas das revistas escolhidas. / This thesis is primarily about the taxonomic status of the ghost shrimp Callichirus major (Say, 1818) sensu lato (Decapoda, Axiidea, Callianassidae) from Brazilian coastlines (Chapter I). The taxonomic status of C. major complex was uncertain until now, due to the very large range of distribution and morphological characters shared among species. Some morphologic, molecular and larval studies were made in isolated perspective and without a distribution range overview before that. None of them were conclusive about the validity to name C. major been applied for the Brazilian species. In a complementary way, this thesis aimed the reproductive output and the population ecology of the species in a sandy beach in the North Shore, State of São Paulo, Brazil (Chapters II and III, respectively). The results of this thesis were presented in distinct chapters due to different approaches related to taxonomy/systematics, reproductive biology and population ecology of this species. Each chapter has its own sections: Abstract, Introduction, Material and Methods, Results, Discussion and References. Those chapters are equivalent to an article submitted or to be submitted to scientific journals, and are formatted according to the author guidelines of each journal.
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Relações sedimentologia-geomorfologia-hidrologia e seus efeitos na gênese de Espodossolos sob Restinga na Ilha Comprida-SP / Relationships between sedimentology-geomorphology-hydrology and its effects on Spodosol genesis under Restinga vegetation at Ilha Comprida-SP

Martinez, Pedro Henrique Rodrigues de Moraes 15 April 2015 (has links)
A Ilha Comprida formou-se no Quaternário tardio e é uma ilha barreira arenosa composta de um conjunto de superfícies de rugosidade moderada à plana, nas quais se formaram Espodossolos com padrões variados de desenvolvimento e morfologia. Essa pesquisa utilizou a abordagem multiescalar, com observações e descrições através de sensoriamento remoto, topocronossequências, perfis, horizontes e seções delgadas de solo. O levantamento cartográfico com o auxílio de fotografias aéreas 1:16.000 do setor sul da Ilha Comprida permitiu mapear as feições geomorfológicas de cordões praiais, áreas planas, reentrâncias de manguezais, dunas frontais (cordões eólicos), rupturas de deflação (blow-outs) e bordas de terraços. O estudo baseou-se em dois perfis transversais (leste-oeste) com 3 km de extensão, onde foi possível identificar diversas unidades de crescimento sedimentar. As transeções A-B e C-D estão situadas no interior e na falésia sul da ilha, respectivamente. Comparando-se os solos dessas transeções é possível constatar o papel desempenhado pela evolução da drenagem na formação, manutenção e degradação dos horizontes espódicos. A degradação dos horizontes espódicos da transeção C-D está ligada à abertura de canais de raízes onde se instalam fluxos preferenciais de água, somado a atividade decompositora de Acidobactérias. Foram realizados levantamentos topográficos e da configuração vertical e lateral dos horizontes dos solos das transeções, sendo instalados 14 poços de monitoramento do nível freático na transeção A-B. As informações do relevo, solo e dinâmica atual do lençol freático permitiram identificar cinco compartimentos morfopedológicos. Os compartimentos I, II e IV, com maior rugosidade do terreno, possuem Espodossolos bem desenvolvidos providos de ortstein na zona próxima ao limite de oscilação do lençol freático, enquanto o compartimento III é mais plano e apresenta Espodossolos Hidromórficos e Organossolos. No compartimento V, mais recente, a podzolização é incipiente. As análises de estatística da distribuição das areias e micromorfologia indicam que a granulometria e o ajuste espacial dos grãos de areia de certas camadas sedimentares, atuam no acúmulo de Matéria Orgânica Dissolvida (MOD) através do acentuado gradiente de condutividade hidráulica ou por quebra de capilaridade. O resultado é a formação de bandas e horizontes cimentados (Bhm) em determinados contatos estratigráficos. Os cordões e entre-cordões praiais convergentes para à Ponta da Trinheira (sudoeste da ilha) controlam a direção dos fluxos hídricos superficiais e subsuperficiais do local, funcionando como escoadouro de MOD, cujo aporte contínuo e lateral explicaria a formação dos horizontes Bhm gigantes que sustentam o limite territorial em forma de \"L\". A descida gradual e contínua do NRM e o efeito de borda na falésia sul ocorrido após sua erosão colaboraram para o dessecamento e hiperdesenvolvimento do ortstein deste local. O horizonte glei (2Cg) é um paleomangue e ocorre de forma pontual na face lagunar da ilha. Seu impedimento à drenagem limita o avanço da podzolização em profundidade, formando o horizonte Bhm acima do horizonte 2Cg. Algumas raízes e paleogalerias tubulares de Callichirus major, preenchidas por areia, promovem bioturbações capazes de condicionar o acúmulo e cimentação de MOD. As galerias formadas pelo crustáceo são holocênicas e a manutenção de seus vestígios até os dias atuais se