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Variabilidade genética e endogamia em um plantel comercial de codornas (Coturnix japonica) / Genetic variability and inbreeding on a quail (Coturnix japonica) commercial flockResende, Lucileide Vilela 15 March 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-03-15 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / This study aimed to estimate the genetic diversity and inbreeding, perform genetic
relationships analysis, and estimate heritability for morphometric variables in
quails using microsatellite markers. We used the following morphometric
measurements: weight (PO), length (CO), and width (LO) of eggs, weight (P), body length (CC), length (CB), height (AB), and width (LB) of beak, wing length
(CA), tarsus length (CT), and toe length (CD). We verified the genetic association
for the morphometric variables in the progenies. Also, we checked whether
features P, CC, CB, AB, LB, CA, CT, and CD were related to the amount of
offspring (QF) from adults in quail families from a commercial flock. We used
seven cages containing six females and two males each, which resulted in a
progeny of 672 individuals. The genotypes of the individuals were obtained in an
automated DNA sequencer. Genotypes were used for genetic diversity, inbreeding,
and genetic link analyzes of two generations, and to perform analyzes of variance
components, descriptive statistics, Pearson correlations, heritability, t-test, and Utest
of Mann-Whitney. In the parental generation we found high probability of
combined paternity exclusion (PE = 0.999956), low probability of combined
identity (PI = 1.47 x 10-13), and that null alleles frequency was near zero. The
values of expected (He) and observed (Ho) heterozygosity, and polymorphism
information content (PIC) were equal to 0.768, 0.766 and 0.734, respectively,
indicating a high genetic diversity. When we assessed only the progenies, the
genetic diversity was maintained (He = 0.760, Ho = 0.757 and PIC = 0.725). The
inbreeding coefficient (f) was low and not significant. The genetic link analysis was
efficient to assign paternity and maternity for 97% of the progeny. The weight of
the offspring at birth and the variables analyzed in eggs are highly correlated.
There is also a significant correlation between most measures analyzed. Estimates
of heritability values were considered moderate to high. The average number of
offspring was 15.93 per female, and 44.6 for males. Females were, on average,
heavier than males. The QF was only correlated with the CC in females. We found
significant difference between the weight of heavier males when compared to
lighter males, but the comparison between QF and weight category was not
significant. These results indicated that the 12 microsatellite markers used in the
study were robust for the genetic relationships and genetic variability analysis in
this species. We also found that the egg’s variables and progeny’s weight were
highly correlated, and heritability estimates ranged from moderate to high in the
variables analyzed. Females were heavier than males, QF was correlated only with
CC in females, and there was no significant difference between heavier males and
lighter males. All these information may be useful in future breeding programs for
Coturnix japonica. / O objetivo deste estudo foi utilizar marcadores microssatélites para estimar
diversidade genética e endogamia, realizar análises de vínculo genético, estimar a
herdabilidade para as variáveis morfométricas: peso (PO), comprimento (CO) e
largura do ovo (LO), peso (P), comprimento do corpo (CC), comprimento do bico
(CB), altura do bico (AB), largura do bico (LB), comprimento da asa (CA),
comprimento do tarso (CT) e comprimento do dedo (CD) e verificar a associação
genética para estas variáveis nas progênies e verificar quais características: P, CC,
CB, AB, LB, CA, CT e CD estão relacionadas com quantidade de filhos (QF) nos
adultos em famílias oriundas de um plantel comercial de codornas. Para o
desenvolvimento do trabalho foi instalado um experimento com sete gaiolas
contendo seis fêmeas e dois machos, resultando em uma progênie de 672
indivíduos. O genótipo dos indivíduos foi obtido em sequenciador automático de
DNA. Os genótipos foram utilizados para realização das análises de diversidade
genética, endogamia e vínculo genético nas duas gerações e para realizar análises
de componentes de variância, estatísticas descritivas, correlações de Pearson,
herdabilidade, teste t e teste U de Mann-Whitney. Considerando a geração
parental foi encontrada alta probabilidade de exclusão de paternidade combinada
(PE = 0,999956), baixa probabilidade de identidade combinada (PI = 1,47x10-13) e
frequência de alelos nulos próximas a zero. Os valores de heterozigosidade
esperada (He) e observada (Ho) e conteúdo de informação polimórfica (PIC) foram
iguais a 0,768, 0,766 e 0,734 respectivamente, indicando uma elevada
diversidade genética. A diversidade genética foi mantida quando se avaliou apenas
as progênies (He = 0,760, Ho = 0,757 e PIC = 0,725). O coeficiente de endogamia
(f) foi baixo e não significativo. A análise de vínculo genético foi eficiente para
atribuir a paternidade e maternidade para 97% das progênies. O peso das
progênies ao nascimento e as variáveis analisadas nos ovos estão altamente
correlacionadas e também existe correlação significativa entre a maioria das
medidas. As estimativas de herdabilidade encontradas são consideradas de
moderada a alta. A média de filhotes por fêmea foi 15,93 e de machos 44,6, com
fêmeas, em média, mais pesadas que os machos. A QF só foi correlacionada com o
CC das fêmeas. Houve diferença significativa entre o peso dos machos mais
pesados em relação aos mais leves, mas a comparação da QF por categoria de
peso não foi significativa. Esses resultados permitem concluir que este painel de
12 marcadores microssatélites é robusto para a realização de análises de vínculo
genético e para estudos de variabilidade genética nesta espécie, com as variáveis
analisadas nos ovos e peso das progênies altamente correlacionadas, estimativas
de herdabilidades moderadas a altas para as variáveis analisadas. As fêmeas são
mais pesadas que os machos, QF só está correlacionada com o CC das fêmeas,
não apresentando diferença significativa entre o peso dos machos mais pesados
em relação aos mais leves. Essas informações podem ser úteis em futuros
programas de melhoramento genético para Coturnix japonica.
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