Orientador: George John Shepherd / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T21:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barros_Fabiode_D.pdf: 15772774 bytes, checksum: 5d83f348bf7b068ac79b5873a00fd3d4 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Foi analisada a distribuição geográfica de 72 espécies de orquídeas nativas dos campos rupestres, através de técnicas de análise multivariada, incluindo métodos de agrupamento e de ordenação. Como métodos de agrupamento foram utilizados UPGMA e o método de Ward, tendo como medidas de distância, respectivamente, o coeficiente de Jaccard e Jaccard-complemento (coeficiente de Jaccard subtraído de 1). Também foi aplicado TWINSPAN, que realiza um agrupamento divisivo baseado numa partição inicial por CA. Como métodos de ordenação foram utilizados CA (Análise de Correspondência) e DCA (Análise de Correspondência Distendida). Nas matrizes básicas para análise (espécies X localidades), cada localidade correspondeu a uma quadrícula definida por graus de latitude e longitude. F oram montadas matrizes para: (a) todas as espécies em conjunto, (b) apenas as espécies epífitas e (c) apenas as espécies terrestres e, ainda, combinando dois tamanhos de quadrícula: (a) 2 X 2º e (b) 5 X 5º. Desse modo foram montadas seis matrizes básicas, definindo a presença ou ausência de cada espécie em cada quadrícula e cada uma dessas matrizes foi analisada por todos os métodos utilizados. As matrizes foram montadas a partir de um banco de dados com informações de distribuição retiradas de materiais de herbário e da literatura especializada, onde cada localização foi dada pelas coordenadas geográficas (latitude / longitude). As análises de agrupamento delimitaram elementos florísticos interpretáveis, mas os dados não foram muito consistentes. TWINSPAN não mostrou bons resultados, exceto para a matriz de 5 X 5º de espécies epífitas. As análises de ordenação deram resultados interpretáveis em função dos agrupamentos previamente estabelecidos, mas apenas para os dois primeiros eixos de ordenação. CA e DCA tiveram desempenho muito semelhante e mostraram forte influência do número de quadrículas ocupadas por cada espécie. Apesar das limitações da amostragem e das diferenças entre os métodos, alguns padrões básicos de distribuição (elementos florísticos ou corotipos) foram bem delimitados: (a) espécies endêmicas ou com distribuição restrita; (b) espécies com distribuição ampla (por toda a América do Sul); (c) espécies com distribuição predominante nos campos rupestres; (d) espécies com distribuição estendendo-se em direção à região das Guianas; (e) espécies com distribuição estendendo-se em direção ao nordeste do Brasil (normalmente presentes também nas Guianas); (f) espécies estendendo..se em direção ao sul da América do Sul; (g) espécies com distribuição isolada / Abstract: The geographical distribution of 72 orchid species from the "campos ruprestres" vegetation of Brazil, was analysed using multivariate methods, inc1uding c1ustering and ordination. The data set used was constructed by first creating a data bank with informations on the distribution (latitude and longitude) and habitat of each based on herbarium material and citations in floras and floristic studies. A series of six data matrices was created, based on 5 X 5 and 2 X 2 latitude / longitude squares for three habitat combinations - epiphytic, terrestrial and complete (combined). Group mean (UPGMA) and Ward's method c1ustering were used with Jaccard and Jaccard complement coefficients for c1ustering. CA and DCA were used as ordination techniques. TWINSPAN analysis was also used for some data sets. The c1ustering methods suggested that some floristic elements could be recognized, but TWINSPAN analysis showed very little agreement with these, except in the 5 X 5 epiphyte matrix. The ordination methods gave interpretable results, mainly on first two axes. Although some elements could be recognized, a large number of species could not be assigned with confidence to any of the designated elements, and it was c1ear that no simple overall c1assiftcation of floristic elements was possible. There was no obvious difference between epiphytic and terrestrial species. Results of analyses were greatly influenced by the size of square used, and by overall frequency of occurrence of the species as reflected in the number of squares they occupied. / Doutorado / Doutor em Ciências

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-14T18:25:04Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 15350 bytes, checksum: dfb862c1ae844570018456c3a9ff28f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-14T18:25:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 15350 bytes, checksum: dfb862c1ae844570018456c3a9ff28f4 (MD5) Previous issue date: 2005-02-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi padronizar as condições de obtenção e regeneração de protoplastos de Epulorhiza repens e Ceratorhiza sp. e determinar o cariótipo eletroforético de Ceratorhiza sp. Para o fungo Epulorhiza repens, a maior produção de protoplastos, 8,0 x 10 6 protoplastos/mL, foi obtida em KCl 0,6 M, na presença de 15 mg/mL de “Lysing Enzymes” e 0,5 g de micélio fúngico com 