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Caracteriza??o dos genes scMUTM1 e scMUTM2 de cana-de-a??car

Medeiros, Viviane Katielly Silva 23 February 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:18:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VivianeKM.pdf: 34009 bytes, checksum: 80f5f4645fd6e0b6573613b53e2fcf67 (MD5) Previous issue date: 2007-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Plants are organisms sessile and because of this they are susceptible to genotoxic effects due to environmental exposure such as light [including ultraviolet (UV)], heat, drought and chemicals agents. Therefore, there are differents pathways in order to detect a lesion and correct. These pathways are not well known in plants. The MutM/Fpg protein is a DNA glycosylase that is responsible for detect and correct oxidative lesions. In the sugarcane genome, it was found two possible cDNAs that had homology to this protein: scMUTM1 and scMUTM2. The aim of this work was to characterize the role of these cDNAs in plants. In order to do this, the expression level after oxidative stress was evaluated by semiquantitative RT-PCR. Another point analyzed in order to obtain the full-length gene, it was to use a sugarcane genomic library that was hybridized with both cDNAs as a probe. It was found two clones that will bought and sequenced. The promoter region was also cloned. It was obtained sequences only for scMUTM2 promoter region. The sequences obtained were divided into six groups. It was found regulatory motifs such as TATA-box, CAAT-box, oxidative stress element response and regulatory regions that response to light. The other point analyzed was to characterize the N-terminal region by PCR constructs. These constructs have deletions at 5 region. These sequences were introduce into Escherichia coli wild type strain (CC104) and double mutant (CC104mutMmutY). The results showed that proteins with deletions of scMUTM1 N-terminal region were able to complement the Fpg and MutY-glycosylase deficiency in CC104 mutMmutY reducing the spontaneous mutation frequency / As plantas s?o organismos particularmente suscept?veis aos efeitos genot?xicos devido a sua constante exposi??o a agentes do meio ambiente tais como a luz [incluindo a ultravioleta (UV)], o calor, a seca e diferentes subst?ncias qu?micas. Entretanto, existem diferentes mecanismos de reparo para detectar estas les?es e corrigi-las. Entretanto, em plantas estas vias s?o pouco compreendidas. Uma das vias ? a por excis?o de bases (BER). A prote?na MUTM/FPG ? uma DNA glicosilase da via BER que corrige danos oxidativos. No genoma da cana-de-a??car foram encontrados dois poss?veis cDNAs que possuem homologia de seq??ncia a esta prote?na: scMUTM1 e scMUTM2. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o papel destes genes em plantas. Para isto, o n?vel de express?o dos genes ap?s estresse oxidativo foi avaliado atrav?s de RT-PCR semiquantitativo. Para obter a sequ?ncia completa dos gene, uma biblioteca de DNA gen?mico de cana-de-a??car foi hibridizada com sondas radioativas para ambos cDNAs, encontrando-se dois clones em potencial. A regi?o promotora foi clonada, seq?enciada e analisada. Dentro das seq??ncias obtidas para a regi?o promotora de scMUTM2, estas podem ser divididas em seis grupos. Os motivos regulat?rios foram identificados, tais como o TATA-box, CAAT-box, elementos de resposta ao estresse oxidativo e elementos de resposta ? luz. Um outro ponto de interesse neste trabalho foi a caracteriza??o da regi?o N-terminal da prote?na scMUTM1. Para isto, foram realizadas algumas constru??es via PCR. Estas constru??es foram posteriormente introduzidas em cepas selvagem (CC104) e duplo mutante (CC104mutMmutY) de Escherichia coli e foram realizados ensaios de complementa??o de modo a avaliar a import?ncia de cada regi?o para o reconhecimento e corre??o das les?es. Os resultados mostraram que as prote?nas com dele??es na por??o N-terminal de scMUTM1 s?o capazes de complementar a defici?ncia de Fpg and MutY-glicosilase na bact?ria CC104 mutMmutY reduzindo assim a freq??ncia de muta??o espont?nea
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An?lise das mudan?as no perfil prot?ico durante o estresse oxidativo in vivo e atua??o da MutY-Glicosilase em respostas celulares

Oliveira, Ana Helena de Sales 26 February 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:18:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AnaHSO.pdf: 1397021 bytes, checksum: 1db8d16eef2d0b39d08b8b794e469761 (MD5) Previous issue date: 2009-02-26 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Esp?cies reativas de oxig?nio (EROs) s?o produtos do metabolismo celular capazes de reagir com biomol?culas, como prote?nas, lip?deos e ?cido nucl?ico. Essas rea??es podem causar modifica??es delet?rias para a c?lula. Fotossensibilizadores como o azul de metileno (MB), s?o capazes de produzir EROs, como o oxig?nio singlete (1O2), uma das formas mais reativas do oxig?nio molecular. O 1O2 ? capaz de oxidar guaninas, gerando les?es no DNA, como 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8-oxoG), o mais frequente produto da oxida??o, que durante a replica??o pode emparelhar com adenina levando ? muta??es. Foi de interesse desse estudo, caracterizar a citotoxicidade, o potencial mutag?nico e o padr?o de express?o prot?ica, durante o estresse oxidativo induzido pelo MB, usando como modelo cepas de Escherichia coli proficiente em reparo e deficientes em MutY-Glicosilase, uma enzima de reparo envolvida na corre??o de pares 8-oxoG:Adenina. Essas cepas foram tratadas com MB em presen?a ou aus?ncia de luz. O crescimento, sobreviv?ncia, a taxa de mutag?nese e padr?o de s?ntese prot?ica, foram analisados. O tratamento afetou o crescimento bacteriano, induzindo morte celular, mutag?nese, e mudan?as no padr?o de s?ntese prot?ica em ambas as cepas. Entretanto a cepa deficiente em MutY mostrou uma maior sensibilidade em rela??o a cepa proficiente. Adicionalmente, a cepa deficiente em MutY apresentou um padr?o de express?o prot?ica diferenciado quando comparado com a cepa proficiente. Esses resultados sugerem o envolvimento da MutY na corre??o de les?es de DNA n?o caracterizadas e que a aus?ncia de MutY induz altera??es no padr?o de express?o prot?ica

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