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Previous issue date: 2016-07-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The overexploitation of natural resources have threatened tropical forests at an
alarming rate, and integrative studies are necessary for planning effective conservation
actions. In this thesis we used snakes as a model-group in studies on community ecology and
landscape genomics in three chapters with different goals, but all converging in scientific
basis for biodiversity conservation. In the Chapter I we present a cost-benefit evaluation of
sampling snakes for environmental impact assessments in the Amazon. We show that the high
cost of sampling snakes ($ 120 per individual) associated with the low detection probabilities
makes this group inappropriate for short-term studies. Alternatively we suggest that
environmental impact assessments are focused on taxonomic groups that simultaneously
reflect robust diversity measures and are relatively easy to obtain samples. The remaining
chapters of this thesis result from sampling surveys along nine years of monitoring snakes in
standardized sampling units. In the Chapter II we tested the effects of ecological gradients of
tree density, altitude and soil clay content on measures of taxonomic, functional and
phylogenetic β-diversity. We show that the three gradients tested act as filters on the
taxonomic diversity, which creates regional patterns of co-occurring species. However,
differences in functional traits and phylogenies among sampling units are randomly
distributed throughout the landscape, regardless of variation in the gradients tested. In the
Chapter III we used thousands of genetic loci (SNPs) to compare patterns of gene flow
between two ambush predator snakes and two active foragers. We show that the lower
dispersal capability in ambush predators generates genetic differentiation among individuals
and reduces the gene flow through isolation by geographic distance and environmental
resistance. The active foragers, in turn, have high levels of gene flow over about 880 km of an
heterogeneous landscape, and no evidence of genetic structure was found, regardless of the
geographic distance and environmental resistance. We expect that the chapters of this thesis
are part of integrative studies on biodiversity in the Amazon, which have been conducted
through standardized sampling of different groups of animals and plants. / A superexploração de recursos naturais tem ameaçado as florestas tropicais em ritmo
alarmante, e estudos integrativos se fazem necessários para o delineamento de ações efetivas
de conservação. Nessa tese nós usamos serpentes como um grupo-modelo para estudos em
ecologia de comunidades e genômica de paisagens, em três capítulos com objetivos
diferentes, mas todos convergindo em embasamento científico para conservação da
biodiversidade. No capítulo I nós apresentamos uma avaliação de custo-benefício de
amostragem de serpentes para avaliações de impacto ambiental na Amazônia. Nós mostramos
que baixas probabilidades de detecção associadas ao alto custo de amostragem de serpentes
(U$ 120 por indivíduo) tornam esse grupo pouco adequado para estudos em curto prazo.
Alternativamente nós sugerimos que avaliações de impacto ambiental sejam focadas em
grupos taxonômicos que simultaneamente reflitam medidas de diversidade robustas, e sejam
relativamente fáceis para se obter dados. Os demais capítulos dessa tese resultam de
campanhas de monitoramento de serpentes em unidades amostrais padronizadas, distribuídas
ao longo de nove anos. No capítulo II nós testamos os efeitos de gradientes ecológicos de
densidade de árvores, altitude e porcentagem de argila no solo sobre medidas de β-
diversidade taxonômica, funcional e filogenética. Nós mostramos que os três gradientes
testados funcionam como filtros à diversidade taxonômica, o que gera padrões regionais de
co-ocorrência de espécies. No entanto, diferenças em traços funcionais e filogenias entre
unidades amostrais são aleatoriamente distribuídas ao longo da paisagem, independentemente
da variação nos gradientes testados. No capítulo III nós usamos milhares de marcadores
genéticos (SNPs) para comparar padrões de fluxo gênico entre duas serpentes predadoras
senta-e-espera e duas forrageadoras ativas. Nós mostramos que a capacidade de dispersão
mais baixa em predadores senta-e-espera gera diferenciação genética entre indivíduos e
redução no fluxo gênico por meio de isolamento por distância geográfica e resistência
ambiental. Os forrageadores ativos, por sua vez, têm altos níveis de fluxo gênico ao longo de
cerca de 880 km de uma paisagem heterogênea, e nenhuma evidência de estruturação genética
foi encontrada, independentemente de distância geográfica e resistência ambiental. Nós
esperamos que os capítulos dessa tese sejam parte de estudos integrativos de biodiversidade,
os quais vêm sendo conduzidos na Amazônia por meio de amostragem padronizada de
diferentes grupos de animais e plantas.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/2241 |
| Date | 10 July 2016 |
| Creators | Fraga, Rafael de |
| Contributors | Lima, Albertina P. |
| Publisher | Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Biologia (Ecologia), INPA, Brasil, Coordenação de Pós Graduação (COPG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA, instname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, instacron:INPA |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 5004743602847313034, 600, 600, 600, 3806999977129213183, 2075167498588264571 |
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