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Previous issue date: 2012-04-11 / At the American continent several hantavirus cause hantavirus pulmonary syndrome, considered an emerging and important public health problem. In Brazil, since the first outbreak at the beginning of the 1990s, more than 1440 cases have been documented in 14 of the 27 states, with a mortality rate of 40 to 70%. Interestingly, despite the absence of reported cases at states of the Espírito Santo, Mato Grosso do Sul and Rio de Janeiro which bordering states with high incidence, different studies conducted had identified infected rodents reservoirs with pathogenic hantaviruses at this places, leading to a series of questions that couldn't be answered until this moment. The main objective of this study was to contribute to an understanding to the genetic diversity of hantaviruses identified in Brazil analyzing the complete sequence of genomic S segment. Initially a survey was conducted in online databases (GenBank) in order to obtain the complete nucleotide sequences of the S segment of different hantavirus, with emphasis on Brazilian sequences. From a total of 334 sequences retrieved, only 14 belonged to Brazil, all sequences recovered from human samples; 12 were genotype Araucaria (Juquitiba) and two, genotype Araraquara,. With this result, biological seroreactive animal samples, stored at Laboratório de Hantaviroses e Rickettsioses IOC FIOCRUZ, were selected and submitted to PCR. Primers were designed and developed to amplify the entire genomic S segment. The sequencing of 23 samples of wild rodents in endemic and non-endemic areas from seven Brazilian states made possible to provide (i) the first description and molecular characterization of a hantavirus in the state of the Espírito Santo, (ii) the first description of the genotype Juquitiba in the rodent species Oligoryzomys fornesi in Brazil, (iii) the complete sequence of the first S segment Jabora genotype. The phylogenetic analysis showed, in a unpublished way, the wide genetic diversity of Brazilian hantavirus. It wasn t possible to observe an association pattern between host or geography, confirming results obtained in available recent studies. / No continente americano vários hantavírus causam síndrome pulmonar por hantavírus, um emergente e importante problema de saúde pública nas Américas. No Brasil, desde o primeiro surto da doença no inicio da década de 1990, mais de 1.440 casos já foram documentados em 14 dos 27 estados brasileiros, com uma taxa de letalidade de 40 a 70%. Curiosamente, apesar da ausência de notificação de casos, nos estados como Espírito Santo, Mato Grosso do Sul e Rio de Janeiro, localizados na divisa de estados de elevada incidência, estudos desenvolvidos têm identificado roedores reservatórios infectados com hantavírus patogênicos, levando a uma série de questionamentos que, até a presente data, não pode ser respondido. O objetivo principal deste trabalho foi contribuir para o conhecimento da diversidade genética dos hantavírus identificados no Brasil a partir das sequências completas do segmento genômico S. Inicialmente um levantamento foi realizado em bases de dados on-line (GenBank®) visando à obtenção das sequências completas de nucleotídeos do segmento S dos diferentes hantavírus, com ênfase nas sequências brasileiras. De um total de 334 sequências recuperadas, somente 14 sequências foram de hantavírus brasileiros sendo 12 delas do genótipo Araucária (Juquitiba) e duas do genótipo Araraquara, todas recuperadas de amostras humanas. Diante deste resultado, amostras biológicas de animais sororreativos acondicionadas no Laboratório de Hantavíroses e Rickettsioses IOC FIOCRUZ foram selecionadas e submetidas à PCR. Para isso, iniciadores (primers) foram desenhados e desenvolvidos para amplificação de todo o segmento genômico S. O sequenciamento de 23 amostras de roedores silvestres em áreas endêmicas e não endêmicas, em sete estados brasileiros, possibilitou a (i) primeira descrição e caracterização molecular de um hantavírus no estado do Espírito Santo; (ii) a primeira descrição do genótipo Juquitiba no roedor da espécie Olygorizomys fornesi no Brasil; (iii) a primeira sequência completa do segmento S do genótipo Jaborá. Na avaliação filogenética foi observada, em caráter inédito, a ampla diversidade genética dos hantavírus brasileiros. Não foi possível visualizar um padrão de associação hospedeiro ou geográfico, corroborando com os resultados obtidos em estudos recentes disponíveis.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede-server.lncc.br:tede/164 |
| Date | 11 April 2012 |
| Creators | Silva, Alexandro Guterres da |
| Contributors | Schrago, Carlos Eduardo Guerra, Lemos, Elba Regina Sampaio, D'andrea, Paulo Sérgio, Soares, Marcelo Alves, Nicolás, Marisa Fabiana, Rossi, Maria Inês Doria |
| Publisher | Laboratório de Computação Científica, Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional, LNCC, BR, Serviço de Análise e Apoio a Formação de Recursos Humanos |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do LNCC, instname:Laboratório Nacional de Computação Científica, instacron:LNCC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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