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Aplicação de MALDI-TOF MS na caracterização de microalgas da família Selenastraceae (Chlorophyta)

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Previous issue date: 2016-06-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The morphological variability in the Selenastraceae family has been a barrier to a good
establishment of well-defined taxonomic groups. Several studies with molecular
compounds have already demonstrated its importance in the elucidation of this relation.
In this scenario, the present study used a matrix-assisted laser desorption ionization timeof-
flight mass-spectrometry (MALDI-TOF MS) technique as a tool to differentiation of
the microalgae of this family at the species and strains levels. A group of 18 strains,
belong to in 12 different species, of freshwater microalgae was selected. Cells and
dissolved organic matter (DOM) were analyzed in the middle exponential growth phase.
The analyzes were performed in two different mass ranges: 400 to 2,000 Da and 2,000 to
20,000 Da. Each strain that yielded unique spectra with a good resolution of peaks and
reproducibility was selected for clusters analyzes. These spectra were used to make a
dissimilarity analysis that showed the capability of differentiation of the strains and
species. The strains of the genera Monoraphidium were not all grouped, possibly because
it is a polyphyletic group. The praticity and quickness of this technique for data
acquisition, allied with the low cost of the analysis, are factors that favor its application
in taxonomic studies. / A baixa variedade morfológica presente na família Selenastraceae tem sido uma barreira
para o estabelecimento de grupos taxonômicos bem definidos. Estudos realizados com
diversos marcadores moleculares já demonstraram a importância dos compostos
produzidos por esses organismos na elucidação dessas relações. Nesse cenário, o presente
estudo buscou avaliar a aplicação da espectrometria de massa por MALDI-TOF como
ferramenta para a discriminação de cepas e espécies dessa família. Foram selecionadas
18 cepas, classificadas em 12 espécies diferentes, de microalgas de água doce. As células
e a matéria orgânica dissolvida (MOD) analisadas foram amostradas de cultivos no meio
da fase exponencial de crescimento. As análises foram feitas em duas extensões de massa:
massas baixas (400 – 2000 Da) e massas altas (2 – 20 kDa). Para cada tipo de análise
foram selecionadas as cepas que renderam espectros com boa resolução de picos. Esses
espectros foram então utilizados em análises de dissimilaridade para a elaboração de
dendrogramas, evidenciando a capacidade da técnica para a distinção de cepas e espécies.
Apesar das cepas do gênero Monoraphidium não ficarem todas agrupadas, o que
possivelmente ocorre devido ao fato do grupo ser polifilético. A grande rapidez e
praticidade desta técnica para a obtenção de dados, aliado ao baixo custo das análises, são
fatores que favorecem a sua aplicação neste tipo de estudo.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/8748
Date29 June 2016
CreatorsMello, Rodrigo Ventura de
ContributorsVieira, Armando Augusto Henriques
PublisherUniversidade Federal de São Carlos, Câmpus São Carlos, Programa de Pós-graduação em Ecologia e Recursos Naturais, UFSCar
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFSCAR, instname:Universidade Federal de São Carlos, instacron:UFSCAR
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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