Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:52:55Z : No. of bitstreams: 1 pereira_na_me_jabo.pdf: 364260 bytes, checksum: d1631a7d1f5b0fd3a034d899762088d6 (MD5) / As cigarras da espécie Quesada gigas são consideradaspragas chave nacultura do café, principalmente nos Estados de São Paulo e Minas Gerais. Atualmente, estas cigarras é a espécie principal e a mais prejudicial aocafeeiro einfesta principalmenteo plantiodestes doisEstados. Oobjetivo do trabalho foi estudar a distribuição espacial de Q.gigas de ovos, ovos por postura e ninfas na cultura do café. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais –EPAMIG, no município de São SebastiãodoParaíso – MG,onde foram selecionadostrês áreas de 10.000 m2, subdivididos em 100 parcelas de 10 m x 10m. As cultivares utilizadas foram Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474,Catuaí-30 Vermelho IAC-15, MundoNovo IAC- 501 e Melhoramento Genético. Nas amostragens foram coletados três ramos secos do terço superior de uma planta por parcela, colocadosem sacos depapel, devidamenteetiquetados e transportados para o laboratório. Para se verificar a existência depostura e o número de ovos por postura,foramrealizadas uma abertura longitudinal dosramos secos, com o auxílio deuma lâmina cortante e o auxilio do microscópio esteroscópico.Para oestudo dasninfas vivas, realizou-se a abertura detrincheiras num total de 300 covas de 0,50x0, 50x0, 50m/cova adjacente aotroncodas plantas e em seguida, procedeu à contagem. Para o estudoda dispersão das posturas, ovos por posturas e ninfas no solo foram utilizados os seguintes índices: razão variância/média, índice de Morisita, Coeficiente de Green e expoente k da distribuição binomial negativa. Com relação aos modelos probabilísticos que descrevem a distribuição espacial, foram testados os ajustes às distribuições de Poisson e Binomial Negativa. Concluindo, após a realização dos testes de ajustes aos dados é possível afirmar que a postura e ovos por posturas de... / Cicadas are considered key pests in coffee culture, mainly in the states of São Paulo and Minas Gerais. Currently, the species which is more damaging to coffee is Quesada gigas, which infests mainly the planting of these two states. The objective of this work was to study the oviposition behavior (laying and eggs) and the spatial distribution of Q.gigas in coffee culture. The experiment was conducted at the Experimental Station of the Agricultural Research Corporation of Minas Gerais - EPAMIG, in São Sebastião do Paraíso - MG, where we selected three areas of 10,000 m2, divided into 100 plots of 10 m x 10 m. The cultivars used were Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474 and Catuaí-30 Vermelho IAC-15, Mundo Novo IAC-501, and cultivar Melhoramento Genético (Genetic Enhancement). Three dry branches of the upper third of a plant per plot were collected, placed in paper bags, properly labeled and transported to the laboratory. To verify the existence of oviposition, disposed endophytically, a longitudinal opening of the dry branches was carried out, with the aid of a cutting blade and stereoscopic microscope. For the study of the dispersion of cicada alive nymphs were made trenches of 0.50x0.50x0.50m per hole adjacent to the trunk plants and later, the couting was performed. For this study the following indexes were used: variance/ mean ratio, Morisita index, coefficient of Green k exponent of negative binomial distribution. In relation to the probabilistic models that describe the spatial distribution, the adjustments to distributions of Poisson and negative binomial were tested. In conclusion, after the accomplishment of the adjustments data tests is possible to affirm the...(Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T19:32:18Z : No. of bitstreams: 1 tango_mfa_me_jabo.pdf: 802435 bytes, checksum: 64e0b120910b2ab654a518519f8fc4b0 (MD5) / Os objetivos deste estudo foram identificar os Rogadinae e Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) em uma cultura comercial de café cv. Obatã, Cravinhos, SP; comparar os métodos de amostragem, determinar a flutuação populacional e correlacioná-las com os fatores abióticos (temperatura e pluviosidade) e bióticos (larvas e minas de L. coffeella). A amostragem foi realizada semanalmente entre maio de 2005 e abril de 2007 com 60 armadilhas Moericke instaladas nos terços inferiores e médio das plantas, distribuídas em 20 pontos de amostragem, ativas por 48 horas/semana e, duas armadilhas luminosas modelo Jermy fixadas na altura do dossel do cafeeiro, operadas com lâmpadas de tungstênio de 100W, ativas por dois períodos consecutivos, do anoitecer até o amanhecer. Foram obtidos 1717 exemplares de Orgilinae e Rogadinae. Dos 860 exemplares de Orgilinae, 693 exemplares (80,6% do total) foram coletados no primeiro ano de amostragem e, dos 857 exemplares de Rogadinae, 650 (75,8%), também ocorreram no mesmo período. As condições climáticas no período amostrado foram muito diferentes: no segundo ano foi registrado maior volume de chuvas em alguns meses do ano e temperaturas máximas elevadas e mínimas abaixo da média que, possivelmente, resultaram na menor frequência de captura de Orgilinae e Rogadinae naquele período. De Orgilinae, foram identificadas três espécies: Orgilus niger Penteado-Dias (757 exemplares / 88,0% do total de Orgilinae), Orgilus sp. 1 (71 / 8,3%) e Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3,7%); a primeira foi a mais frequente com picos populacionais em agosto e setembro de 2005. De Rogadinae foram identificadas três espécies nominais: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11,1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2,2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0,7%) e... / The aim of this study was to identify the Rogadinae and Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) in a commercial crop of coffee cv. Obatã, at Cravinhos, São Paulo State, Brazil; compare the sampling methods, determine their population fluctuations and to