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Previous issue date: 2007-02-22 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The gray mold, causal organism Amphobotrys ricini, is one of the major diseases of castor bean. Difficulties in managing plant disease arises form the limited understanding of the genetic structure of A. ricini, their complexity and variability make it difficult to control. Genetic structure can be used to infer the relative impact of different forces that influence the evolution of pathogen populations, that allow to predict the potencial for pathogen populations to envolve in agricultural ecosystems. Growers protect their crop by applying fungicides, but there aren t fungicides to provide significant control of gray mold of castor bean. The objectives of this work were use RAPD to determine the genetic structure of A. ricini subpopulations in Para?ba and assay the sensitivity of A. ricini isolates to azoxystrobin and carbendazim. To determine the genetic structure of A. ricini subpopulations in Para?ba, 23 isolates were colleted from two different geographic location (subpopulation). These isolates were analysed by RAPD using 22 random decamer primers, purchased from OPERON, produced a total of 80 markers polimorphics. The resulting matrixes were analysed using PopGene version 1.32. Sensitivity to azoxystrobin and carbendazim of 30 isolates, colleted form Para?ba and Alagoas, was estimated based on spore germination and colony growth inhibition. The stock solutions were added toV8 medium after sterilization to produce final concentrations of 0, 0.01, 0.1, 1, 10, and 100 ?g/ml of carbendazim and 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1, and 10 ?g/ml of azoxystrobin. All statistical analyses were performed using SAS to estimate the dose that inhibited fungal growth by 50% (ED50 values). The genetic diversity within subpopulations (Hs=0,271) accounted for 92% of the total genetic diversity (Ht=0,293), while genetic diversity between subpopulations (Gst = 0,075) represented only 7,5%. The estimated number of migrants per generation (NM ) was 6,15. Nei s average gene identity across 80 RAPD loci was 0,9468. Individual ED50 values, for the 30 isolates screened for their sensitivity to azoxystrobin, ranged From a maximum of 0,168 ?g/ml to a minimum of 0,0036 ?g/ml. The ED50 values for carbendazim varied within the range of 0,026 to 0,316 ?g/ml / O mofo cinzento, causado pelo fungo Amphobotrys ricini, ? um dos principais problemas fitossanit?rios da cultura mamoneira. Esta doen?a causa preju?zos a cultura podendo levar ? perda total da produ??o caso medidas de controle n?o sejam implementadas a tempo. A determina??o da estrutura gen?tica de popula??es de pat?genos e o monitoramento sistem?tico das popula??es com o intuito de compreender a din?mica de seus aspectos gen?ticos ? importante para que programas de melhoramento visando a resist?ncia dur?vel tenham ?xito. O controle qu?mico do pat?geno tamb?m ? necess?rio, entretanto, n?o existem fungicidas registrados para o controle da doen?a. O objetivo deste trabalho foi determinar a variabilidade gen?tica entre e dentro de subpopula??es de A. ricini no estado da Para?ba, empregando marcadores moleculares do tipo RAPD e analisar a sensibilidade de isolados de A. ricini aos fungicidas carbendazim e azoxistrobina. Para a determina??o da estrutura gen?tica foram analisados 23 isolados de duas subpopula??es (SPs), sendo a SP1 formada por isolados coletados nos munic?pios de Campina Grande, Lagoa Seca e Esperan?a e a SP2 com isolados oriundos dos munic?pios de Areia, Rem?gio, Sol?nea e Alagoa Nova. Amostras de DNA purificadas dos isolados foram submetidas a rea??es RAPD com 22 oligonucleot?deos da s?rie OPERON, gerando 80 fragmentos polim?rficos que foram analisados pelo programa PopGene. Para verificar a sensibilidade a fungicidas, 30 isolados de duas popula??es, sendo uma da Para?ba e outra de Alagoas foram testados contra o Carbendazim avaliando-se o crescimento micelial em meio V8 acrescido do fungicida nas dosagens 0, 0.01, 0.1, 1, 10 e 100 ?g/ml; e azoxistrobina avaliando-se a germina??o de esporos. Os dados foram analisados pelo procedimento PROBIT do pacote estat?stico SAS que calculou a dosagem necess?ria para inibir 50% do crescimento micelial (DL50). A diversidade gen?tica total (Ht=0,293) ? devida ? diversidade gen?tica dentro das SPs (Hs=0,271). O n?mero de migrantes foi estimado em 6,15 indiv?duos a cada gera??o entre as subpopula??es. A fra??o da varia??o gen?tica distribu?da entre as subpopula??es Gst foi 0,075. Houve baixa diferencia??o entre as subpopula??es com base na m?dia de identidade gen?tica (Nei, 1973) entre as subpopula??es em todos os locos analisados (0,9468). Os valores de DL50 variaram entre 0,026 e 0,316 ?g/ml para carbendazim e 0,0036 e 0,168 ?g/ml para azoxistrobina. Neste estudo, h? evid?ncias de que a estrutura gen?tica da popula??o de A. ricini no estado da Para?ba seja clonal e que h? intensa migra??o e que os isolados da Para?ba e Alagoas s?o sens?veis a carbendazim e azoxistrobina
Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/16773 |
Date | 22 February 2007 |
Creators | Bezerra, Cintia de Sousa |
Contributors | CPF:02621094767, http://lattes.cnpq.br/3036544314910366, Suassuna, Nelson Dias, CPF:80073042404, http://lattes.cnpq.br/4344026717541727, Molina, Wagner Franco, CPF:56615043491, http://lattes.cnpq.br/8437464961129518, Vidal, M?rcia Soares |
Publisher | Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de P?s-Gradua??o em Gen?tica e Biologia Molecular, UFRN, BR, Gen?tica e Biologia Molecular |
Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
Language | Portuguese |
Detected Language | Unknown |
Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Format | application/pdf |
Source | reponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN |
Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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