Objetive: To evaluate if the 4G/5G polymorphism of the plasminogen activator inhibitor-1 gene is likely to lead to increase risk of thromboembolic neurological complications and that these complications will increase length of mechanical ventilation and length of stay.Design: Prospective, case-control study. Setting: A 14 bed surgical intensive care unit of a university hospital.Patients: 260 consecutive patients who underwent cardiac surgery with cardiopulmonary bypass and 111 controls were enrolled.Interventions: DNA was isolated and 4G/5G polymorphism was typed using RFLP methodology. Measurements and results: Genetic analysis revealed 4G/5G in 131 patients (50.4%), 5G/5G genotype in 82 (31.5%), and 4G/4G in only 47 (18.1%). Prevalence of neurological complications was 20.8% (n= 54) [stroke 5.4% (n= 14) and encephalopathy 15.4% (n= 40)]. A two-fold increase in stroke (8.5% vs 4.7%; RR 1.9, 95% CI 0.7 to 6.3) and encephalopathy (27.7% vs 12.7%; RR 2.6, 95% CI 1.2 to 5.6) was documented in 4G/4G carriers. Multivariate analysis showed that development of stroke or encephalopathy was independently associated with prolonged mechanical ventilation (OR 20, 95% CI 1.2 to 5.6) and that neurological complication (OR 2.4, 95% CI 1.1 to 5.5) and 4G/4G genotype (OR 2.6, 95% CI 1.1 to 6.5) were independently associated with prolonged hospital length of stay ≥ 2 weeks. Conclusions: The 4G/4G genotype could increase the risk of thromboembolic neurological complications after cardiac surgery with cardiopulmonary by-pass. The neurological complications resulted in longer time on ventilator and longer hospital stay. / A consecuencia del carácter poligénico de las patologías que nos ocupan hace poco probable que un solo polimorfismo pueda explicar todas las complicaciones postoperatorias. Sin embargo, debemos subrayar que esta variación genética pudiera ser un factor de riesgo más que sumado a los ya referidos hiciera más probable la aparición de complicaciones neurológicas. A través del desarrollo de este tipo de complicaciones pudiera explicarse coherentemente que los pacientes estuvieran más tiempo bajo ventilación mecánica y fueran dados de alta más tardíamente del hospital. En definitiva, si futuros estudios confirmasen los presentes hallazgos, y los pacientes homocigotos 4G/4G (junto otros polimorfismos que puedan describirse en el futuro) pudieran considerarse de alto riesgo, la evaluación de estas variables genéticas podrían identificar precozmente pacientes en los cuales realizar una investigación preoperatorio más exhaustiva y considerar, cuando sea posible, la realización de técnicas quirúrgicas alternativas además de añadir información individual sobre el riesgo quirúrgico. Por tanto, nuestro estudio, además de aportar otra variable en el puzzle de etiopatogenia de las complicaciones neurológicas en el postoperatorio de cirugía cardiaca sugiere la consideración de de factores genéticos como marcadores o estratificadores de riesgo perioperatorio.