correlate them with abiotic (temperature and rainfall) and biotic (larvae and mines of Leucoptera coffeella (Guérin-Mèneville) (Lepidoptera: Lyonetiidae)) factors. The samplings were performed weekly between May 2005 and April 2007 with 60 Moericke traps installed at the lower and middle thirds of the coffee plants, distributed in 20 sampling points, and active for 48 hours / week and with two light traps (Jermy Model) operated with 100W tungsten lamps active for two consecutive periods, from nightfall until dawn. A total of 1717 Orgilinae and Rogadinae were obtained. Of the 860 specimens of Orgilinae, 693 (80.6% of total) were collected in the first year of sampling, and of the 857 specimens of Rogadinae, 650 (75.8%) also occurred in the same period. The climatic conditions in the sample period were very different: the second year was recorded more rainfall in some months of the year and higher maximum temperatures and below average minimum which possibly resulted in lower frequency of capture of Orgilinae and Rogadinae in that period. Three species of Orgilinae were identified: Orgilus niger Penteado-Dias (757 specimens / 88.0% of the total of Orgilinae collected), Orgilus sp. 1 (71 / 8.3%) and Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3.7%), the first species was the most frequent, with population peaks in August and September 2005. From Rogadinae were identified three nominal species: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11.1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2.2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0.7%) and 11 morpho-species of Aleiodes (729 / 85.1%) and one morpho-species of Yelicones (1 / 0.1%)...(Complete abstract click electronic access below)

Orientadora: Nilza Maria Martinelli / Coorientador: José Carlos Barbosa / Banca: Arlindo Leal Boiça Junior / Banca: Douglas Henrique Bottura Maccagnan / Resumo: As cigarras da espécie Quesada gigas são consideradaspragas chave nacultura do café, principalmente nos Estados de São Paulo e Minas Gerais. Atualmente, estas cigarras é a espécie principal e a mais prejudicial aocafeeiro einfesta principalmenteo plantiodestes doisEstados. Oobjetivo do trabalho foi estudar a distribuição espacial de Q.gigas de ovos, ovos por postura e ninfas na cultura do café. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais -EPAMIG, no município de São SebastiãodoParaíso - MG,onde foram selecionadostrês áreas de 10.000 m2, subdivididos em 100 parcelas de 10 m x 10m. As cultivares utilizadas foram Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474,Catuaí-30 Vermelho IAC-15, MundoNovo IAC- 501 e Melhoramento Genético. Nas amostragens foram coletados três ramos secos do terço superior de uma planta por parcela, colocadosem sacos depapel, devidamenteetiquetados e transportados para o laboratório. Para se verificar a existência depostura e o número de ovos por postura,foramrealizadas uma abertura longitudinal dosramos secos, com o auxílio deuma lâmina cortante e o auxilio do microscópio esteroscópico.Para oestudo dasninfas vivas, realizou-se a abertura detrincheiras num total de 300 covas de 0,50x0, 50x0, 50m/cova adjacente aotroncodas plantas e em seguida, procedeu à contagem. Para o estudoda dispersão das posturas, ovos por posturas e ninfas no solo foram utilizados os seguintes índices: razão variância/média, índice de Morisita, Coeficiente de Green e expoente k da distribuição binomial negativa. Com relação aos modelos probabilísticos que descrevem a distribuição espacial, foram testados os ajustes às distribuições de Poisson e Binomial Negativa. Concluindo, após a realização dos testes de ajustes aos dados é possível afirmar que a postura e ovos por posturas de...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Cicadas are considered key pests in coffee culture, mainly in the states of São Paulo and Minas Gerais. Currently, the species which is more damaging to coffee is Quesada gigas, which infests mainly the planting of these two states. The objective of this work was to study the oviposition behavior (laying and eggs) and the spatial distribution of Q.gigas in coffee culture. The experiment was conducted at the Experimental Station of the Agricultural Research Corporation of Minas Gerais - EPAMIG, in São Sebastião do Paraíso - MG, where we selected three areas of 10,000 m2, divided into 100 plots of 10 m x 10 m. The cultivars used were Rubi MG-1192, Acácia Cerrado MG-1474 and Catuaí-30 Vermelho IAC-15, Mundo Novo IAC-501, and cultivar Melhoramento Genético (Genetic Enhancement). Three dry branches of the upper third of a plant per plot were collected, placed in paper bags, properly labeled and transported to the laboratory. To verify the existence of oviposition, disposed endophytically, a longitudinal opening of the dry branches was carried out, with the aid of a cutting blade and stereoscopic microscope. For the study of the dispersion of cicada alive nymphs were made trenches of 0.50x0.50x0.50m per hole adjacent to the trunk plants and later, the couting was performed. For this study the following indexes were used: variance/ mean ratio, Morisita index, coefficient of Green k exponent of negative binomial distribution. In relation to the probabilistic models that describe the spatial distribution, the adjustments to distributions of Poisson and negative binomial were tested. In conclusion, after the accomplishment of the adjustments data tests is possible to affirm the...(Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Nelson Wanderley Perioto / Coorientadora: Rogéria Inês Rosa Lara / Banca: Nilza Maria Martinelli / Banca: Valmir Antônio Costa / Resumo: Os objetivos deste estudo foram identificar os Rogadinae e Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) em uma cultura comercial de café cv. Obatã, Cravinhos, SP; comparar os métodos de amostragem, determinar a flutuação populacional e correlacioná-las com os fatores abióticos (temperatura e pluviosidade) e bióticos (larvas e minas de L. coffeella). A amostragem foi realizada semanalmente entre maio de 2005 e abril de 2007 com 60 armadilhas Moericke instaladas nos terços inferiores e médio das plantas, distribuídas em 20 pontos de amostragem, ativas por 48 horas/semana e, duas armadilhas luminosas modelo Jermy fixadas na altura do dossel do cafeeiro, operadas com lâmpadas de tungstênio de 100W, ativas por dois períodos consecutivos, do anoitecer até o amanhecer. Foram obtidos 1717 exemplares de Orgilinae e Rogadinae. Dos 860 exemplares de Orgilinae, 693 exemplares (80,6% do total) foram coletados no primeiro ano de amostragem e, dos 857 exemplares de Rogadinae, 650 (75,8%), também ocorreram no mesmo período. As condições climáticas no período amostrado foram muito diferentes: no segundo ano foi registrado maior volume de chuvas em alguns meses do ano e temperaturas máximas elevadas e mínimas abaixo da média que, possivelmente, resultaram na menor frequência de captura de Orgilinae e Rogadinae naquele período. De Orgilinae, foram identificadas três espécies: Orgilus niger Penteado-Dias (757 exemplares / 88,0% do total de Orgilinae), Orgilus sp. 1 (71 / 8,3%) e Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3,7%); a primeira foi a mais frequente com picos populacionais em agosto e setembro de 2005. De Rogadinae foram identificadas três espécies nominais: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11,1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2,2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0,7%) e...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this study was to identify the Rogadinae and Orgilinae (Hymenoptera: Braconidae) in a commercial crop of coffee cv. Obatã, at Cravinhos, São Paulo State, Brazil; compare the sampling methods, determine their population fluctuations and to correlate them with abiotic (temperature and rainfall) and biotic (larvae and mines of Leucoptera coffeella (Guérin-Mèneville) (Lepidoptera: Lyonetiidae)) factors. The samplings were performed weekly between May 2005 and April 2007 with 60 Moericke traps installed at the lower and middle thirds of the coffee plants, distributed in 20 sampling points, and active for 48 hours / week and with two light traps (Jermy Model) operated with 100W tungsten lamps active for two consecutive periods, from nightfall until dawn. A total of 1717 Orgilinae and Rogadinae were obtained. Of the 860 specimens of Orgilinae, 693 (80.6% of total) were collected in the first year of sampling, and of the 857 specimens of Rogadinae, 650 (75.8%) also occurred in the same period. The climatic conditions in the sample period were very different: the second year was recorded more rainfall in some months of the year and higher maximum temperatures and below average minimum which possibly resulted in lower frequency of capture of Orgilinae and Rogadinae in that period. Three species of Orgilinae were identified: Orgilus niger Penteado-Dias (757 specimens / 88.0% of the total of Orgilinae collected), Orgilus sp. 1 (71 / 8.3%) and Stantonia longicornis (Achterberg) (32 / 3.7%), the first species was the most frequent, with population peaks in August and September 2005. From Rogadinae were identified three nominal species: Stiropius reticulatus Penteado-Dias (95 / 11.1%), Choreborogas puteolus Achterberg (19 / 2.2%), Aleiodes melanopteurus (Erichson) (6 / 0.7%) and 11 morpho-species of Aleiodes (729 / 85.1%) and one morpho-species of Yelicones (1 / 0.1%)...(Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-10Bitstream added on 2014-06-13T20:58:38Z : No. of bitstreams: 1 galvao_jah_me_botfca.pdf: 364076 bytes, checksum: 03533687bb727a4a71cd80170348dc2b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / A ferrugem é a principal doença do cafeeiro e o seu agente causal, Hemileia vastatrix, é parasitado de forma natural por Lecanicillium lecanii, indicando potencial desse fungo para controle biológico. Um dos fatores que comprometem a eficiência de bioagentes é a radiação ultravioleta-B (UV-B). A incidência dessa radiação na superfície da Terra aumentou com a diminuição da camada de ozônio estratosférico, podendo afetar os processos naturais de controle de doenças de plantas e o uso de bioagentes. O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito da radiação UV-B sobre L. lecanii. Dessa forma, foram realizados experimentos para selecionar os isolados mais tolerantes à radiação UV-B; avaliar a sensibilidade do bioagente à radiação UV-B em diversos estádios da germinação de conídios; estabelecer a curva de sobrevivência dos isolados expostos à radiação; avaliar a interação da radiação UV-B com temperaturas e concentrações de CO2 do ar; e avaliar o efeito da radiação UV-B no estabelecimento de Lecanicillium em pústulas de ferrugem. Os experimentos foram realizados em câmara de radiação, com irradiância média de 1.700 mW m-2 no interior, sendo os conídios expostos à radiação em placas de Petri contendo BDA e em discos de folhas de cafeeiro contidos em bandejas plásticas. Os estudos evidenciaram a efetividade biológica da radiação UV-B sobre os conídios de Lecanicillium, tendo como respostas a inativação dos propágulos, o atraso no processo de germinação de conídios e o incremento ou a diminuição do desenvolvimento do bioagente. Diferentes níveis de sensibilidade da germinação de conídios, entre os isolados de Lecanicillium testados, foram observados quando expostos a radiação UV-B. Os isolados mais tolerantes... / Coffee leaf rust is the most important disease of the coffee crop, and its causing agent, Hemileia vastatrix, has the Lecanicillium lecanii as its natural parasite, which indicates the potential of this fungus as a biocontrol agent. One of the factors that endanger the efficiency of the bioagents is the ultraviolet-B radiation (UV-B). The incidence of this radiation on the surface of Earth has increased with the reduction of the stratospheric ozone layer, which can affect the natural process of control of plant diseases and the use of bioagents. The aim of this study was to evaluate