Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-05-13Bitstream added on 2014-06-13T18:45:54Z : No. of bitstreams: 1 silvajunior_taf_dr_botfca.pdf: 1093180 bytes, checksum: 562817be3d67ef9a5b0d63fa5e506cb7 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A murcha-de-curtobacterium, causada por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), é uma das principais doenças bacterianas da cultura do feijoeiro, acarretando grandes perdas na produção dessa cultura. Até o momento existem poucas informações sobre os diferentes nichos de sobrevivência desta bactéria e de sua gama de hospedeiras. Em vista disso, este trabalho teve por objetivos principais verificar a capacidade de sobrevivência saprofítica de Cff em restos de cultura de feijoeiro mantidos na superfície do solo e enterrados à 20 cm de profundidade; a influência da temperatura, umidade e do tipo de solo no período de sobrevivência da bactéria em solo; determinar a gama de hospedeiras de Cff inoculadas artificialmente, tanto por ferimento no caule, como por aspersão de suspensão bacteriana na parte aérea das plantas; a capacidade de colonização de Cff do rizoplano de plantas de aveia e trigo; e o efeito do pré-plantio de aveia e trigo na ocorrência da murcha-de-curtobacterium. Quanto à capacidade de sobrevivência de Cff em restos de cultura de feijoeiro, foi demonstrado que a bactéria possui menor capacidade de sobrevivência quando os restos vegetais são incorporados ao solo e também em épocas com maiores índices de precipitação e temperaturas mais altas. O período de sobrevivência do patógeno nos restos culturais de feijoeiro mantidos na superfície do solo variou entre 165 e 240 dias e nos restos vegetais enterrados a 20 cm de profundidade, o período de sobrevivência foi inferior a 30 dias. Quanto à sobrevivência de Cff na forma de células livres no solo, foi verificado que a temperatura, a umidade e o tipo do solo têm influencia na capacidade de sobrevivência da bactéria. O tempo de sobrevivência de Cff variou entre dois e quinze dias. Das 30 espécies botânicas inoculadas artificialmente com Cff, a bactéria causou lesões na parte... / Bacterial wilt caused by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) is one of the main bacterial diseases affecting bean culture, leading to great losses in its production. So far there is scarce information about the different survival niches and host range of this bacterium. Thus, the present study had as major aims to verify Cff capability of saprophytically surviving in bean debris kept on the soil surface and buried at 20 cm depth; to assess the influence of temperature, humidity and soil type on the survival period of this bacterium in soil; to determine the host range for artificially inoculated Cff, either through stem injury or through bacterial sprinkling onto the shoot of plants; to verify Cff capability of colonizing the rhizoplane of oat and wheat plants; and to assess the effect of oat and wheat pre-planting on the occurrence of bean bacterial wilt. Cff had decreased capability of surviving in bean debris when the latter were incorporated into the soil and during periods of higher rainfall rates and temperatures. The pathogen survival period in bean culture remnants kept on the soil surface ranged from 165 and 240 days, while in plant debris buried at 20 cm depth the survival period was inferior to 45 days. The survival capability of Cff as free cells in soil was influenced by temperature, humidity and soil type. Cff survival time varied between two and fifteen days. Of 30 plant species artificially inoculated with Cff, bean and soy shoot had lesions caused by the bacterium which endophytically colonized wheat leaves and soy and wheat stem and leaves. Cff was also shown to have no capability of colonizing oat and wheat rhizoplane while the pre-planting of these grass plants, before bean culture establishment, had no effect on the occurrence of bean bacterial wilt

Orientador: Suzete Aparecida Lanza Destéfano / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T19:29:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Goulart_MarcelaCristina_M.pdf: 1843141 bytes, checksum: 317126844277b642b5edc69d405b000b (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A soja é considerada uma das culturas mais importantes no Brasil, em função de seu alto valor sócio-econômico, determinado pelas inúmeras aplicações de seus produtos e subprodutos e consequente expressão no mercado interno e externo. No entanto, a cultura desta oleaginosa é frequentemente ameaçada com a ocorrência de um vasto número de doenças, que podem acarretar depreciação do produto, redução no rendimento e perdas econômicas para os produtores. Dentre as principais doenças bacterianas que