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Previous issue date: 2008-04-28 / Group A rotaviruses are the major cause of gastroenteritis in children throughout the world. Epidemiological surveys and molecular analysis of rotavirus strains are required for gastroenteritis control and prevention. Studies using VP6, an important immunogenic structural protein, and NSP4, a transmembrane nonstructural glycoprotein which is critical to rotavirus morphogenesis and pathogenesis, have been performed. In this study, 330 rotavirus-positive fecal samples previously obtained from children with or without diarrhea, between 1987 and 2003, in three cities of Central West Region of Brazil (Goiânia, Brasília and Campo Grande), were characterized for VP6- and NSP4-encoding genes. The VP6 and NSP4 genes were amplified by reverse transcription- polymerase chain reaction followed by sequencing and phylogenetic analysis. Detection rates of 84.8% and 78.5% were observed for VP6 and NSP4 genes, respectively. Two distinct genotypes could be recognized for NSP4 (A and B). It was observed that the G9P[6] samples were associated with genotype A, whereas the G1P[6], G1P[8], G2P[8], G3P[8], G4P[8] and G9P[8] samples were associated with genotype B. The analysis of VP6 gene allowed genogrouping of samples in two clusters, genogroups I and II. The G2P[4], G3P[4] and G9P[6] samples were identified as genogroup I, whereas the G1P[6], G1P[8], G2P[8], G4P[6], G4P[8] and G9P[8] samples were identified as genogroup II. In addition, it was showed that samples identified as VP6 genogroup I were associated with NSP4 genotype A and samples identified as VP6 genogroup II were associated with NSP4 genotype B. This investigation described different genetic groups representing diversity of group A rotavirus samples circulating in the Central West Region of Brazil. / Os rotavírus do grupo A são considerados como os principais agentes de gastroenterite em crianças em todo o mundo. Investigações de vigilância epidemiológica e molecular são importantes para o controle e prevenção da doença. Nesse sentido, destacam-se os estudos utilizando VP6, proteína estrutural que se tem mostrado como a mais imunogênica, e NSP4, uma glicoproteína não estrutural transmembrana envolvida na morfogênese e patogênese viral. No presente estudo, 330 amostras de rotavírus coletadas de 1987 a 2003, provenientes de espécimes fecais de crianças com ou sem diarréia, em três cidades da Região Centro-Oeste do Brasil (Goiânia, Brasília e Campo Grande), foram caracterizadas em relação aos genes que codificam as proteínas VP6 e NSP4. Inicialmente, foi feita a amplificação dos genes de VP6 e NSP4 pela reação em cadeia pela polimerase pós-transcrição reversa, seguida do seqüenciamento genômico e de análise filogenética. Os genes de VP6 e NSP4 foram detectados em 84,8% e 78,5% das amostras, respectivamente. Dois genótipos de NSP4 foram identificados (A e B). Foi observado que as amostras G9P[6] associaram-se ao genótipo A e as amostras G1P[6], G1P[8], G2P[8], G3P[8], G4P[8] e G9P[8] associaram-se ao genótipo B. A análise do gene VP6 permitiu a identificação de dois genogrupos distintos (I e II). As amostras G2P[4], G3P[4] e G9P[6] foram caracterizadas como genogrupo I, enquanto as amostras G1P[6], G1P[8], G2P[8], G4P[6], G4P[8] e G9P[8] foram caracterizadas como genogrupo II. Ainda foi evidenciado que as amostras genogrupo I de VP6 estavam associadas com genótipo A de NSP4, e as amostras genogrupo II de VP6 estavam associadas com genótipo B de NSP4. A presente investigação identificou diferentes variantes genéticas, mostrando a diversidade dos rotavírus do grupo A circulantes na Região Centro-Oeste do Brasil.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tde/1579 |
| Date | 28 April 2008 |
| Creators | TAVARES, Talissa de Moraes |
| Contributors | CARDOSO, Divina das Dôres de Paula, BRITO, Wilia Marta Elsner Diederichsen de |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Doutorado em Medicina Tropical, UFG, BR, Ciências da Saúde |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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