Els calicivirus humans (HuCV) són una causa important de brots de gastroenteritis (GEA) en adults, el paper però d'aquests virus com a causa de casos esporàdics de GEA en nens és desconegutObjectius1. Estudiar la prevalença i les característiques clíniques del les infeccions per HuCV en nens hospitalitzats als USA2. Determinar la diversitat genètica dels HuCV causants d'aquesta patologia3. Determinar el cost mèdic derivat d'aquestes infeccionsMetodesEs va realitzar un estudi prospectiu a tres hospitals pediàtrics dels USA, a Cincinnati, OH; Oakland, CA; i Norfolk, VA. Nens de 14 dies fins a 5 anys d'edat ingressats per un quadre de diarrea, vòmits o febre sense causa de menys de 7 dies d'evolució van ser inclosos. Es van recollir dades clíniques i demogràfiques, així com una mostra de femta. La femta es va analitzar per la presencia de rotavirus (RV) per EIA i per HuCV per RT-PCR utilitzant els cebadors 289/290 i 289hi/290hijk, dirigits a la regió de la polimerasa i que són capaços de detectar NLV i SLV. Totes les mostres positives per RT-PCR van ser confirmades per sequenciació utilitzant SequiTherm EXCEL II long-Read DNA Sequencing kit-ALF en un seqüenciador automàtic. Els arbres filogenètics es van obternir utilitzant l'algoritme de Maximum likelihood. Es va calcular el cost del periode pre, hospitalització i posthospitalització a partir del nombre de visites a serveis mèdics, les medicacions prescrites, les exploracions complementàries solicitades i el cost de la hospitalització. ResultatsEs van obtenir 1844 mostres. Es van detectar RV en 27% de les mostres i HuCV en un 8%. Dels 155 HuCV, 25 eren SLVs i 130 NLVs. L'edat dels pacients infectats per RV era superior a la dels infectats per HuCV (mitjana 13 mesos vs 8 mesos). Els RV van mostrar un predomini estacional durant l'hivern, mentre que els HuCV van ser més freqüents a finals d'hivern-principis de primavera. Es va detectar co-infecció amb RV en 12% dels pacients infectats per HuCV. El símptoma més freqüent en les infeccions per HuCV van ser els vòmits (79% dels pacients). La febre va ser el signe més freqüent en nens de menys de 3 mesos d'edat. La gravetat dels quadres produits per SLV i NLV van ser similars. La mitjana de cost per pacient va ser de $3,574 (interval $820-$116,088).L'analisi filogenètic de les soques aïllades mostrà 3 soques pertanyent als SLV amb menys d'un 70% d'identitat amb les soques de referència i 7 NLV que no pertanyien a cap dels dos genotips, mostrant menys d'un 65% identitat a nivell nucleòtid amb les soques de referènciaConclusions Els HuCVs són una causa important de GEA en nens als USA, afectant pacients de menor edat que els RV i mostrant un patró estacional diferent.Els HuCV causant de GEA són geneticament diversos. No es van poder demostrar diferències en la presentació clínica ni en les característiques epidemiològiques de les infeccions pels diferents géneres.El cost economic i social d'aquestes infeccions és important / Human calicivirus (HuCV) are an important cause of gastroenteritis (AGE) outbreaks in adults but the role of this virus as a cause of sporadic gastroenteritis in children is not known.Objectives1. To asses the prevalence and clinical characteristics of HuCV infection among children resulting in hospitalization in the USA.2. To determine the genetic diversity of the HuCV causing this severe illness3. To determine the direct medical cost and burden cause by these infections MethodsPatients were enrolled in a longitudinal prospective maneer at three pediatric hospitals in Cincinnati, OH; Oakland, CA; and Norfolk, VA. Children 14 days to 5 years of age admitted because of diarrhea, vomiting or fever of less than 7 days duration at admission were enrolled. Clinical and demografic information were collected, as well a stool sample. Stools were tested for rotavirus (RV) by EIA and stored at -70ºC until being tested for HuCV. Samples were tested for HuCV by RT-PCR using primers 289/290 and 289hi/290hijk targeting the polimerase region and able to detect NLV and SLV. All the positives by RT-PCR were confirmed by sequencing using SequiTherm EXCEL II long-Read DNA Sequencing kit-ALF on an automated sequencer. Phylogenetic trees were obtained using Maximum likelihood algoritm. The cost of pre, hospitalization and posthospitalization period was calculated based on the cost of visits to a health care provider, tests ordered, medications prescribed and cost of hospitalization. Results1844 samples were available for testing. The detection rates for RV and HuCV were 27% and 8% respectively. Of 155 samples positive for HuCV, 25 were SLVs and 130 NLVs. Patients infected by RV were older than those infected by HuCV (median 13 months vs 8 months). RV had winter seasonality while HuCV was more frequent during late winter/early spring. Co-infection with RV occurred in 12% of the HuCV -positive patients. The most common symptom in HuCV infected patients was vomiting (79%). SLV was associated with more vomiting (86%) compared to NLV (79%). Fever was a frequent symptom, specially in children less than 3 months of age. Severity for SLV and NLV were similar. The median cost for calicivirus infected patients was $3,574 (range $820-$116,088).Phylogenetic analysis of the isolated strains showed 3 SLV samples that were less than 75% identical to the reference strains. Seven of the NLV strains did not fall in any ot the two genotypes showing less than 65% identity at nucleotide level to any of the reference strains.Conclusions HuCVs are a relevant cause of severe AGE in children in USA. Seasonality and epidemiology for RV was different than for HuCV.HuCV causing AGE in children are genetically diverse. No differences regarding clinical presentation and demographic characteristics could be proved for the different genera or clusters.HuCV infection has an important economical and social cost.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:TDX_UAB/oai:www.tdx.cat:10803/4589 |
| Date | 11 February 2003 |
| Creators | Parada Ricart, Ester |
| Contributors | Gallart Català, Alfred, Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, d'Obstetrícia i Ginecologia i de Medicina Preventiva |
| Publisher | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Source Sets | Universitat Autònoma de Barcelona |
| Language | English |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| Format | application/pdf |
| Source | TDX (Tesis Doctorals en Xarxa) |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess, ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs. |
Page generated in 0.003 seconds