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Previous issue date: 2007-04-04 / The main reserve components in seeds are carbohydrates, lipids and proteins. Aside from
their nutritious role, proteins have several important functions in seeds, being essential to
the molecular biology of the plant. The detailed knowledge of proteins makes it possible to
outline strategies of genetic improvement aimed at increasing production and tolerance to
different pathologies, among other traits. Progress in the molecular biology, genomics and
proteomics impelled the creation of a great volume of data on proteins of several
vegetable species, with information about their functionality in the several tissues and
organs they are part of. To use this information, it is necessary to rely on computational
tools. This need impelled the appearance and development of bioinformatics, e.g. the use
of computational tools for the study of biological data. The objective of this work was to
quantify the proteins related to the seeds described already and available in the Swiss-
Prot database, and to verify the similarity and hydrophobic pattern of the proteins with
same function in different species. A detailed consultation was performed in the Swiss-Prot
database, in search of proteins found in seeds, seedlings and their component tissues.
The sequences found were grouped and analyzed according to the tissue in which they
were expressed, epicotyl, aleurone, coleoptile, cotyledon, endosperm, hypocotyl,
mesocotyl, immature seed, seedling and seeds. Alignments were performed among the
sequences with similar function in different organs and in different species to verify
similarities across tissues and species. The hydrophobic/ hydrophilic character in the
proteins found was analyzed to identify patterns. Four hundred and fifty seed-related
proteins are in stock at the Swiss Prot database. Oryza sativa, Zea mays, Arabidopsis
thaliana, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Glycine max, which are the species that
possess the largest number of seed proteins studied so far. There isn t a similarity in the
sequences of amino acids of the proteins with same function / Dentre os principais componentes de reserva de uma semente destacam-se os
carboidratos, os lipídeos e as proteínas. Além da função nutritiva, as proteínas têm
diversas funções importantes nas sementes, sendo integrantes da biologia molecular da
planta. O conhecimento detalhado das proteínas possibilita que sejam adotadas
estratégias de melhoramento genético visando aumento de produção, resistência a
patógenos, etc... Avanços na biologia molecular, genômica e proteômica impulsionaram a
criação de um grande volume de dados sobre proteínas de diversas espécies vegetais,
com informações sobre a sua funcionalidade nos diversos tecidos e órgãos. Para utilizar
essas informações, é imprescindível a utilização de ferramentas computacionais. Essa
necessidade impulsionou o surgimento e o desenvolvimento da bioinformática, que é a
utilização de ferramentas computacionais para o estudo de dados biológicos. O objetivo
deste trabalho foi quantificar as proteínas relacionadas às sementes já descritas e
disponíveis no banco Swiss-Prot, e verificar a similaridade e padrão de hidrofobicidade
das proteínas de mesma função em espécies diferentes. Para isso, foi feita uma consulta
detalhada no banco de dados Swiss-Prot em busca de proteínas encontradas em
sementes, plântulas e seus diversos tecidos. As seqüências encontradas foram
agrupadas por tecido, sendo selecionadas e analisadas aquelas expressas no epicótilo,
camada de aleurona, coleóptilo, cotilédones, endosperma, hipocótilo, mesocótilo, semente
imatura, plântula e semente. Realizou-se alinhamentos entre as seqüências com função
similar encontradas em diferentes órgãos e em diferentes espécies para verificar a
similaridade existente entre as mesmas. Estudou-se a hidrofobicidade/hidrofilicidade nas
proteínas encontradas, buscando identificar padrões. Existem 450 proteínas relacionadas
a sementes depositadas no banco de dados Swiss-Prot.Oryza sativa, Zea mays,
Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Glycine max são espécies que
possuem um maior número de proteínas de sementes estudadas. Não há um padrão de
similaridade nas seqüências de aminoácidos das proteínas de mesma função
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:123456789/1450 |
| Date | 04 April 2007 |
| Creators | Meneghello, Geri Eduardo |
| Contributors | CPF:61465771972, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790093Y9, Barros, Antônio Carlos Souza Albuquerque, Zimmer, Paulo Dejalma |
| Publisher | Universidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia de Sementes, UFPel, BR, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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