deve ao processo de pedofossilização por podzolização. / Formed since the late Quaternary period, the Ilha Comprida is made up by a set of geomorphological units depicted whether by rough or smooth surfaces, where both have Spodosols with a range of morphology and development stages. Multiscale approach has been applies through the spatial representation of topochronossequences, soil profiles, soil horizons and soil thin sections. Cartography survey of the south Ilha Comprida has been aided by aerial photos, allowed to mapping geomorphological features: beach ridge and swales; plan surfaces; coves with mangrove recesses; and edge of terrains. The study was based on two transversal profiles (east-west) with nearly 3 km of width, located at southernmost of Ilha Comprida, where there are several growth units. There transections A-B and C-D are located inland and at the cliffs, respectively. The soils from these transections show the role play by drainage conditions on formation and degradation of spodic horizon. The degradation of spodic horizons through transection C-D is linked to the preferential flow channels created by roots growth, plus by the decomposition activities of Acidbacterias. Traditional topography survey and lateral configuration of soils has been draw to depict these transections, where 14 wells were deployed for water table monitoring (transection A-B).The relief, soil, and water table information allowed the delimiting of five morphopedologic compartments. The compartments I, II and IV has rough surfaces (higher and close beach ridges) with Spodosol well developed provided with ortstein at oscillation zone of water table, while compartment III is a flat surface with Hydromorphic Spodosol and Histosols. Compartment V is the youngest surface and has incipient podsolization. Statistic of sand grain size and micromorphology analysis indicates that granulometry and spatial sand arrangement of some sedimentary package, deal with Dissolved Organic Matter (DOM) accumulation through high hydraulic conductivity gradient or capillarity breaks. It results in formation of bands and commentated horizons (Bhm) at some stratigraphic boundaries. The presence of beach ridges and swales alignments convergent towards southwest of Ilha Comprida, plus the directions of local hydrography flows, implies that the swales are channels of DOM, which contribute to ortstein formation at Ponta da Trincheira. The slow decreasing of sea level along the Holocene, in addition to the edge effect upon erosion of the south sandy cliff, also played a role to ortstein genesis. Gley horizon (2Cg) with mineralogical assemblage similar to the soils found in the mangrove, suggest that some mangroves has been buried by the costal dynamics typical in infra-tidal environment. Currently, these buried horizons occur locally and plays a impediments for drainage, which is expressed in accumulation and cementation by organic matter (Bhm horizon). Some roots and Callichirus major fossils entail bioturbation that also enable accumulation and cementation of DOM. This icnofossils might have been preserved through pedofossilization by the podsolization process itself.
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Relações sedimentologia-geomorfologia-hidrologia e seus efeitos na gênese de Espodossolos sob Restinga na Ilha Comprida-SP / Relationships between sedimentology-geomorphology-hydrology and its effects on Spodosol genesis under Restinga vegetation at Ilha Comprida-SP

Pedro Henrique Rodrigues de Moraes Martinez 15 April 2015 (has links)
A Ilha Comprida formou-se no Quaternário tardio e é uma ilha barreira arenosa composta de um conjunto de superfícies de rugosidade moderada à plana, nas quais se formaram Espodossolos com padrões variados de desenvolvimento e morfologia. Essa pesquisa utilizou a abordagem multiescalar, com observações e descrições através de sensoriamento remoto, topocronossequências, perfis, horizontes e seções delgadas de solo. O levantamento cartográfico com o auxílio de fotografias aéreas 1:16.000 do setor sul da Ilha Comprida permitiu mapear as feições geomorfológicas de cordões praiais, áreas planas, reentrâncias de manguezais, dunas frontais (cordões eólicos), rupturas de deflação (blow-outs) e bordas de terraços. O estudo baseou-se em dois perfis transversais (leste-oeste) com 3 km de extensão, onde foi possível identificar diversas unidades de crescimento sedimentar. As transeções A-B e C-D estão situadas no interior e na falésia sul da ilha, respectivamente. Comparando-se os solos dessas transeções é possível constatar o papel desempenhado pela evolução da drenagem na formação, manutenção e degradação dos horizontes espódicos. A degradação dos horizontes espódicos da transeção C-D está ligada à abertura de canais de raízes onde se instalam fluxos preferenciais de água, somado a atividade decompositora de Acidobactérias. Foram realizados levantamentos topográficos e da configuração vertical e lateral dos horizontes dos solos das transeções, sendo instalados 14 poços de monitoramento do nível freático na transeção A-B. As informações