afetam a cultura da soja, destacam-se a pústula bacteriana, causada por Xanthomonas axonopodis pv. glycines (Xag); o crestamento bacteriano, causado por Pseudomonas savastanoi pv. glycines (Psg); e a murcha de Curtobacterium causada por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), ocasionando perdas na produção de até 40%. A condição sanitária das sementes é extremamente importante se considerarmos que elas são veículos desses agentes fitopatogênicos que nelas podem se alojar e serem levados ao campo, provocando redução na germinação e vigor, e originando focos primários de infecção de doenças. O presente trabalho teve por objetivo desenvolver nova metodologia de diagnóstico com o uso das técnicas moleculares que permitissem detectar e identificar a presença de Psg, Xag e Cff em sementes de soja por meio do desenvolvimento de primers espécie específicos. Os primers desenhados a partir de sequências da região espaçadora 16S-23S RNAr, mostraram-se altamente específicos e sensíveis. O par de primers Curto2f/p322anti gerou um fragmento de 675 pb e capacidade de detecção a partir de 0,01 ng de DNA genômico e aproximadamente 5x103 UFC/PCR; o par de primers Psgl/p322anti gerou um fragmento de 500 pb e o grau mínimo de sensibilidade foi de 1 pg de DNA genômico e cerca de 80 UFC/PCR; o par de primers Xanth2f/p322anti gerou um fragmento de 545 pb e capacidade de detecção a partir de 1 ng de DNA genômico e cerca de 700 UFC/PCR. Posteriormente, as sementes de soja foram infectadas artificialmente nas condições de 1; 0,5 e 0,1% de infecção. Nas amplificações com os primers espécie-específicos desenvolvidos, foi possível detectar as fitobactérias em todos os níveis de infecção testados diretamente do extrato bruto, e nas amplificações após o enriquecimento do extrato (BIO-PCR) o sinal positivo foi potencializado / Abstract: Soybean is considered one of the most important crops in Brazil, due to its high socio-economic value, determined by its several products and sub products and its significant expression on the internal and external market. However, this oleaginous plant is often affected by the occurrence of different diseases, which cause depreciation of the product, reduction in yield and substantial economic losses. Among the main bacterial diseases, the bacterial pustule, caused by Xanthomonas axonopodis pv. glycines (Xag), the bacterial blight caused by Pseudomonas savastanoi pv. glycines (Psg), and bacterial tan spot caused by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), producing yield losses of up to 40%. The seed health is extremely important since they are considered vehicles of pathogenic agents which can be led to the field, causing germination reduction and vigor; and yielding primary infection of the diseases. This study aimed to develop a new method of diagnosis using molecular tools to detect and identify Psg, Xag or Cff in soybean seeds, through species-specific primers. The primers were designed from sequences of the 16S-23S rRNA and they were highly specific and sensitive. The pair of primers Curto2f/p322anti generated a fragment of 675 bp and was able of detecting down to 0.01 ng of genomic DNA and about 5x103 CFU/PCR; the primer set Psgl/p322anti produced a fragment of 500 bp and reached a detection limit of 1 pg of genomic DNA and about 80 CFU/PCR; and Xanth2f/p322anti yielded a fragment of 545 bp and could detect up to 1 ng of genomic DNA and about 700 CFU/PCR. Subsequently, soybean seeds were artificially infected in the following conditions: 1, 0,5% and 0,1% infection. In the amplifications using the species-specific primers, it was possible to detect the three different phytobacteria at all tested levels of infection directly of the crude extract and in the amplifications after enrichment of the extract (BIO-PCR), the positive signal was enhanced / Mestrado / Genetica de Microorganismos / Mestra em Genética e Biologia Molecular

The mechanism of protection by carotenoids against photodynamic killing in Curtobacterium flaccumfaciens pathover poinsettiae (C. poinsettiae) was studied using pigment mutants isolated by treatment with nitrosoguanidine and DNA gyrase inhibitors. Growth rates, pigment composition, pigment levels and the ultrastructure of the wild-type streptomycin resistant strain of G. poinsettiae (wt-str) and all mutants were compared. One mutant, NTG-1, lacked colored carotenoids, and another, NTG-2, was a slow growing mutant containing low levels (14%) of wild-type carotenoid pigments. Except for NTG-1, the other pigment mutants had different proportions of the same pigments found in the wild type as determined by high performance liquid chromatography (HPLC). Only NTG-2 was morphologically distinct at the ultrastructural level.

Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Marli Teixeira de Almeida Minhoni / Banca: Renate Krause Sakate / Banca: Luís Otavio Saggion Beriam / Banca: Ivan Paulo Bedendo / Resumo: A murcha-de-curtobacterium, causada por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), é uma das principais doenças bacterianas da cultura do feijoeiro, acarretando grandes perdas na produção dessa cultura. Até o momento existem poucas informações sobre os diferentes nichos de sobrevivência desta bactéria e de sua gama de hospedeiras. Em vista disso, este trabalho teve por objetivos principais verificar a capacidade de sobrevivência saprofítica de Cff em restos de cultura de feijoeiro mantidos na superfície do solo e enterrados à 20 cm de profundidade; a influência da temperatura, umidade e do tipo de solo no período de sobrevivência da bactéria em solo; determinar a gama de hospedeiras de Cff inoculadas artificialmente, tanto por ferimento no caule, como por aspersão de suspensão bacteriana na parte aérea das plantas; a capacidade de colonização de Cff do rizoplano de plantas de aveia e trigo; e o efeito do pré-plantio de aveia e trigo na ocorrência da murcha-de-curtobacterium. Quanto à capacidade de sobrevivência de Cff em restos de cultura de feijoeiro, foi demonstrado que a bactéria possui menor capacidade de sobrevivência quando os restos vegetais são incorporados ao solo e também em épocas com maiores índices de precipitação e temperaturas mais altas. O período de sobrevivência do patógeno nos restos culturais de feijoeiro mantidos na superfície do solo variou entre 165 e 240 dias e nos restos vegetais enterrados a 20 cm de profundidade, o período de sobrevivência foi inferior a 30 dias. Quanto à sobrevivência de Cff na forma de células livres no solo, foi verificado que a temperatura, a umidade e o tipo do solo têm influencia na capacidade de sobrevivência da bactéria. O tempo de sobrevivência de Cff variou entre dois e quinze dias. Das 30 espécies botânicas inoculadas artificialmente com Cff, a bactéria causou lesões na parte... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bacterial wilt caused by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) is one of the main bacterial diseases affecting bean culture, leading to great losses in its production. So far there is scarce information about the different survival niches and host range of this bacterium. Thus, the present study had as major aims to verify Cff capability of saprophytically surviving in bean debris kept on the soil surface and buried at 20 cm depth; to assess the influence of temperature, humidity and soil type on the survival period of this bacterium in soil; to determine the host range for artificially inoculated Cff, either through stem injury or through bacterial sprinkling onto the shoot of plants; to verify Cff capability of colonizing the rhizoplane of oat and wheat plants; and to assess the effect of oat and wheat pre-planting on the occurrence of bean bacterial wilt. Cff had decreased capability of surviving in bean debris when the latter were incorporated into the soil and during periods of higher rainfall rates and temperatures. The pathogen survival period in bean culture remnants kept on the soil surface ranged from 165 and 240 days, while in plant debris buried at 20 cm depth the survival period was inferior to 45 days. The survival capability of Cff as free cells in soil was influenced by temperature, humidity and soil type. Cff survival time varied between two and fifteen days. Of 30 plant species artificially inoculated with Cff, bean and soy shoot had lesions caused by the bacterium which endophytically colonized wheat leaves and soy and wheat stem and leaves. Cff was also shown to have no capability of colonizing oat and wheat rhizoplane while the pre-planting of these grass plants, before bean culture establishment, had no effect on the occurrence of bean bacterial wilt / Doutor