the effect of UV-B radiation on L. lecanii. Thus, bioassays were held in order to select the isolates which are more tolerant to UV-B radiation; evaluate the sensibility of the bioagent to the UV-B radiation in several stages of the conidia germination; establish the survival curve of the isolate which exposed to the radiation; evaluate the interaction of the UV-B radiation with different temperature and concentrations of CO2 in the air; and evaluate the effect of the UV-B radiation in the establishment of Lecanicillium in lesions of coffee leaf rust. The bioassays were held in a chamber with average irradiation of 1,700 mW m-2, and the conidia were exposed to the radiation in Petri dish with BDA and on coffee leaves discs kept in plastic trays. The UV-B radiation was effective on Lecanicillium conidia germination, and the response was the reduction and the delay in germination of conidia, resulting in increment or reduction of the development of the bioagent. Different levels of sensibility were found in the conidia germination, among the isolates of Lecanicillium studies, which... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Wagner Bettiol / Banca: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Flávio Henrique Vasconcelos de Medeiros / Resumo: A ferrugem é a principal doença do cafeeiro e o seu agente causal, Hemileia vastatrix, é parasitado de forma natural por Lecanicillium lecanii, indicando potencial desse fungo para controle biológico. Um dos fatores que comprometem a eficiência de bioagentes é a radiação ultravioleta-B (UV-B). A incidência dessa radiação na superfície da Terra aumentou com a diminuição da camada de ozônio estratosférico, podendo afetar os processos naturais de controle de doenças de plantas e o uso de bioagentes. O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito da radiação UV-B sobre L. lecanii. Dessa forma, foram realizados experimentos para selecionar os isolados mais tolerantes à radiação UV-B; avaliar a sensibilidade do bioagente à radiação UV-B em diversos estádios da germinação de conídios; estabelecer a curva de sobrevivência dos isolados expostos à radiação; avaliar a interação da radiação UV-B com temperaturas e concentrações de CO2 do ar; e avaliar o efeito da radiação UV-B no estabelecimento de Lecanicillium em pústulas de ferrugem. Os experimentos foram realizados em câmara de radiação, com irradiância média de 1.700 mW m-2 no interior, sendo os conídios expostos à radiação em placas de Petri contendo BDA e em discos de folhas de cafeeiro contidos em bandejas plásticas. Os estudos evidenciaram a efetividade biológica da radiação UV-B sobre os conídios de Lecanicillium, tendo como respostas a inativação dos propágulos, o atraso no processo de germinação de conídios e o incremento ou a diminuição do desenvolvimento do bioagente. Diferentes níveis de sensibilidade da germinação de conídios, entre os isolados de Lecanicillium testados, foram observados quando expostos a radiação UV-B. Os isolados mais tolerantes... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Coffee leaf rust is the most important disease of the coffee crop, and its causing agent, Hemileia vastatrix, has the Lecanicillium lecanii as its natural parasite, which indicates the potential of this fungus as a biocontrol agent. One of the factors that endanger the efficiency of the bioagents is the ultraviolet-B radiation (UV-B). The incidence of this radiation on the surface of Earth has increased with the reduction of the stratospheric ozone layer, which can affect the natural process of control of plant diseases and the use of bioagents. The aim of this study was to evaluate the effect of UV-B radiation on L. lecanii. Thus, bioassays were held in order to select the isolates which are more tolerant to UV-B radiation; evaluate the sensibility of the bioagent to the UV-B radiation in several stages of the conidia germination; establish the survival curve of the isolate which exposed to the radiation; evaluate the interaction of the UV-B radiation with different temperature and concentrations of CO2 in the air; and evaluate the effect of the UV-B radiation in the establishment of Lecanicillium in lesions of coffee leaf rust. The bioassays were held in a chamber with average irradiation of 1,700 mW m-2, and the conidia were exposed to the radiation in Petri dish with BDA and on coffee leaves discs kept in plastic trays. The UV-B radiation was effective on Lecanicillium conidia germination, and the response was the reduction and the delay in germination of conidia, resulting in increment or reduction of the development of the bioagent. Different levels of sensibility were found in the conidia germination, among the isolates of Lecanicillium studies, which... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Paulo Mazzafera / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-05T10:18:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Melo_GeraldoAclecio_D.pdf: 1320706 bytes, checksum: 5f501b7dd60a44ae72341950498d75f7 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Polifenoloxidase - PFO (EC 1.14.18.1 ou EC 1.10.3.2) é uma enzima de ampla distribuição entre as plantas e catalisa a hidroxilação de monofenóis a o-difenóis e a oxidação destes para o-diquinonas. Sua função em plantas tem sido relacionada a mecanismos de defesa contra patógenos e pragas. Em cafeeiro, o ácido 5-cafeoilquínico, também conhecido como ácido clorogênico (CGA) é o principal substrato da PFO e ambos, enzima e substrato, estão presentes em quantidades expressivas nos frutos e nas folhas desta planta. O CGA também está relacionado com mecanismos de defesas das plantas e como tal é considerando importante substrato em reações de oxidação, principalmente aquelas mediadas pela PFO. No presente estudo, com objetivo de conhecer características da PFO de folhas do cafeeiro, de averiguar sua ação em mecanismos de defesa nessa planta e de entender fatores ligados à síntese e ao acúmulo de seu principal substrato foram feitas a purificação