L'objectif de cette thèse est de définir une méthodologie de mise en oeuvre et de prototypage d'un progiciel de gestion d'entreprise, ou ERP (Entreprise Resources Planning). En effet, le processus de mise en oeuvre d'un tel système informatique est long, coûteux et complexe à mener. Il est donc nécessaire de définir une méthode de travail, ainsi que des outils supports associés. Les premiers chapitres sont consacrés à la présentation de la problématique et des méthodes traitant de cette problématique : les méthodes de modélisation en entreprise. Nous présentons successivement IDEF, Merise, OMT/UML, puis GRAI/GIM, CIMOSA , PERA et GERAM. Le Business Process Reengineering (BPR) est ensuite présenté, ainsi que les outils informatiques associés à ce type de démarche. Nous retenons de cet état de l'art les concepts de processus, d'activité, ainsi que le principe d'une modélisation hiérarchisée pour représenter un système industriel. Nous exposons ensuite la démarche proposée. Dans une première partie, nous abordons cette démarche de façon globale, puis en détaillons chacune des phases. Celle-ci se base sur l'intégration lors de la reconception de l'entreprise, après son analyse, des contraintes inhérentes à l'implantation d'un ERP, ainsi que des spécificités de l'ERP choisi. La seconde partie est consacrée au cœur de ce travail de recherche, c'est à dire le prototypage. Nous proposons de construire un modèle instancié par 2 vues fonctionnelle (processus d'entreprise) et opérationnelle (ERP à implanter). Pour aider le travail du consultant, nous décrivons un ensemble d'outils à mettre en œuvre, dont l'aide à la rédaction de comptes-rendus. Enfin, la dernière partie présente MIT (Mapics Implementation Tool), l'outil d'aide à la mise en œuvre de l'ERP Mapics XA. Cet outil a été développé dans le cadre d'un contrat industriel avec ILSYS, une société de service spécialisée dans la mise en œuvre de cet ERP.