<p>För att kunna rekonstruera en tredimensionell volym av en hjärna avbildad med hjälp av magnetresonanstomografi (MRI) behöver man korrigera varje snittbild i förhållande till varandra, beroende på oundvikliga rörelser hos den röntgade patienten. Detta förfarande kallas bildregistrering och idag använder man sig primärt av en metod där en bild utses till referensbild och därefter anpassas närliggande bilder, som antas ha en minimal avvikelse, till referensen.</p><p>Syftet med detta examensarbete är att använda en annan metod vanligen utnyttjad inom datorseende för att estimera ett rörelsefält utifrån en vanlig videosekvens, genom att följa markörer som indikerar rörelse. Målet är att skapa en robust estimering av huvudets rörelse, som då kan användas för att skapa en mer noggrann korrigering och därmed också en bättre rekonstruktion.</p> / <p>Before reconstructing a three dimensional volume from an MR brain imaging sequence there is a need for aligning each slice, due to unavoidable movement of the patient during the scanning. This procedure is known as image registration and the method used primarily today is based on a selected slice being the reference slice and then registrating the neighbouring slices, which are assumed to be of minimal deviation.</p><p>The purpose of this thesis is to use another method commonly used in computer vision - to estimate the motion from a regular videosequence, by tracking markers indicating movement. The aim is to create a robust estimation of the movement of the head, which in turn can be used to create a more accurate alignment and volume.</p>

För att kunna rekonstruera en tredimensionell volym av en hjärna avbildad med hjälp av magnetresonanstomografi (MRI) behöver man korrigera varje snittbild i förhållande till varandra, beroende på oundvikliga rörelser hos den röntgade patienten. Detta förfarande kallas bildregistrering och idag använder man sig primärt av en metod där en bild utses till referensbild och därefter anpassas närliggande bilder, som antas ha en minimal avvikelse, till referensen. Syftet med detta examensarbete är att använda en annan metod vanligen utnyttjad inom datorseende för att estimera ett rörelsefält utifrån en vanlig videosekvens, genom att följa markörer som indikerar rörelse. Målet är att skapa en robust estimering av huvudets rörelse, som då kan användas för att skapa en mer noggrann korrigering och därmed också en bättre rekonstruktion. / Before reconstructing a three dimensional volume from an MR brain imaging sequence there is a need for aligning each slice, due to unavoidable movement of the patient during the scanning. This procedure is known as image registration and the method used primarily today is based on a selected slice being the reference slice and then registrating the neighbouring slices, which are assumed to be of minimal deviation. The purpose of this thesis is to use another method commonly used in computer vision - to estimate the motion from a regular videosequence, by tracking markers indicating movement. The aim is to create a robust estimation of the movement of the head, which in turn can be used to create a more accurate alignment and volume.