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Diversidade genética do programa de melhoramento do guaranazeiro (Paullinia Cupana var. sorbilis ( Mart.) Ducke), utilizando marcadores Trap e Srap

Silva, Elizangela Farias da 28 March 2014 (has links)
Submitted by Inês Marinho (bele_ballet@hotmail.com) on 2016-06-17T13:49:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:43:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T20:45:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elizangela Farias da Silva.pdf: 725923 bytes, checksum: 334a610c50bdeda8b5392f39f6dc8ef9 (MD5) Ficha Catalografica - Elisangela Farias da Silva.pdf: 1668 bytes, checksum: 348f03e4b80e3cc81c27a3851b251ad0 (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native species from the Amazon region rich in natural caffeine. Embrapa Western Amazon develops guarana breeding program based on clonal selection and recurrent selection to obtain cultivars and progenies with desirable agronomic characteristics. The use of molecular markers has been successfully applied in breeding programs to monitor genetic diversity and assist in marker-assisted selection. Thus, the present study aims to evaluate the genetic diversity of guarana improvement program, using TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) and the SRAP (Sequence-Related Amplification Polymorphism). The work was divided into two parts: the first to test the potential of TRAP and SRAP markers, using subsamples of 60 BAG (Active Germplasm Bank) and the second to analyze the genetic diversity six progenies of half brothers guarana. In the BAG a polymorphism observed percentage of 79% (TRAP) and 74.5% (SRAP). The Dice coefficient ranged from 0.64 to 0.87, forming four groups in the dendrogram, where one concentrated 82% of the studied material. In the progenies of half brothers, polymorphism percentage was 85% for the TRAP and 76% for SRAP. The genetic diversity of Nei (H) was 0.20 and the Shannon index (I) of 0.30. The AMOVA showed that the highest percentage of variation is within the progenies (54%). With these results, the TRAP and SRAP markers showed potential genetic diversity studies in guarana breeding program. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma espécie nativa da região amazônica rica em cafeína natural. A Embrapa Amazônia Ocidental desenvolve programa de melhoramento de guaranazeiro baseado em seleção clonal e seleção recorrente para obtenção de cultivares e progênies com características agronômicas desejáveis. O uso de marcadores moleculares tem sido aplicado com sucesso em programas de melhoramento para monitorar a diversidade genética e auxiliar na seleção assistida por marcadores. Com isso, a presente pesquisa visa avaliar a diversidade genética do programa de melhoramento do guaranazeiro, usando TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) (Sequence - Related e o SRAP Amplification Polymorphism). O trabalho foi dividido em duas partes: a primeira para testar o potencial dos marcadores TRAP e SRAP, usando 60 subamostras do BAG (Banco Ativo do Germoplasma) e a segunda para análise da diversidade genética de seis progênies de meios-irmãos de guaranazeiro. No BAG observou-se um percentual de polimorfismo de 79% (TRAP) e 74,5% (SRAP). O coeficiente de Dice variou de 0,64 a 0,87, formando quatro grupos no dendrograma, onde um deles concentrou 82% do material estudado. Nas progênies de meios irmãos, o percentual de polimorfismo foi 85% para o TRAP e 76% para SRAP. A diversidade genética de Nei (H) foi de 0,20 e o índice de Shannon (I) de 0.30. A AMOVA mostrou que o maior percentual de variação se encontra dentro das progênies (54%). Com estes resultados, os marcadores TRAP e SRAP mostraram potencial em estudos de diversidade genética no programa de melhoramento de guaranazeiro.
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Caracterização citogenética de espécies e variedades de bambu com potencial econômico no Nordeste brasileiro / Cytogenetic characterization of species and varieties of bamboo with economic potential in the Brazilian Northeast

