La peur est ce qui permet de réagir à un stimulus aversif par une réponse de défense adaptée à la situation. Elle peut être générée par un ensemble de stimuli naturellement aversifs ou par des stimuli ayant acquis une valeur aversive par apprentissage associatif. Cette thèse a pour but d'étudier les caractéristiques et modifications de la réponse de peur à ces deux types de stimuli au cours de l'ontogenèse. Les études présentées ici utilisent un conditionnement de peur à l'odeur chez le rat qui associe une odeur à un stimulus aversif et permet d'induire très rapidement et durablement des mémoires de peur à l'odeur. La réponse de défense peut alors être étudiée à la fois envers l'odeur apprise et envers le stimulus naturellement aversif. Nous montrons en particulier que la réponse de peur à l'odeur apprise présente un décours temporel corrélé à la durée de l'intervalle de temps entre l'odeur et le stimulus aversif, permettant d'affirmer que les animaux mémorisent et estiment le temps, et ce dès les premiers âges étudiés, avant la maturation des structures cérébrales classiquement impliquées dans cette mémoire temporelle. Par ailleurs, nous nous sommes intéressés aux vocalisations ultrasonores émises en réponse au stimulus aversif et à leur modification au cours de l'ontogenèse. Nous avons mis en évidence deux types de vocalisations chez le raton, dont les caractéristiques et critères d'induction laissent présager un rôle différentiel qui reste à explorer. L'ensemble de ces travaux soulignent que, même si les réponses de défense du rat changent au cours du développement, la capacité à produire ces réponses de manière temporellement adaptée est observée dès le plus jeune âge / Fear allows individuals to react to an aversive stimulus by a defense response adapted to the situation. It can be triggered by naturally aversive stimuli or in response to stimuli that acquired an aversive valence through associative learning. This thesis investigated the characteristics and modifications of fear responses to these two types of stimuli throughout ontogeny. The studies presented here used olfactory fear conditioning in rat, in which an odor is paired with an aversive event and allows to rapidly induce long lasting odor fear memories. Defense responses can then be studied both to the learned odor and to the naturally aversive stimulus. We showed in particular that fear response to the learned odor presents a temporal pattern correlated with the duration of the time interval between the odor and the aversive event, showing that rats can learn about time and they do so at the youngest ages studied here, before the maturation of the brain structures classically involved in interval timing. We also studied the ultrasonic vocalizations emitted in response to the aversive stimulus and their changes throughout ontogeny. We described two types of vocalizations in pups that differ in their characteristics and emission context, suggesting they could have different functions, which needs further exploration. These thesis findings highlight that although the rat’s defense responses changes through ontogeny, the ability to produce temporally adapted responses occurs from the youngest age

Tout au long de la vie, le cerveau développe des représentations de son environnement permettant à l’individu d’en tirer meilleur profit. Comment ces représentations se développent-elles pendant la quête de récompenses demeure un mystère. Il est raisonnable de penser que le cortex est le siège de ces représentations et que les ganglions de la base jouent un rôle important dans la maximisation des récompenses. En particulier, les neurones dopaminergiques semblent coder un signal d’erreur de prédiction de récompense. Cette thèse étudie le problème en construisant, à l’aide de l’apprentissage machine, un modèle informatique intégrant de nombreuses évidences neurologiques. Après une introduction au cadre mathématique et à quelques algorithmes de l’apprentissage machine, un survol de l’apprentissage en psychologie et en neuroscience et une revue des modèles de l’apprentissage dans les ganglions de la base, la thèse comporte trois articles. Le premier montre qu’il est possible d’apprendre à maximiser ses récompenses tout en développant de meilleures représentations des entrées. Le second article porte sur l'important problème toujours non résolu de la représentation du temps. Il démontre qu’une représentation du temps peut être acquise automatiquement dans un réseau de neurones artificiels faisant office de mémoire de travail. La représentation développée par le modèle ressemble beaucoup à l’activité de neurones corticaux dans des tâches similaires. De plus, le modèle montre que l’utilisation du signal d’erreur de récompense peut accélérer la construction de ces représentations temporelles. Finalement, il montre qu’une telle représentation acquise automatiquement dans le cortex peut fournir l’information nécessaire aux ganglions de la base pour expliquer le signal dopaminergique. Enfin, le troisième article évalue le pouvoir explicatif et prédictif du modèle sur différentes situations comme la présence ou l’absence d’un stimulus (conditionnement classique ou de trace) pendant l’attente de la récompense. En plus de faire des prédictions très intéressantes en lien avec la littérature sur les intervalles de temps, l’article révèle certaines lacunes du modèle qui devront être améliorées. Bref, cette thèse étend les modèles actuels de l’apprentissage des ganglions de la base et du système dopaminergique au développement concurrent de représentations temporelles dans le cortex et aux interactions de ces deux structures. / Throughout lifetime, the brain develops abstract representations of its environment that allow the individual to maximize his benefits. How these representations are developed while trying to acquire rewards remains a mystery. It is reasonable to assume that these representations arise in the cortex and that the basal ganglia are playing an important role in reward maximization. In particular, dopaminergic neurons appear to code a reward prediction error signal. This thesis studies the problem by constructing, using machine learning tools, a computational model that incorporates a number of relevant neurophysiological findings. After an introduction to the machine learning framework and to some of its algorithms, an overview of learning in psychology and neuroscience, and a review of models of learning in the basal ganglia, the thesis comprises three papers. The first article shows that it is possible to learn a better representation of the inputs while learning to maximize reward. The second paper addresses the important and still unresolved problem of the representation of time in the brain. The paper shows that a time representation can be acquired automatically in an artificial neural network acting like a working memory. The representation learned by the model closely resembles the activity of cortical neurons in similar tasks. Moreover, the model shows that the reward prediction error signal could accelerate the development of the temporal representation. Finally, it shows that if such a learned representation exists in the cortex, it could provide the necessary information to the basal ganglia to explain the dopaminergic signal. The third article evaluates the explanatory and predictive power of the model on the effects of differences in task conditions such as the presence or absence of a stimulus (classical versus trace conditioning) while waiting for the reward. Beyond making interesting predictions relevant to the timing literature, the paper reveals some shortcomings of the model that will need to be resolved. In summary, this thesis extends current models of reinforcement learning of the basal ganglia and the dopaminergic system to the concurrent development of representation in the cortex and to the interactions between these two regions.