e caracterização dessa enzima, estudos da expressão de sua atividade, bem como estudos de expressão de enzimas da via de síntese do CGA em cafeeiro. Com o uso de técnicas de precipitação com sulfato de amônio, cromatografias de troca iônica, interação hidrofóbica e exclusão molecular foi possível obter a PFO com alto grau de pureza. A enzima apresentou massa molecular de 40,5 Kda e preferência pelo ácido 5-cafeoilquínico como substrato. Seqüências de peptídeos obtidas após digestão da proteína e análise por espectrometria de massas mostraram-se homólogas a seqüências de PFO de várias outras plantas. O nível constitutivo de atividade da PFO observado para quinze genótipos de café variou de 3,8 a 88,0 unidades de atividade/mg de proteína, entretanto não teve relação direta com resistência a pragas e doenças nessa planta. A resistência ao bicho mineiro foi significativamente relacionada ao nível de compostos fenólicos, entretanto, ácido 5-cafeoilquínico, o principal substrato da PFO em café, não teve relação com essa resistência, sugerindo a importância de outros compostos fenólicos como substratos da PFO. Dano mecânico, tratamento com ácido metiljasmônico, inoculação com esporos do fungo Hemileia vastatrix e a infestação com ovos do inseto Perileucoptera coffeella levaram a respostas variadas nos níveis de atividade de PFO nos genótipos avaliados. Baseando-se nesses resultados, conclui-se que a ação da PFO na resistência do cafeeiro a pragas e doenças pode estar relacionada ao potencial oxidativo do tecido e não simplesmente uma maior atividade; que o tipo e quantidade de substrato encontrado no tecido podem ser importantes na resistência do cafeeiro e que entre os genótipos pode existir a especialização de mecanismos de resistência envolvendo a ação da PFO. Estudos de expressão por RT-PCR de fenilalanina amônia-liase (PAL), cinamato 4-hiroxilase (C4H), coumarato 3-hidroxilase (C3H), hidroxicinamoil-CoA ligase (4CL) e hidroxicinamoil-CoA:D-quinato hidroxicinamoil transferase (CQT), enzimas da via de síntese do CGA, tiveram sua expressão reduzida à medida que o tecido envelhece. No endosperma foi observado um decréscimo acentuado de expressão no final da maturação dos frutos. Plântulas estioladas obtidas pela germinação de sementes no escuro e transferidas para luz mostraram aumentos significativos no conteúdo de CGA após 24 horas. Esses aumentos foram transientes e coincidiram com a expressão da PAL, C4H, C3H, 4CL e CQT. Os resultados indicam existência de controle da síntese de CGA e a existência de mecanismos de controle da expressão em comum para as cinco enzimas estudadas / Abstract: Polyphenoloxidase - PPO (EC 1.14.18.1 ou EC 1.10.3.2) is an enzyme with broad distribution among plants and catalyzes the hydroxylation of monophenols to o-diphenols and the oxidation of these to o-diquinones. Its function on plants has been related to defense mechanisms against pathogens and plagues. 5-Caffeoylquinic acid, also known as chlorogenic acid (CGA), is the main PPO substrate in coffee tissues and both, enzyme and substrate are present on substantial quantities in fruits and leaves. CGA is also referred to having connection with plants defense mechanisms and it is also an important substrate on oxidation reactions, mainly those mediated by PPO. Therefore, in order to increase our knowledge on the coffee PPO characteristics, to verify its role in defense mechanisms and also to understand the factors connected to the synthesis of CGA, coffee leaf PPO was purified and characterized regarding kinetic parameters and its activity in leaves of several coffee species exposed or not to pest (leaf miner) and disease (leaf rust). Also studies on the expression of the enzymes of CGA synthesis were carried out. By using ammonium sulfate precipitation followed by chromatographic steps on ionic exchange, hydrophobic interaction and molecular exclusion resins it was possible to purify PPO to homogeneity. The enzyme presented a molecular mass of 40,5 Kda and used 5-cafeoylquinic acid as the preferred substrate. Peptide sequences obtained after digestion of the purified PPO and analysis through mass spectrometry were homologous to PPO sequences of several other plants. The constitutive level of PPO activity observed for 15 coffee genotypes varied from 3,8 to 88,0 units of activity/mg of protein, but did not have a direct relationship with resistance to plagues in this plant. Resistance to leaf miner was significantly related to the level of phenolic compounds. However, 5-caffeoylquínic acid, the main substrate of PPO on coffee, was not related with resistance, suggesting the importance of other phenolic compounds as PPO substrates. Mechanical damage, treatment with methyljasmonic acid, inoculation with spores from Hemileia vastatrix and the infestation with the insect Perileucoptera coffeella led to varied results of the PPO activity in the evaluated genotypes. Based on these results, we conclude that the PPO role in the coffee resistance to plagues and diseases might be related to the oxidative potential of the tissue and not only on the PPO activity; that the kind and quantity of PPO substrate found in the tissue might be important for the resistance of the coffee tree and that there may be specific mechanisms of resistance involving PPO action among the genotypes. RT-PCR studies of the expression of phenylalanine ammonia-lyase (PAL), cinnamate 4-hyroxylase (C4H), coumarate 3-hydroxylase (C3H), hydroxycinnamoyl-CoA ligase (4CL) and hydroxycinnamoyl-CoA:D-quinate hydroxycinnamoyl transferase (CQT), which code for enzymes of the CGA biosynthetic pathway, showed that the expression of these enzymes decrease with tissue aging. In the endosperm, an evident decrease on the expression was observed in the end of the fruit ripening. Etiolated seedlings obtained by germination of coffee seeds in the dark and transferred into light showed significant increasing on the CGA content after 24 hours. The increase was transient and followed the expression pattern