do relevo, solo e dinâmica atual do lençol freático permitiram identificar cinco compartimentos morfopedológicos. Os compartimentos I, II e IV, com maior rugosidade do terreno, possuem Espodossolos bem desenvolvidos providos de ortstein na zona próxima ao limite de oscilação do lençol freático, enquanto o compartimento III é mais plano e apresenta Espodossolos Hidromórficos e Organossolos. No compartimento V, mais recente, a podzolização é incipiente. As análises de estatística da distribuição das areias e micromorfologia indicam que a granulometria e o ajuste espacial dos grãos de areia de certas camadas sedimentares, atuam no acúmulo de Matéria Orgânica Dissolvida (MOD) através do acentuado gradiente de condutividade hidráulica ou por quebra de capilaridade. O resultado é a formação de bandas e horizontes cimentados (Bhm) em determinados contatos estratigráficos. Os cordões e entre-cordões praiais convergentes para à Ponta da Trinheira (sudoeste da ilha) controlam a direção dos fluxos hídricos superficiais e subsuperficiais do local, funcionando como escoadouro de MOD, cujo aporte contínuo e lateral explicaria a formação dos horizontes Bhm gigantes que sustentam o limite territorial em forma de \"L\". A descida gradual e contínua do NRM e o efeito de borda na falésia sul ocorrido após sua erosão colaboraram para o dessecamento e hiperdesenvolvimento do ortstein deste local. O horizonte glei (2Cg) é um paleomangue e ocorre de forma pontual na face lagunar da ilha. Seu impedimento à drenagem limita o avanço da podzolização em profundidade, formando o horizonte Bhm acima do horizonte 2Cg. Algumas raízes e paleogalerias tubulares de Callichirus major, preenchidas por areia, promovem bioturbações capazes de condicionar o acúmulo e cimentação de MOD. As galerias formadas pelo crustáceo são holocênicas e a manutenção de seus vestígios até os dias atuais se deve ao processo de pedofossilização por podzolização. / Formed since the late Quaternary period, the Ilha Comprida is made up by a set of geomorphological units depicted whether by rough or smooth surfaces, where both have Spodosols with a range of morphology and development stages. Multiscale approach has been applies through the spatial representation of topochronossequences, soil profiles, soil horizons and soil thin sections. Cartography survey of the south Ilha Comprida has been aided by aerial photos, allowed to mapping geomorphological features: beach ridge and swales; plan surfaces; coves with mangrove recesses; and edge of terrains. The study was based on two transversal profiles (east-west) with nearly 3 km of width, located at southernmost of Ilha Comprida, where there are several growth units. There transections A-B and C-D are located inland and at the cliffs, respectively. The soils from these transections show the role play by drainage conditions on formation and degradation of spodic horizon. The degradation of spodic horizons through transection C-D is linked to the preferential flow channels created by roots growth, plus by the decomposition activities of Acidbacterias. Traditional topography survey and lateral configuration of soils has been draw to depict these transections, where 14 wells were deployed for water table monitoring (transection A-B).The relief, soil, and water table information allowed the delimiting of five morphopedologic compartments. The compartments I, II and IV has rough surfaces (higher and close beach ridges) with Spodosol well developed provided with ortstein at oscillation zone of water table, while compartment III is a flat surface with Hydromorphic Spodosol and Histosols. Compartment V is the youngest surface and has incipient podsolization. Statistic of sand grain size and micromorphology analysis indicates that granulometry and spatial sand arrangement of some sedimentary package, deal with Dissolved Organic Matter (DOM) accumulation through high hydraulic conductivity gradient or capillarity breaks. It results in formation of bands and commentated horizons (Bhm) at some stratigraphic boundaries. The presence of beach ridges and swales alignments convergent towards southwest of Ilha Comprida, plus the directions of local hydrography flows, implies that the swales are channels of DOM, which contribute to ortstein formation at Ponta da Trincheira. The slow decreasing of sea level along the Holocene, in addition to the edge effect upon erosion of the south sandy cliff, also played a role to ortstein genesis. Gley horizon (2Cg) with mineralogical assemblage similar to the soils found in the mangrove, suggest that some mangroves has been buried by the costal dynamics typical in infra-tidal environment. Currently, these buried horizons occur locally and plays a impediments for drainage, which is expressed in accumulation and cementation by organic matter (Bhm horizon). Some roots and Callichirus major fossils entail bioturbation that also enable accumulation and cementation of DOM. This icnofossils might have been preserved through pedofossilization by the podsolization process itself.

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