2 dias idade, após fragmentação em liquidificador. A maior freqüência de regeneração obtida foi de 8,5 % quando sacarose 0,5 M foi utilizada como estabilizador osmótico. Do total de protoplastos obtidos, 58,6 % eram uninucleados, 21,4 % binucleados e 20 % anucleados. Para o fungo Ceratorhiza sp., a maior produção de protoplastos, 4,0 x 10 7 protoplastos/mL, foi obtida em NaCl 0,6 M, na presença de 15 mg/mL de “Lysing Enzymes” e 15mg/mL de Glucanex, 0,5 g de micélio fúngico com 2 dias de idade, após fragmentação em liquidificador. A maior freqüência de regeneração obtida foi de 6,7 % utilizando sacarose 0,5 M como estabilizador osmótico. Do total de protoplastos obtidos, 61 % eram uninucleados, 24,6 % binucleados, 3,2 % trinucleados e 11,2 % anucleados. O cariótipo eletroforético do fungo Ceratorhiza sp. apresentou no mínimo, 3 cromossomos cujos tamanhos foram estimados em 4,6; 3,5 e 2,2 Mb. A maior intensidade da banda de 4,6 Mb sugere que esta possa estar representando dois cromossomos, sendo o tamanho do genoma estimado em pelo menos 14,9 Mb. O estabelecimento de protocolos otimizados para obtenção e regeneração de protoplastos dos fungos Epulorhiza repens e Ceratorhiza sp. é importante, permitindo o estabelecimento de técnicas de transformação genética, o isolamento de mutantes, a determinação de cariótipo eletroforético e o cruzamento de linhagens. O cariótipo de Ceratorhiza sp. é importante para a determinação do número e do tamanho dos cromossomos, para se estimar o tamanho do genoma e a localização de genes relacionados à formação de micorrizas. / This study was conducted in order to standardize the formation conditions and regeneration of Epulorhiza repens and Ceratorhiza sp. protoplasts and also to determine the electrophoretic karyotype of Ceratorhiza sp. For Epulorhiza repens, the highest production of protoplasts, 8,0 x 10 6 protoplasts/mL, was obtained in KCl 0,6 M, with 15 mg/mL of “Lysing Enzymes” and 0,5 g of mycelium at 2 days, after fragmentation in the liquefier. The best regeneration frequency, 8,5 %, was achieved when sucrose 0,5 M was used as an osmotic stabilizer. From total protoplasts obtained, 58,6 % were uninucleate, 21,4 % binucleate and 20 % anucleate. For Ceratorhiza sp. the highest production of protoplasts, 4,0 x 10 7 protoplasts/mL, was obtained in NaCl 0,6 M, with 15 mg/mL of “Lysing Enzymes” and 15 mg/mL of Glucanex, and 0,5 g of mycelium at 2 days, after fragmentation in the liquefier. The best regeneration frequency, 6,7 %, was achieved when sucrose 0,5 M was used as an osmotic stabilizer, and from total protoplasts obtained, 61 % were uninucleate, 24,6 % binucleate, 3,2 % trinucleate and 11,2 % anucleated. The electrophoretic karyotype of Ceratorhiza sp. showed at least 3 chromosomes around 4,6; 3,5 and 2,2 ixMb. The highest intensity of the band 4,6 Mb suggests that it represents two chromosomes, and the genome height was estimated in, at least, 14,9 Mb. It is important to establish optimized protocols for obtaining and regenerating protoplasts of Epulorhiza repens and Ceratorhiza sp. to allow the establishment of techniques of genetic transformation, mutant isolation, electrophoretic karyotype determination and crossings between strains. Ceratorhiza sp. karyotype is important to determine chromosomes number and height, to estimate genome height and gene localization related to mycorrhizas formation.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-20T15:06:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 676315 bytes, checksum: a451bf2e2060adec62ba8c114611d497 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-20T15:06:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 676315 bytes, checksum: a451bf2e2060adec62ba8c114611d497 (MD5) Previous issue date: 2009-12-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Há uma grande demanda por técnicas de laboratório mais simples e de menor custo e por procedimentos mais acessíveis a orquidófilos que não têm o embasamento teórico necessário à utilização de métodos usuais de produção seminífera e clonal de orquídeas in vitro. Neste trabalho, três experimentos foram conduzidos com os objetivos de avaliar a desinfestação química com hipoclorito de sódio (NaClO) de sementes e de tecidos de orquídeas para a produção de mudas in vitro, e testar a utilização de seringa descartável para o cultivo de tecidos, de modo a dispensar, em todos os casos, o uso de câmara de fluxo laminar. No primeiro experimento, sementes de Cattleya intermedia foram tratadas com seis concentrações de NaClO, variando de 1,2 a 4.800 mg L-1 de NaClO e semeadas utilizando-se dois métodos de cultivo: inoculação de sementes em frascos via seringa descartável, através de um furo em tampa de frascos de vidro, ou, abrindo-se o frasco, retirando-se a tampa, e colocando as sementes sobre o meio. Em ambos os métodos, as sementes foram inoculadas via 2 mL de suspensão semente-NaClO. Estes métodos foram comparados com o tradicional (controle), conduzido em câmara de fluxo laminar; com as sementes previamente desinfestadas com NaClO na concentração de 2.400 mg L -1 , corresponde a 100 mL L -1 de água sanitária comercial (ASC), e enxaguadas em H 2 O, mas sem a aplicação de NaClO aos meios nos