of PAL, C4H, C3H, 4CL and CQT. The results indicate that CGA biosynthesis is coordinately regulated by the expression of the five enzymes / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador: Laura Maria Mariscal Ottoboni / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T07:40:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Queiroz_TaniaMarciade_D.pdf: 1627218 bytes, checksum: 918b6b5965fc39fc4d4c34076a315249 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A ferrugem alaranjada, cujo agente causal é o fungo Hemileia vastatrix Berk & Br., tem sido um dos principais problemas da cultura do cafeeiro em todas as regiões do mundo. Esta doença pode causar prejuízos de até 50% da produção. O fungo ataca todas as variedades de café, porém Coffee canephora apresenta cultivares resistentes, enquanto a maioria dos cultivares comerciais dentro da espécie Coffea arabica é suscetível à doença. Nesse trabalho foi feita a identificação e a caracterização de genes expressos diferencialmente em C. arábica cultivar Icatu Vermelho ¿ IAC 4045 (resistente ao agente da ferrugem). Para isso, foi utilizada a técnica de display diferencial de mRNA. A comparação entre os padrões de cDNAs nos géis permitiu o isolamento de cDNAs com expressão diferencial nos intervalos de 1 hora e 24 horas após a inoculação com o fungo. Alguns desses cDNAs foram clonados e seqüenciados. As seqüências obtidas foram comparadas com seqüências disponíveis no banco de dados do Genoma Café, sendo que oito cDNAs tiveram sua expressão confirmada e apresentaram similaridade com uma anexina, uma proteína M do fotossistema II, uma pirofosfatase prótoninorgânica vacuolar, um Citocromo P450, uma proteinase carboxil-terminal, uma proteína heat shock - HSP70, uma quinase C e uma proteína FIS1. Além da análise da identificação de genes com expressão diferencial, foi feita também uma análise das diferenças metabólicas em folhas de C. arabica cv. Icatu Vermelho - IAC 4045 e Mundo Novo - IAC 501 inoculadas com H. vastatrix. A técnica utilizada nas análises foi DRIFTS (diffuse reflectance infrared Fourier transform spectrometry ou espectroscopia no infravermelho por reflectância difusa com transformada de Fourier). Foram observados picos de reflectância proeminentes em regiões de números de onda 1075 'CM POT. ¿1¿, 1375 'CM POT. ¿1¿, 1555 'CM POT. ¿1¿, 1520 'CM POT. ¿1¿, 1150 'CM POT. ¿1¿ e 1645 'CM POT. ¿1¿. A análise de componentes principais demonstrou que houve uma discriminação entre Icatu Vermelho e Mundo Novo 48 horas após a inoculação e o teste de Tukey mostrou que para as regiões 1555 'CM POT. ¿1¿, 1520 'CM POT. ¿1¿ e 1645 'CM POT. ¿1¿ houve uma diferença significativa entre os cultivares a 5% de probabilidade / Abstract: The orange rust, caused by fungus H. vastatrix Berk & Br., has been the major problem of the coffee culture in all regions of the world. This disease can cause 50% damage in the plantation. The fungus attack all the coffee varieties, but C. canephora present resistant cultivars while the majority of the comercial cultivars into C. arabica is susceptible to disease. This experiment has the purpose of the identification and characterization of the differentially expressed cDNAs in C. arabica cultivar Icatu Vermelho (resistant to rust fungus). For this has been utilized mRNA differential display technique. The comparation between cDNAs in the display gels allowed the cDNAs isolation with differential expression in the intervals of 1 hour and 24 hours after inoculation of leaves with fungus. Some cDNAs were cloned and sequenced. The sequences were compared in Coffee Genome data bank and eight cDNAs had the expression confirmed and present similarity with a annexin, photosystem II M protein, a vacuolar proton inorganic pyrophosphatase, a cytochrome P450 family, a carboxyl-terminal protease, a heat shock 70 kDa protein, and a FIS1 protein. Beyond differential expression of the genes analysis, we also analysed the metabolic differences in C. arabica cultivars Icatu Vermelho (IAC 4045) and Mundo Novo (IAC 501) leaves inoculated with H. vastatrix. The technique utilized was DRIFTS (diffuse reflectance infrared Fourier transform spectrometry). Principal Component Analysis demonstrate there were a discrimination between Icatu Vermelho and Mundo Novo 48 hours after inoculation and Tukey Test showed to the regions 1555 'CM POT. ¿1¿, 1520 'CM POT. ¿1¿, 1645 'CM POT. ¿1¿ there were significative difference between cultivars to 5% of probability / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientadores: Luiz Henrique Antunes Rodrigues, Carlos Alberto Alves Meira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola / Made available in DSpace on 2018-08-23T06:51:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DiGirolamoNeto_Cesare_M.pdf: 2582592 bytes, checksum: a61acb99a6b78882f0aef0e7408b48b5 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A ferrugem (causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berk. e Br.) é a principal doença do cafeeiro. As perdas da produção causadas por esta doença podem chegar a 50%, caso nenhuma medida de controle seja adotada. O controle da ferrugem pode ser feito com fungicidas, entretanto métodos tradicionais de controle podem levar a aplicações desnecessárias, as quais são responsáveis por gerar gastos excessivos por parte do produtor, na compra e mão de obra para sua aplicação, além de causar impactos ambientais. Ferramentas como modelos de predição, ou alerta, podem ser utilizadas para antecipar quando uma doença de planta pode ocorrer, sendo que uma predição correta evita aplicações desnecessárias de fungicidas. Neste sentido, modelos de alerta para a ferrugem do cafeeiro foram construídos por outros autores, entretanto, após o seu desenvolvimento, estes modelos não foram avaliados com dados externos ao conjunto de treinamento. Estes modelos passaram por um processo de validação neste trabalho e o resultado mostrou um desempenho abaixo do esperado, evidenciando a necessidade de se criarem novos