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Identificação e caracterização de sequências repetidas de DNA no genoma de peixes ciclídeos do gênero Cichla /Teixeira, Wellcy Gonçalves. January 2008 (has links)
Orientador: Cesar Martins / Banca: Luciana Bolsoni / Banca: Maeli Del Paiva / Resumo: O genoma dos organismos eucariotos apresenta-se organizado em seqüências simples e repetidas. As seqüências repetidas de DNA estão presentes em centenas a milhares de cópias dispersas ou agrupadas no genoma e localizam-se preferencialmente em regiões heterocromáticas, desempenhando papel relevante na organização do genoma desses organismos. Nesse sentido, a realização de estudos genéticos básicos sobre a organização genômica dessas seqüências repetidas é fundamental para uma melhor compreensão do seu papel biológico assim como o entendimento de sua dinâmica evolutiva entre os diversos grupos de vertebrados. Os Cichlidae constituem uma das mais especiosas famílias de peixes, com cerca de 3.000 espécies distribuídas pela América Central e do Sul, África, e sudeste da Índia. Este grupo passou por um rápido e extenso processo de radiação adaptativa ao longo dos tempos, constituindo-se em importantes entidades biológicas para a realização de estudos evolutivos. Dentre os Cichlidae, as espécies do gênero Cichla (tucunarés), com distribuição exclusiva na América do Sul, apresentam grande importância ecológica e econômica. No entanto, estudos genéticos envolvendo espécies desse gênero são ainda escassos. Assim, o presente trabalho teve por objetivo isolar e caracterizar seqüências repetidas de DNA no genoma de Cichla kelberi. Elementos repetidos de DNA foram isolados por PCR (elementos Rex1, Rex3, Rex6 e Tc1) e digestão enzimática (elemento Tuc), seqüenciados e mapeados cromossomicamente por FISH para o estudo de seu padrão de distribuição no genoma. O elemento Tuc apresentou elevada similaridade com seqüências do gene da transcriptase reversa de Oryzias melastigma, o que sugere tratar-se de um elemento retrotransponível. Análises comparativas do elemento Tuc a bancos de sequência mostraram alta similaridade... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The genome of eucaryote organisms is organized into single and repetitive sequences. The repetitive DNA sequences are represented by hundreds to thousands of dispersed or tandem-arrayed copies preferentially localized on the heterochromatic regions, having important function on the genome organization of the organisms. Therefore, the development of basic genetic studies about the genome organization of these repetitive sequences are fundamental to a better comprehension of their biologic role and the understanding of their evolutionary dinamics. The Cichlidae are one of the most diverse fish families, having about 3.000 species distributed around Central and South America, Africa and Southeast India. This group underwent a large and rapid process of adaptative radiation, becoming an important biological model. Among the Cichlidae, the species of the genera Cichla (tucunarés), with exclusive distribution in South America, have a significative economic and ecologic importance. However genetic studies on species of this genera are scarce. Therefore, this work had the aim to isolate and characterize repetitive DNA sequences of the genome of Cichla kelberi. Repetitive DNA sequences were isolated using PCR (elements Rex1, Rex3, Rex6 and Tc1) and restriction digestion (element Tuc), sequenced and their genome distribution determined by FISH. The Tuc element showed high similarity to sequences of reverse transcriptase gene of the fish Oryzias melastigma, which suggests that such element correspond to an retrotransposon element. Comparative analysis of the Tuc element to DNA sequence data bank showed high similarity with repetitive sequences in the genome of several vertebrates, including fishes, amphibians and mammals. Results of FISH showed an accumulation of obtained elements preferentially in centromeres of all chromosomes of the complement, and few telomeric blocks in some... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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A homogeneidade de tamanho aumenta as interações agressivas em machos revertidos de tilápia-do-nilo, linhagem GIFT /Boscolo, Camila Nomura Pereira. January 2011 (has links)