frascos com as sementes. No segundo experimento, estudou-se a eficiência de concentrações de NaClO, variando de 1.200 a 6.000 mg L -1 (50 a 250 mL L -1 de ASC) aplicadas nos meios de cultura, na ausência ou presença de carvão ativado, em comparação à utilização de câmara de fluxo laminar sem a aplicação, neste caso, de NaClO nos meios, com os tecidos (explantes). Foram utilizados explantes de duas espécies de orquídeas: Arundina bambusifolia e Epidendrum ibaguenses. No terceiro experimento, estudou-se a utilização de seringa descartável, em substituição à câmara de fluxo laminar, utilizando três meios (MS1/2, GB5 e VW) e duas concentrações de três reguladores de crescimento (TDZ, ANA e BAP), para a obtenção de mudas de Phalaenopis spp. e de um híbrido de Dendrobium nobile, via cultura de tecidos. Como tratamento controle, utlizou-se o meio MS1/2 com 1,0 mg L -1 de TDZ em tubos de ensaio, com os explantes cultivados em condições normais, utilizando-se de câmara de fluxo. Não houve contaminação dos meios de cultura inoculados com a suspensão semente – NaClO. A presença do NaClO nas menores concentrações promoveu maior taxa de germinação e crescimento das plantas, em relação à sua não utilização (tratamento controle). A câmara de fluxo laminar mostrou-se desnecessária em relação à desinfestação feita com NaClO no meio de cultura. A aplicação de NaClO sobre o meio de cultura inoculado com os tecidos das plantas promoveu eficiente controle da contaminação. As maiores concentrações de NaClO causaram redução no crescimento das plantas. O uso de carvão ativado promoveu melhores resultados em termos de produção de plantas mas, por outro lado, a contaminação foi maior em sua presença. A utilização de seringa descartável mostrou-se viável para a propagação vegetativa das plantas. Embora, com alguns efeitos médios significativos, a diferença entre meios de cultura, reguladores de crescimento e suas concentrações apresentaram tendência geral para a similaridade dos dados de crescimento das plantas, evidenciando a possível simplificação dos procedimentos de desinfestação e cultivo. / There is a great demand for simpler and less costly laboratory techniques and for more accessible procedures for orchid breeders who do not have the necessary theoretical basis to use the traditional seed and clone production methods of orchids in vitro. In this study, three experiments were conducted with the purpose of evaluating chemical disinfection with sodium hypochlorite (NaClO) of orchid seeds and tissues for seedling production in vitro, and to test the use of disposable syringes for tissue culture, to dispense with the use of laminar flow in all cases. In the first experiment, seeds of Cattleya intermedia were treated with six NaClO concentrations between 1.2 and 4,800 mg L -1 NaCl, seeded by two methods: seed inoculation in glass jars with a disposable syringe through a hole in the lid, or by opening the jar, removing the lid, and placing the seeds on the medium. In both methods, seeds were inoculated in 2 mL seed – NaClO suspension. These methods were compared with the traditional (control) method, using laminar flow. After previous disinfection with NaClO at a concentration of 2400 mg L -1 , corresponding to 100 mL L -1 commercial bleach (CB), the seeds were rinsed in H 2 O, but without NaClO application to the media in the jars with the seeds. In the second experiment the effectiveness of NaCl concentrations between 1200 and 6,000 mg L -1 (50–250 mL L -1 CB) for the tissues (explants) was tested, applied to culture media in the absence or presence of activated carbon, in comparison with the use of laminar flow without the NaClO application to the media. Explants of two orchid species, Arundina bambusifolia and Epidendrum ibaguenses, were used. The third experiment tested the use of disposable syringes, instead of laminar flow, in three media (MS1/2, GB5 and VW) and with two concentrations of three growth regulators (TDZ, NAA and BAP) for obtaining Phalaenopis spp. seedlings and a Dendrobium nobile hybrid by tissue culture. In the control treatment, the MS1/2 medium was used with 1.0 mg L -1 TDZ in test tubes, and the explants were cultured under normal conditions, using a flow chamber. No contamination was observed in the culture media inoculated with seed – NaClO suspension. At low NaClO concentrations the germination and plant growth rates were higher than in absence of NaClO (control). In comparison, it was found that the application of NaClO dispensed with the use of laminar flow. The contamination control with NaClO application to the culture medium inoculated with the plant tissues was efficient. The highest NaClO concentrations resulted in reduced plant growth. The use of activated carbon led to the best results in terms of plant production while on the other hand, contamination was higher in their presence. The use of disposable syringes was feasible for the vegetative propagation of plants. However, with some significant mean effects, the difference between culture media, growth regulators and their concentrations generally tended to data similarity regarding plant growth, suggesting a possible simplification of the sterilization and cultivation procedures.