modelos de alerta, com poder de predição maior do que os existentes. O processo de descoberta de conhecimento em bases de dados foi realizado com o objetivo de gerar estes novos modelos de alerta, utilizando técnicas de mineração de dados como: redes neurais artificiais, máquinas de vetores suporte, florestas aleatórias e árvores de decisão. Dados meteorológicos e de espaçamento da lavoura foram às variáveis independentes do conjunto de dados. Os modelos de alerta foram desenvolvidos considerando taxa de progresso da ferrugem como atributo dependente, ou atributo meta, a qual consiste no aumento da incidência entre dois meses subsequentes. Este atributo foi de origem binária, seguindo os limites de 5 e 10 pontos percentuais - p.p. (classe '1' para taxas maiores ou iguais ao limite; classe '0', caso contrário). Foram desenvolvidos modelos de alerta para a cidade de Varginha e para a região Sul de Minas (com adição das cidades de Boa Esperança e Carmo de Minas), para dados entre 1998 e 2011. Os modelos são específicos para lavouras com alta carga pendente ou para lavouras com baixa carga, dado ao café ser uma cultura bianual. Os modelos para a cidade de Varginha obtiveram, no geral, melhor desempenho do que aqueles contendo dados das 3 cidades juntas. Para alta carga pendente de frutos, a taxa de acerto por validação cruzada, foi superior a 85%, considerando o alerta a partir de 5 p.p. Considerando o alerta a partir de 10 p.p., a taxa de acerto se aproximou dos 90%. Já para lavouras com baixa carga pendente, os modelos considerando o alerta a partir de 5 p.p. também chegaram a taxas de acerto próximas a 90%. Houve ainda equilíbrio entre outras medidas de desempenho importantes, como sensitividade, especificidade e confiabilidade positiva ou negativa em todos os modelos. Os modelos mais bem avaliados mostraram ter desempenho superior aos modelos desenvolvidos por outros autores e têm potencial para servir como apoio na tomada de decisão referente à adoção de medidas de controle da ferrugem do cafeeiro / Abstract: Coffee rust (infection by the fungus Hemileia vastatrix Berk. e Br.) can cause up to 50% of yield losses, in the case no protective measures are taken. This disease can be controlled through fungicide applications, however, traditional control methods can lead to unnecessary use of these products, which cause, not only economic losses for the producer, on buying and applying the fungicides, but also major environmental impacts. Tools like warning models can be used to predict when a plant disease may occur and a correct prediction might avoid unnecessary fungicide applications. According to this, some authors developed warning models for coffee rust, nevertheless, after their development, these models were not evaluated by a test set, besides the one used to create it. A Validation procedure was performed over these models, showing that their performance was way low than expected, highlighting the need for new warning models, with better performance than those previously developed. The Knowledge Discovery in Database process was performed intending to develop new warning models by using four data mining techniques: Neural Networks, Support Vector Machines, Random Forests and Decision Trees. Meteorological and crop spacing data were designed as the independent variables. The dependent variable was labeled as the monthly progress rate of coffee rust, which consists on the increase of the incidence levels between two months in a row. It was mapped as a binary attribute, following the limits of five and ten percentage points (p.p.), considering the increase of the infection rate (class '1' for progress rate over or equal the limit, or class '0' otherwise). Models were developed considering 13 years (1998 - 2011) of incoming data for the city of Varginha - Minas Gerais - Brazil and for the South Minas Gerais region (by adding data from two more cities, Boa Esperança and Carmo de Minas). The models developed are specific for high or low fruit loads. Warning models for Varginha obtained, usually, better performance than those developed with data from the three cities. For high fruit load, the accuracy by cross validation was higher than 85%, considering the warning over 5 p.p. Considering the warning over 10 p.p., the accuracy was close to 90%. For low fruit load, the models considering warning over 5 p.p. also obtained accuracy close to 90%. Other important performance measures, such as sensitivity (recall) and specificity, also obtained good values for all of these models. The warning models developed on this study obtained better performance than others previously developed, and have a great potential to be used in decision-making systems, providing further information regarding the correct use of fungicides on controlling the coffee rust / Mestrado / Planejamento e Desenvolvimento Rural Sustentável / Mestre em Engenharia Agrícola

Made available in DSpace on 2015-03-26T12:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1359880 bytes, checksum: 75e8020a52662b6da6545e57d6103547 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Coffee is the most traded commodity in the world and Brazil is the largest producer. Coffee leaf rust, caused by the biotrophic fungus Hemileia vastatrix is the most important coffee disease reducing coffee yield by 35 to 50%. Too little is known about this pathosystem as well as the pathogen impacts on plant photosynthesis, defense enzymes activities, concentration of plant pigments and chlorophyll a fluorescence parameters under different fungicides sprayed treatments. To contribute with new knowledge generation, this study aimed: 1) to evaluate the Fv/Fm (Maximal photosystem II quantum yield) chlorophyll a fluorescence imaging parameter as tool to differentiate pre-symptomatic coffee leaf rust infections in plants sprayed with pyraclostrobin and epoxiconazole and 2) to investigate the relationships between photosynthetic pigments, defense enzymes activities and some chlorophyll a fluorescence