Techn. Universiẗat, Diss.--Berlin, 1998.

Zugl.: Berlin, Techn. Univ., Habil-Schr., 2007

Konstanz, Univ., Diplomarb., 1998. / Verf. von der Frontdoor.

Im Rahmen dieser Arbeit wurde mit Led-Seq eine Structure Probing-Methode etabliert, die auf der strukturabhängigen Spaltung von RNA durch Pb2+-Ionen beruht. Alleinstellungsmerkmal ist dabei, dass die Spaltprodukte selektiv ligiert werden können. Das Struktursignal wird als Ligationspositionen der eingesetzten Oligonukleotidadapter codiert. Die Analyse beider Spaltprodukte einer Spaltreaktion erlaubt es, Transkripte auf ihrer gesamten Länge zu analysieren und ermöglicht eine zuverlässigere Auswertung. Die Generierung von Sequenzierbibliotheken zur Hochdurchsatzanalyse der RNA-Struktur wurde optimiert und validiert. Es wurde gezeigt, dass die durch Bleispaltung erzeugten RNA-Strangbrüche Strukturinformationen enthalten und als Signal auslesbar sind. Das generierte Signal wurde in ein thermodynamisches Modell integriert, um eine RNA-Sekundärstrukturvorhersage zu ermöglichen. Anhand eines RNA-Referenzsets konnte gezeigt werden, dass Led-Seq die in vivo Strukturvorhersage von RNA-Molekülen verbessert. Außerdem konnte demonstriert werden, dass sich Led-Seq zur Analyse von mRNA-Strukturen eignet. Damit steht mit dieser neuen Hochdurchsatz-Methode zur RNA-Strukturbestimmung ein orthogonales Werkzeug zu etablierten Ansätzen zur Verfügung, das neue Einsichten in RNA-Strukturen ermöglicht

Tübingen, Univ., Diss., 2006.

Stuttgart, Univ., Diss., 2007.

Zugl.: Freiburg i. Br., Univ., Diss., 1986.

Thesis (Ph. D.)--Ohio State University, 1996. / Includes vita. Includes bibliographical references (leaves 174-178). Available online via OhioLINK's ETD Center.

Techn. Universiẗat, Diss., 2005--München.

München, Techn. Univ., Diss., 2009.