Structural modeling and functional characterization of mammalian cytosolic carboxypeptidases 2 and 3

Description

Aquesta
tesis
s’emmarca
en
el
camp
de
les
carboxipeptidases
citosòliques
de
mamífers,
centrant-­‐se
particularment
en
els
membres
2
i
3
d’aquesta
subfamília
de
metalocarboxipeptidases.
Aquest
treball
constitueix
el
primer
estudi
sobre
la
funció
d’aquests
enzims
a
través
d’aproximacions
in
silico,
in
vitro
i
in
vivo.
Aquesta
tesis
consta
de
les
parts
descrites
a
continuació.
El
primer
capítol
introdueix
el
camp
de
les
matalocarboxipeptidases,
els
microtúbuls,
les
modificacions
post-­‐traduccionals
de
la
tubulina
i
estableix
els
objectius
de
la
tesi.
El
segon
capítol
és
una
compilació
dels
procediments
experimentals
i
materials
utilitzats
en
el
treball
experimental.
El
tercer
capítol
presenta
la
caracterització
funcional
de
la
carboxipeptidasa
citosòlica
3
humana.
Els
resultats
d’aquest
estudi
han
estat
la
base
pel
quart
capítol,
on
es
descriu
la
funció
de
la
CCP2.
Ambdues
CCP2
i
CCP3
isoformes
de
ratolí
s’estudien
mitjançant
enginyeria
de
proteïnes
i
utilitzant
els
models
de
ratolí
knockout
de
CCP2
i
CCP3.
Els
capítols
III
i
IV
es
subdivideixen
en
un
resum
del
capítol,
els
resultats
que
descriuen
el
detall
dels
descobriments
i
una
discussió.
A
continuació
es
presenta
una
discussió
general
sobre
CCP2
i
CCP3,
el
seu
rol
en
la
cèl·∙lula
i
en
el
context
de
la
subfamília
de
carboxipeptidases
que,
en
mamífers,
consta
de
sis
gens
codificants
per
enzims
amb
activitat
deglutamilasa.
La
tesis
finalitza
amb
un
resum
de
les
conclusions.
El
capítol
IV
juntament
amb
els
experiments
de
modelat
estructural
del
capítol
III
són
la
base
de
la
següent
publicació
científica:
Tort
O,
Tanco
S,
Rocha
C,
Bièche
I,
Seixas
C,
Bosc
C,
Andrieux
A,
Moutin
MJ,
Avilés
FX,
Lorenzo
J,
Janke
C.
The
cytosolic
carboxypeptidases
CCP2
and
CCP3
catalyze
posttranslational
removal
of
acidic
amino
acids.
MBoC.
doi:10.1091/mbc.E14-­‐06-­‐1072 / This
thesis
is
situated
in
the
field
of
the
mammalian
cytosolic
carboxypeptidases,
particularly
focusing
in
members
2
and
3
from
this
subfamily
of
metallocarboxypeptidases.
This
work
gives
insight
for
the
first
time
into
the
role
of
those
enzymes
by
in
silico,
in
vitro
and
in
vivo
approaches.
The
thesis
is
divided
in
parts
as
described
below.
The
first
chapter
introduces
the
fields
of
metallocarboxypeptidases,
microtubules,
tubulin
posttranslational
modifications
and
settle
the
objectives
of
the
thesis.
The
second
chapter
is
a
compilation
of
the
experimental
procedures
and
materials
used
for
the
experimental
work.
The
third
chapter
presents
the
functional
characterization
of
human
cytosolic
carboxypeptidase
3.
The
results
from
this
study
were
the
basis
for
chapter
four,
where
the
function
of
CCP2
is
described
and
both
CCP2
and
CCP3
mouse
isoforms
are
studied
by
protein
engineering
and
using
CCP2
and
CCP3
knock-­‐out
mouse
models.
Chapters
III
and
IV
are
subdivided
into
a
summary
of
the
chapter,
the
results
describing
the
findings
in
detail
and
a
discussion.
The
following
chapter
sets
a
general
discussion
on
CCP2
and
CCP3,
their
role
in
the
cell
and
in
the
context
of
a
family,
in
mammals,
of
six
genes
coding
deglutamylating
enzymes.
A
final
section
includes
a
summary
of
the
conclusions.
Chapter
IV
together
with
the
modeling
experiments
form
Chapter
III
is
the
basis
of
the
following
scientific
paper:
Tort
O,
Tanco
S,
Rocha
C,
Bièche
I,
Seixas
C,
Bosc
C,
Andrieux
A,
Moutin
MJ,
Avilés
FX,
Lorenzo
J,
Janke
C.
The
cytosolic
carboxypeptidases
CCP2
and
CCP3
catalyze
posttranslational
removal
of
acidic
amino
acids.
MBoC.
doi:10.1091/mbc.E14-­‐06-­‐1072

Links & Downloads

1. http://hdl.handle.net/10803/284126
2. urn:isbn:9788449047077

Tags

Ciències Experimentals

Additional Fields

Identifer	oai:union.ndltd.org:TDX_UAB/oai:www.tdx.cat:10803/284126
Date	15 October 2014
Creators	Tort Regàs, Olívia
Contributors	Avilés, Francesc X. (Francesc Xavier), Lorenzo Rivera, Julia, Tanco, Sebastian, Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Publisher	Universitat Autònoma de Barcelona
Source Sets	Universitat Autònoma de Barcelona
Language	English
Detected Language	English
Type	info:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Format	175 p., application/pdf
Source	TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
Rights	L'accés als continguts d'aquesta tesi queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/, info:eu-repo/semantics/openAccess