parameters on leaves of coffee plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin and inoculated or non-inoculated with Hemileia vastatrix. Experiments in a completely randomized design were performed in greenhouse and coffee plants were inoculated with urediniospores. Epoxiconazole and pyraclostrobin were sprayed in coffee plants in order to study the Fv/Fm chlorophyll a fluorescence parameter, coffee leaf rust severity, defense enzymes activities, photosynthetic pigments concentration and other chlorophyll a fluorescence parameters. Results from the present study showed that the different fungicides application on soil and/or leaves of triazoles and strobilurins were efficient to control coffee leaf rust. There was a significant linear relationship between the areas of real severity and visual severity and for each additional unit in the visual severity there was an increase of 53% on the real severity. For the epoxiconazole and pyraclostrobin treatments, the coffee leaf rust symptoms decreased based on both visual and Fv/Fm images. Pustules on leaves sprayed with epoxiconazole were smaller in size than the ones on leaves of plants from the control treatment, but bigger than pyraclostrobin. Reduction on Fv/Fm values at the pustules epicenter on leaves of plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin were lower than those of the control treatment. Coffee leaf rust severity decreased until 40 days after inoculation on plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Catalase, peroxidases, β-1,3-glucanases and chitinases activities were different among treatments with inoculated and non-inoculated plants. There was a significant reduction in pigments concentration between non-inoculated and inoculated treatments but not, in plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Chlorophyll a fluorescence parameters were different between non-inoculated and inoculated plants and non- sprayed and fungicides sprayed plants. Hemileia vastatrix affected the photosynthetic capacity of Coffea arabica and the Fv/Fm parameter was able to show this effect before the appearance of visual symptoms. Changes on photosynthesis were detected in non- inoculated and inoculated plants sprayed with epoxiconazole and pyraclostrobin. Also, the effect of fungicides on photosynthesis should be studied to provide more opportunities to understanding the impacts on plant defense mechanisms that lead to reduced coffee leaf rust symptoms. / O café é a commodity mais negociada no mundo sendo o Brasil seu maior produtor. A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix é a doença mais importante do cafeeiro e pode causar redução em sua produtividade entre 35 a 50%. Muito pouco se sabe sobre este patossistema, bem como os impactos do patógeno sobre a fotossíntese da planta, a atividade de enzimas de defesa, a concentração de pigmentos vegetais e os parâmetros de fluorescência clorofila a sob diferentes tratamentos com fungicidas. Para contribuir com a geração de novos conhecimentos, este estudo teve como objetivos: 1) avaliar a variável Fv/Fm (Rendimento quântico máximo do fotossistema II) obtida através da imagem da fluorescência da clorofila a como ferramenta para diferenciar infecções pré-sintomáticas em plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina e 2) investigar as relações entre pigmentos fotossintéticos, atividade de enzimas de defesa e alguns parâmetros de fluorescência da clorofila a em folhas de café pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina e inoculadas ou não-inoculadas com Hemileia vastatrix. Os experimentos seguiram delineamento inteiramente casualizado e foram conduzidos em casa de vegetação. As plantas de café foram cultivadas em estufa e inoculadas com urediniósporos. Epoxiconazol e piraclostrobina foram pulverizadas sobre as plantas, a fim de estudar o parâmetro Fv/Fm de fluorescência da clorofila a, a severidade da ferrugem do cafeeiro, a atividade de enzimas de defesa, a concentração de pigmentos fotossintéticos e outros parâmetros de fluorescência da clorofila a. Houve uma relação linear significativa entre severidade real e visual das áreas foliares estimadas pelo parâmetro Fv/Fm e para cada unidade adicional na severidade visual, houve um aumento de 53% na severidade real. Para os tratamentos com epoxiconazol e piraclostrobina, os sintomas da ferrugem do cafeeiro diminuíram tomando como base as imagens visual e as geradas a partir do parâmetro Fv/Fm da fluorescência da clorofila a. Pústulas nas folhas pulverizadas com epoxiconazol foram menores nas folhas do tratamento controle mas, maiores do que piraclostrobina. A redução nos valores do parâmetro Fv/Fm no epicentro das pústulas das folhas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina foram menores do que os do tratamento controle. A severidade da ferrugem do cafeeiro diminuiu até 40 dias após a inoculação nas plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. As atividades de catalase, peroxidases, β-1,3-glucanases e quitinases foram diferentes entre os tratamentos com plantas inoculadas e não-inoculadas. Houve redução significativa na concentração de pigmentos entre as plantas não-inoculadas e inoculadas mas, não entre as plantas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. Os parâmetros de fluorescência da clorofila a foram diferentes entre plantas não-inoculadas e inoculadas e não-pulverizadas e pulverizadas com fungicidas. Hemileia vastatrix afetou a capacidade fotossintética de Coffea arabica e o parâmetro Fv/Fm de fluorescência da clorofila a foi capaz de mostrar esse efeito antes do aparecimento dos sintomas visuais. Alterações na fotossíntese foram detectadas em plantas não-inoculadas e inoculadas pulverizadas com epoxiconazol e piraclostrobina. Além disso, o efeito dos fungicidas sobre a fotossíntese deve ser estudado, para proporcionar mais oportunidades para a compreensão dos impactos sobre os mecanismos de defesa da planta, que levam à redução de sintomas da ferrugem do cafeeiro.