Orientador: Eliane Gonçalves de Freitas / Banca: Marisa Fernandes de Castilho / Banca: José Eurico Possebon Cyrino / Resumo: Animais com a mesma habilidade de luta podem lutar por mais tempo e intensamente do que em confrontos assimétricos. Assim, a seleção de peixes pela similaridade de tamanho em manejos da piscicultura pode causar um aumento das interações agressivas e levar à instabilidade social em peixes socialmente organizados. Assim, testou-se a hipótese de que o agrupamento de animais de tamanhos semelhantes aumenta as interações agressivas entre machos de tilápia-do-nilo, linhagem GIFT. Este, por sua vez, aumenta o estresse social e desestabiliza a hierarquia social. Foram comparados dois tratamentos: um grupo homogêneo (HM), formado por cinco machos revertidos com variação de tamanho entre 9,0 e 9,4 cm; e um grupo heterogêneo (HT), formado por cinco animais de tamanhos variando entre 7,5 e 11,5 cm (n=16 para cada tratamento). Os peixes foram mantidos nesses grupos por seis dias, nos quais as interações agonísticas foram registradas a partir do segundo dia de agrupamento (10 min dia-1 - 5 sessões de observação). Níveis de cortisol plasmático e taxa de crescimento específico (TCE) foram utilizados para inferir estresse social. A frequência de interações agonísticas foi maior no HM (média ± S.E: HM = 302,06± 20,13 x 10 min-1; HT = 151,06 ± 13,35 x 10 min-1). Mudanças na posição social ocorreram neste grupo, indicando instabilidade social. Entretanto, os níveis de cortisol (HM = 27,54 ± 3,02 ng mL-1; HT = 24,42 ± 2,41 ng mL-1) e TCE (HM = -0,53 ± 0,04%; HT = -0,64 ± 0,08%) foram similares entre os tratamentos. Dessa forma, conclui-se que o agrupamento de peixes de tamanhos semelhantes aumenta as interações agressivas e desestabiliza a hierarquia social. Assim, apesar de não terem sido encontradas diferenças nos indicadores de estresse, pode-se concluir, com base em comportamento, que o agrupamento de animais de tamanhos semelhante reduz o bem-estar de peixes sociais... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Animals with similar fighting ability can fight intensely and longer than animals in 27 asymmetric contests. Thus, the selection of fish by size similarity in husbandry might increase 28 aggressive interactions, and lead to social instability in socially organized fish. We tested the 29 hypothesis that grouping similar size animals increases aggressive interactions between males of 30 Genetic Improved Farmed Tilapia (GIFT). This, in turn, enhances social stress and destabilizes 31 social hierarchy. We compared two treatments: a homogeneous group (HM) formed by five 32 males ranging in size from 9.0 to 9.4 cm, and a heterogeneous group (HT) formed by five males 33 sizing from 7.5 to 11.5 cm (n = 16 each treatment). The fish were kept in these groups for six 34 days, in which agonistic interactions were video-recorded daily from the second day of 35 grouping (10 min/ day - five observation sessions). Plasma cortisol levels and specific growth 36 rate (SGR) were used to infer stress level. The frequency of agonistic interactions was higher in 37 the HM (mean ± S.E.: HM = 302.06 ± 20.13 x 50 min-1; HT = 151.06 ± 13.35 x 50 min-1). 38 Changes in social position occurred over time in this group, indicating social instability. 39 However, cortisol levels (HM = 27.54 ± 3.02 ng.mL-1; HT = 24.42 ± 2.41 ng.mL-1) and SGR 40 (HM = -0.53 ± 0.04 %; HT = -0.64 ± 0.08 %) were similar between treatments. Thus, we 41 conclude that the grouping of similar size fish increases aggressive interactions and destabilizes 42 social hierarchy. Although no significant differences were found on indicators of stress we can 43 conclude, based on behavior, that groups of similar sized animals reduces the welfare in social 44 fish, because chances of injuries are higher than in heterogeneous groups / Mestre
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