SILVA, Janaina Teixeira da 24 August 2007 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-26T12:43:27Z No. of bitstreams: 1 Janaina Teixeira da Silva.pdf: 438623 bytes, checksum: 514069070882dfcad2b59f12ecbc37c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-26T12:43:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Janaina Teixeira da Silva.pdf: 438623 bytes, checksum: 514069070882dfcad2b59f12ecbc37c4 (MD5) Previous issue date: 2007-08-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Bambusa vulgaris is cultivated in Pernambuco, Paraíba and Maranhão states, aiming at to the production of cellulose with longer staple fibres for manufacture of high quality paper for packings. The improvement program of this and the too much species of bamboo in the region depends on the study of the cytogenetic variability to inform of its potentials for genetic manipulation. The present paper characterized cytogenetically six species, with two varieties of bamboo with economic potential for the Northeast of Brazil using conventional technique,banding with fluorochromes (CMA3 and DAPI) and Nitrate of Silver (AgNO3). The results had not shown differences in the chromosomic number of the species Dendrocalamus giganteus (2n=64), D. strictus (2n=64), D. asper (2n=64) and Bambusa tuldoides (2n=64), as well as B. textilis (2n=72) and B. vulgaris var. vittata (2n=72), however the last specie had distinct number of its another variety B. vulgaris var. vulgaris (2n=54). The basic numbers ranges from x=8 to x=12 and the level ploidy varied from hexaploid to octaploid. In general, the species had presented high chromosomic number and had not presented karyotype symmetrical. The structure of the interphase nucleus had been semireticulated with presence of some chromocenteres. The morphology of the chromosomes for all the analyzed species consist of metacentric and submetacentric. The double coloration with fluorochromes CMA3 and DAPI evidenced blocks CMA3+/DAPI- in the terminal region in chromosomes of all the analyzed species. In this coloration, in metaphase, had revealed secondary constrictions and had evidenced satellites in B. tuldoides, B. textilis, D. asper and D. giganteus. The others species had evidenced NOR`s (Nucleolar Organization Regions). The coloration with AgNO3 showed the occurrence of only one great nucleolar that occupies almost all part of the interphase nucleus in all the species. / Bambusa vulgaris é amplamente cultivada nos estados de Pernambuco, Paraíba e Maranhão, visando à produção de celulose com fibras mais longas para fabricação de papel de alta qualidade para embalagens. O programa de melhoramento das espécies de bambu na região depende do estudo da variabilidade citogenética para disponibilizar informações de seus potenciais para manipulação genética. O presente trabalho teve por objetivo caracterizar citogeneticamente, através de técnica convencional, bandeamento com fluorocromos (CMA3 e DAPI) e com Nitrato de Prata (AgNO3), seis espécies de bambu, sendo duas variedades com potencial econômico para o Nordeste. Os resultados obtidos mostraram semelhança no número cromossômico de Dendrocalamus giganteus (2n=64), D. strictus (2n=64), D. asper (2n=64), Bambusa tuldoides (2n=64), como também para B. textilis (2n=72) e B. vulgaris var. vittata (2n=72), tendo a última número distinto de sua outra variedade B. vulgaris var. vulgaris (2n=54). Os números básicos sugeridos variaram de x=8 a x=12 e o nível de ploidia de hexaplóide a octaplóide. Em geral, as espécies apresentaram elevado número cromossômico e cariótipo assimétrico. Os núcleos interfásicos foram dos tipos semi-reticulado com presença de alguns cromocentros. A morfologia dos cromossomos para todas as espécies analisadas variou de metacêntrico a submetacêntrico. A dupla coloração com fluorocromos CMA3 e DAPI evidenciou blocos CMA3 +/DAPI- na região terminal em cromossomos de todas as espécies analisadas. Nesta coloração, em metáfases, constrições secundárias mostraram-se distendidas e evidenciaram satélites nas espécies B. tuldoides e B. textilis, assim como, em D. asper e D. giganteus. As demais espécies mostraram blocos que evidenciaram as RON’ s. A coloração com AgNO3 mostrou a ocorrência de apenas um grande nucléolo ocupando grande parte do núcleo interfásico em todas as espécies.

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