Les travaux de recherche présentés dans cette thèse visent à proposer un modèle de coordination de négociations déroulées dans le cadre d'une alliance d'entreprises. Notre recherche se place ainsi dans les domaines des alliances virtuelles, de la négociation automatique et de la coordination. Dans ce cadre large, nous présentons et défendons la thèse selon laquelle un processus de négociation peut être décomposé en trois processus distincts : décision, coordination et communication. Une autre dimension de la contribution scientifique de cette thèse est de poser les fondements d'un modèle de coordination générique, décentralisé et flexible. Ce modèle sépare le processus de coordination des deux autres en faisant que le processus de coordination est indépendant de la stratégie de négociation ou du protocole de négociation, s'adaptant donc à différents types de négociations.