Geobacillus thermodenitrificans JK1 kamieno termostabilios ksilanazės geno klonavimas, ekspresija ir fermento savybių analizė Ksilanas - pagrindinis hemiceliuliozės komponentas ir antras pagal paplitimą polisacharidas gamtoje. Šis biologinis polimeras yra chemiškai heterogeniška bei kompleksiška medžiaga, kurios efektyviam degradavimui reikalingos multifermentinės sistemos. Tokios sistemos yra plačiai paplitusios tarp įvairių prokariotinių ir eukariotinių mikroorganizmų. Pagrindinį vaidmenį ksilano degradacijoje atlieka endo-1,4-β-ksilanazės. Ksilanazės pasižyminčios termostabilumu yra plačiai taikomas popieriaus ir maisto pramonėje, pašarų gamyboje bei biokonversijoje. Darbo metu buvo atrinktas JK1 kamienas, gebantis sekretuoti ksilanolizinius fermentus į ląstelės išorę. Remiantis 16S rRNR ir spo0A genų sekų palyginimais bei filogenetine analize nustatyta, kad tiriamas kamienas buvo artimiausias G. thermodenitrificans NG80-2 kamienui, kuriame taip pat nustatytas ksilanazės genas. Pagal šią geno seką sukurti pradmenys amplifikuojantys JK1 kamieno ksilanazės geną (1224 bp). Ksilanazės genas klonuotas ir perkeltas į ekspresijos vektorių (pET-28c(+)), sukonstruojant rekombinantinę ksilanazę su His inkarine uodega (50,979 kDa), kas leido ekspresuoti baltymą E. coli ir atlikti gryninimą nikelio afininės chromatografijos metodu. Šiame darbe pirmą kartą charakterizuota G. thermodenitrificans JK1 kamieno ksilanazė. Rekombinantinio fermento optimalios veikimo sąlygos - 70 °C... [toliau žr. visą tekstą] / Cloning, expression and biochemical characterization of the thermostable xylanase from Geobacillus thermodenitrificans strain JK1 Xylan is a major structural polysaccharide in plant cells, and is the second most abundant polysaccharide in nature. Due to its heterogeneity and complexity, the complete hydrolysis of xylan requires a variety of cooperatively acting enzymes. These xylanolytic enzyme systems are quite widespread among prokariotic and eukaryotic microorganisms. Endo-1,4-β-xylanase is considered to play the most important role in xylan degradation. Thermostable xylanases have potential applications in a wide range of industrial processes, including pulp and paper industry, food and animal feeds industry and bioconvertion. In this study a thermophilic JK1 strain producing xylanolytic enzymes was isolated from compost sample. The 16S rRNR and spo0A genes sequence analysis indicated that JK1 strain had the highest similarity with G. thermodenitrificans NG80-2 strain. Based on the xylanase gene sequence from G. thermodenitrificans NG80-2 strain, degenerated primers were designed for amplification of xylanase-coding gene (1224 bp) from JK1 strain. Subsequently, the amplified gene was cloned into expression vector (pET-28c(+)) and the recombinant xylanase with a polyhistidine-tag was designed (50,979 kDa). Biochemical properties of the purified by nickel affinity chromatography recombinant xylanase from G. thermodenitrificans JK1 strain were further characterized. The... [to full text]

Darbo tikslas: Ištirti Trakėnų veislės kumelių reprodukcines savybes Vilniaus žirgyne. Darbo uždaviniai: 1. Ištirti Trakėnų veislės kumelių reprodukcijos rodiklius - vislumą, abortavimų skaičių, embrioninį laikotarpį Vilniaus žirgyne. 2. Ištirti įvairių veiksnių įtaką kumelių reprodukcinėms savybėms. Buvo taikyti tyrimų metodai: 1) zootechninis- dokumentinis, 2) analitinis, 3) statistinis. Tyrimui buvo pasirinktas UAB „Lietuvos žirgynas“ . Tirtos Vilniaus žirgyno padalinyje auginamos ir veisiamos kumelės, jų reprodukcinės savybės. Imti duomenys skirtingų metų nuo 2005 iki 2013. Buvo nustatyta: 1) veislinių kumelių kitimo dinamika, 2) kergtų ir sėklintų kumelių skaičius kitimo dinamika, 3) abortavimų skaičius ir priežastys, 4) kumeliukų išeiga. Tiriamuoju laikotarpiu per 7 metus 2,2 kartais sumažėjo gautų kumeliukų išeiga nuo kergtų/sėklintų kumelių skaičiaus. Nustatytos labai nepalankios mažėjimo tendencijos (y = -6,3358x + 77,782; R2 = 0,5856), rodančios reprodukcijos vadybos problemas. Trakėnų veislės kumelių embrioninis laikotarpis svyravo nuo 324 iki 358 dienų, jo vidurkis buvo 339,33 ±2,99 dienos. Iš tyrimo metu iškeltų hipotezių nustatėme, kad embrioniniam laikotarpiui statistiškai reikšmingos įtakos turėjo kumelės amžius (p=0,039) ir kergimo /sėklinimo mėnuo (p=0,0001). Analizė parodė, kad Trakėnų veislės kumelių apsivaisinimui statistiškai patikimai įtakos turėjo jų kergimo /sėklinimo mėnuo (p= 0,031). Reprodukcijos technologija – kergimas ar... [toliau žr. visą tekstą] / The purpose of Master’s thesis: To analyse Trakehner breed mares reproduction properties. Tasks of Master’s thesis: To examine the indicators of the Trakehner breed mares reproduction - fertility, a number of abortion, embryonic period in Vilnius stud. 1. To examine the impact of various factors on mares reproduction properties. Methods used to conduct a research: 1) Zootechnical - documentary analysis, 2) Analytical analysis, 3) Statistical analysis. The research relies on data from UAB ,,Lietuvos zirgynas”. It examines the reproduction properties, growing and breeding of mares, in Vilnius subdivision. The data covers the period of 2005-2013. Results: 1) The dynamics of the change of pedigree mares. 2) The dynamics of the change in the number of mated and inseminated mares. 3) A number of abortions and it’s main reasons. 4) Foals output. During the seven years of examination, a number of new-born foals from the mated/inseminated mares decreased by 2.2 times. Thus it shows unfavourable, decreasing trends of birth rates (y = -6,3358x + 77,782; R2 = 0.5856), implying the existing problems in reproduction management. Embryonic period of Trakehner breed mares varies between 324 to 358 days, its average is 339,33±2,99 days. Hypotheses raised in this research leads to a conclusion that the age of mares (p=0.039) and a month of mating/insemination (p=0.0001) have a statistically significant influence on the embryonic period. Also, the analysis shows that a month of... [to full text]

Software development is an iterative process which is based on teamwork and information exchange. In order to keep this process running, proper informational flow control techniques in a software development company have to be applied. As number of employees grows, manual control of this process becomes inaffective and automated solutions takes over this task. The most common informational units in the software development process are defects, new features and requirements. This paper addresses problems that occur during software development process and intents to create techniques and methodologies for software defect, feature and requirement management. Following tasks are performed while automating mentioned process: a) Analysis of software development company workflow; b) Design and documentation of software defect, feature and requirement management method, which would ease information exchange in design, implementation and quality assurance stages of software development process; c) Analysis and comparision of existing similar solutions. Identification of most attaractive and useful features; d) Design and implementation of software defect, feature and requirement management system which covers newly designed information flow control method. Practical task includes designing, programming, installing and testing newly created system. Design and development is based on reusable component approach which results in several layers of reusable code.