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Estimation et analyse de la taille efficace de populations structurées en classes d'âge ou en stadesAndrello, Marco 03 December 2010 (has links) (PDF)
La taille efficace des populations, Ne, est un paramètre central en biologie de la conservation et en biologie évolutive et peut être estimée avec des méthodes démographiques et génétiques. L'objectif de cette thèse a été l'analyse des effets de l'histoire de vie sur Ne dans des espèces à générations chevauchantes en utilisant des modèles démographiques. Un modèle démographique et deux estimateurs génétiques ont été utilisés pour dériver Ne dans des population d' Eryngium alpinum, une plante pérenne et menacée. Les trois méthodes ont donné des estimations considérablement différentes. Les différences ont pu être attribuées à la difficulté d'obtenir toutes les données nécessaires au modèle démographique, mais aussi à la faible précision des estimateurs génétiques quand ils sont appliqués à des jeux de données limités. Les modèles démographiques ont cependant permis l'identification des effets de l'histoire de vie sur Ne à travers des analyses de sensibilité et d'élasticité. L'élasticité numérique a été utilisée pour étudier les effets sur Ne de taux vitaux stadespécifiques dans E. alpinum et dans Dracocephalum austriacum, une plante alpine pérenne et menacée. Les patrons d'élasticité dérivés étaient souvent, mais pas toujours, similaires dans des populations à démographie comparable. Ensuite, un modèle démographique a été analysé en détail pour dériver analytiquement une expression pour la sensibilité de Ne/N aux taux vitaux âgespécifiques. Cette expression a été utilisée pour étudier Ne/N dans trois espèces qui diffèrent dans leur patron de courbe de survie (humains, bruants et balanes). Les différences des patrons de sensibilité entre ces trois espèces ont pu être ainsi attribuées à des composantes spécifiques du cycle de vie. Cette thèse montre que les modèles démographiques sont des méthodes utiles pour comprendre les effets de l'histoire de vie sur Ne et qu'ils pourraient être des outils puissants pour complémenter les estimateurs génétiques quand des données écologiques et démographiques sont disponibles en quantité suffisante. L'étape suivante sera la généralisation des patrons de sensibilité et d'élasticité observés en utilisant une approche comparative sur un grande nombre de populations, ce qui sera possible grâce à la rapide accumulation de grandes quantités des données démographiques et génétiques sur un grand nombre d'espèces.
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