Tout au long de la vie, le cerveau développe des représentations de son environnement permettant à l’individu d’en tirer meilleur profit. Comment ces représentations se développent-elles pendant la quête de récompenses demeure un mystère. Il est raisonnable de penser que le cortex est le siège de ces représentations et que les ganglions de la base jouent un rôle important dans la maximisation des récompenses. En particulier, les neurones dopaminergiques semblent coder un signal d’erreur de prédiction de récompense. Cette thèse étudie le problème en construisant, à l’aide de l’apprentissage machine, un modèle informatique intégrant de nombreuses évidences neurologiques. Après une introduction au cadre mathématique et à quelques algorithmes de l’apprentissage machine, un survol de l’apprentissage en psychologie et en neuroscience et une revue des modèles de l’apprentissage dans les ganglions de la base, la thèse comporte trois articles. Le premier montre qu’il est possible d’apprendre à maximiser ses récompenses tout en développant de meilleures représentations des entrées. Le second article porte sur l'important problème toujours non résolu de la représentation du temps. Il démontre qu’une représentation du temps peut être acquise automatiquement dans un réseau de neurones artificiels faisant office de mémoire de travail. La représentation développée par le modèle ressemble beaucoup à l’activité de neurones corticaux dans des tâches similaires. De plus, le modèle montre que l’utilisation du signal d’erreur de récompense peut accélérer la construction de ces représentations temporelles. Finalement, il montre qu’une telle représentation acquise automatiquement dans le cortex peut fournir l’information nécessaire aux ganglions de la base pour expliquer le signal dopaminergique. Enfin, le troisième article évalue le pouvoir explicatif et prédictif du modèle sur différentes situations comme la présence ou l’absence d’un stimulus (conditionnement classique ou de trace) pendant l’attente de la récompense. En plus de faire des prédictions très intéressantes en lien avec la littérature sur les intervalles de temps, l’article révèle certaines lacunes du modèle qui devront être améliorées. Bref, cette thèse étend les modèles actuels de l’apprentissage des ganglions de la base et du système dopaminergique au développement concurrent de représentations temporelles dans le cortex et aux interactions de ces deux structures. / Throughout lifetime, the brain develops abstract representations of its environment that allow the individual to maximize his benefits. How these representations are developed while trying to acquire rewards remains a mystery. It is reasonable to assume that these representations arise in the cortex and that the basal ganglia are playing an important role in reward maximization. In particular, dopaminergic neurons appear to code a reward prediction error signal. This thesis studies the problem by constructing, using machine learning tools, a computational model that incorporates a number of relevant neurophysiological findings. After an introduction to the machine learning framework and to some of its algorithms, an overview of learning in psychology and neuroscience, and a review of models of learning in the basal ganglia, the thesis comprises three papers. The first article shows that it is possible to learn a better representation of the inputs while learning to maximize reward. The second paper addresses the important and still unresolved problem of the representation of time in the brain. The paper shows that a time representation can be acquired automatically in an artificial neural network acting like a working memory. The representation learned by the model closely resembles the activity of cortical neurons in similar tasks. Moreover, the model shows that the reward prediction error signal could accelerate the development of the temporal representation. Finally, it shows that if such a learned representation exists in the cortex, it could provide the necessary information to the basal ganglia to explain the dopaminergic signal. The third article evaluates the explanatory and predictive power of the model on the effects of differences in task conditions such as the presence or absence of a stimulus (classical versus trace conditioning) while waiting for the reward. Beyond making interesting predictions relevant to the timing literature, the paper reveals some shortcomings of the model that will need to be resolved. In summary, this thesis extends current models of reinforcement learning of the basal ganglia and the dopaminergic system to the concurrent development of representation in the cortex and to the interactions between these two regions.