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Detecção, quantificação e caracterização molecular de vírus gastroentéricos na Lagoa Rodrigo de Freitas, 2007-2008

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Previous issue date: 2010 / Dra. Ana Maria Coimbra Gaspar / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / O aumento das atividades recreacionais na água tem contribuído para a transmissão
de doenças de veiculação hídrica. Os parâmetros de balneabilidade avaliados para
exposição humana em águas naturais incluem indicadores bacteriológicos.
Entretanto, a presença de vírus nestas águas não é considerada. Neste contexto, os
vírus excretados nas fezes de pessoas infectadas são importantes contaminantes de
águas superficiais em função do contínuo despejo de esgoto doméstico. Este estudo
tem como objetivo avaliar a contaminação pelos principais agentes etiológicos da
gastroenterite viral aguda, rotavírus grupo A (RV-A) e norovírus (NV), em águas
superficiais da Lagoa Rodrigo de Freitas pela detecção, quantificação e
caracterização molecular destes agentes, correlacionando-os com parâmetros
microbiológicos e físico-químicos de qualidade da água. A Lagoa é um ponto
turístico e de lazer de grande expressão na cidade do Rio de Janeiro, tem sua água
classificada como água de recreação de contato primário e, atualmente, está
passando por um programa de despoluição para reverter o seu estado de
degradação ambiental. Entre Agosto de 2007 e Julho de 2008, 2L de água
superficial foram coletados mensalmente em 12 pontos, incluindo 10 pontos na
Lagoa Rodrigo de Freitas, um no Rio dos Macacos, que desemboca na Lagoa, e um
na praia do Leblon, onde a água da Lagoa é escoada, totalizando 144 amostras. As
amostras foram concentradas 1000X pelo método de adsorção-eluição utilizando
uma membrana carregada negativamente e reconcentradas a uma volume final de
2mL em Centriprep®YM-50. RV-A e NV foram detectados e quantificados pelas
técnicas de reação em cadeia pela polimerase convencional e quantitativa (cPCR /
qPCR) precedidas por transcrição reversa (RT). Pela análise conjunta destas
metodologias, RV-A e NV-GII foram detectados em 24,3% (35/144) e 18,8%
(27/144) das amostras estudadas, respectivamente. A quantificação de RV-A e NV-
GII variou de 3,34 a 4680 cg/100mL e 1,57 a 26,5 cg/100mL, respectivamente. As
amostras positivas de RV-A foram caracterizadas pelo sequenciamento parcial do
segmento 6 (VP6) como subgrupo I e genótipo I2 segundo a nova classificação
proposta para estes vírus. E.coli foi quantificada por Kit Colilert-18Kit Quanti-Tray®/
2000 em cada ponto de coleta como um indicador bacteriológico de contaminação
fecal e 87,5% (126/144) das amostras de água foram caracterizadas como próprias
conforme estabelecido pela legislação vigente. RV-A e/ou NV-GII foram detectados
em 38,1% (48/126) dessas amostras, evidenciando a presença de vírus em águas
que estão dentro dos padrões aceitáveis para E.coli, não sendo observada a
associação entre este parâmetro e a detecção destes vírus. Adenovirus humano
(HuAdV) foram pesquisados como possíveis marcadores virais de contaminação
fecal humana, sendo detectados em 16,7% (24/144) das amostras, apresentando
distribuição não homogênea em relação aos resultados de E.coli, RV-A e NV-GII.
Parâmetros físico-químicos como salinidade, temperatura, pH, cloro e turbidez foram
determinados, sendo demonstrada uma distribuição não homogênea entre RV-A e
turbidez e NV-GII e pH. Os dados obtidos neste estudo enfatizam a necessidade do
estabelecimento de parâmetros virais para a avaliação da qualidade da água e a
necessidade de se disponibilizar protocolos de detecção viral que auxiliem para a
adoção de medidas de controle de contaminação ambiental pelas autoridades
Municipal e Estadual. / The increase of recreational activities in water has contributed to the transmission of
waterborne diseases. The bathing parameters evaluated for human exposure in
natural waters include bacteriological criteria. However the presence of virus is not
considered. In this context, viruses excreted in feces of infected people are important
contaminants of surface water due to the continuous discharge of domestic
sewage.This study aims to evaluate the contamination by the main etiologic agents
of viral acute gastroenteritis, group A rotavirus (RV-A) and norovirus (NV), in surface
waters of the Rodrigo de Freitas Lagoon by detection, quantification and molecular
characterization of these agents, correlating with the microbiological and physico-
chemical standards for water quality. From August 2007 to July 2008, 2L of surface
water were monthly collected at 12 sites, including 10 sites in the Rodrigo de Freitas
Lagoon, one in the Macacos River, which flows into Lagoon, and one at Leblon
Beach, where water Lagoon is drained, totalizing 144 samples. The samples were
concentrated 1000X by an adsorption-elution method using a negatively charged
membrane and reconcentrated to a final volume of 2mL in Centriprep ®YM-50
concentrator. RV-A and NV were detected and quantified by conventional and
quantitative polymerase chain reaction (cPCR/qPCR) preceded by reverse
transcription (RT). For the joint analysis of these methodologies RV-A and NV-GII
were detected in 24,3% (35/144) and 18,8% (27/144) of the studied samples,
respectively. Quantification of RV-A and NV-GII ranged from 3,34 to 4680 cg/100mL
and 1,57 to 26,5 cg/100mL, respectively. The RV-A positive samples were
characterized by partial sequencing of segment 6 (VP6) as subgroup I and I2
genotype according to the new classification proposed. E.coli was quantified using
Colilert®-18Kit Quanti-Tray®/2000 in each collection site as bacterial standard of fecal
contamination and 87.5% (126/144) of water samples analyzed were characterized
as suitable for bath as established by legislation. RV-A and/or NV-GII were detected
in 38,1% (48/126) of these samples, showing the presence of viruses in waters that
are within the standards for acceptable E.coli and there was no association between
this parameter and viral detection. Human adenoviruses (HuAdV) were investigated
as possible viral markers of human fecal contamination and were detected in 16,7%
(21/144) of the samples showing non-homogeneous distribution in relation to the
results of E. coli, RV-A and NV-GII. Physico-chemical parameters, like salinity,
temperature, pH, chlorine and turbidity, were determined in loco. It was demonstrated
a non-homogeneous distribution of positive and negative samples between RV-A and
turbidity and NV-GII and pH. Data obtained in this study emphasize the need for the
establishment of viral parameters for the assessment of water quality and the need to
provide viral detection protocols that lead to the adoption of measures to control
environmental contamination by municipal and state authorities

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/5716
Date January 2010
CreatorsVieira, Carmen Baur
ContributorsNiel, Christian Maurice Gabriel, Sato, Maria Inês Zanoli, Vitral, Cláudia Lamarca, Miagostovich, Marize Pereira
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ
RightsCarmen Baur Vieira, info:eu-repo/semantics/openAccess

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