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Identifica??o de genes MUTM em BACs da cana-de-a?ucar e caracteriza??o preliminar destes genes e seus promotores

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Previous issue date: 2013-02-22 / Sugarcane has an importance in Brazil due to sugar and biofuel production. Considering this aspect, there is basic research being done in order to understand its physiology to improve production. The aim of this research is the Base Excision Repair pathway, in special the enzyme MUTM DNA-glycosylase (formamidopyrimidine) which recognizes oxidized guanine in DNA. The sugarcane scMUTM genes were analyzed using four BACs (Bacterial Artificial Chromosome) from a sugarcane genomic library from R570 cultivar. The resulted showed the presence in the region that had homology to scMUTM the presence of transposable elements. Comparing the similarity, it was observed a highest similarity to Sorghum bicolor sequence, both nucleotide and peptide sequences. Furthermore, promoter regions from MUTM genes in some grass showed different cis-regulatory elements, among which, most were related to oxidative stress, suggesting a gene regulation by oxidative stress / A cana-de-a??car ? uma das principais culturas brasileiras e importante, principalmente, pela produ??o de a??car e biocombust?vel. Por isso, manter a qualidade das cultivares desta esp?cie tornou-se alvo das pesquisas envolvendo gen?tica e bioqu?mica moleculares. Um dos objetivos destas pesquisas ? descobrir informa??es ?teis sobre o material gen?tico que as cultivares da cana-de-a??car possuem, para utiliz?-las como ferramentas no melhoramento contra intemp?ries que afetam sua produ??o, muitas vezes, de forma dr?stica. O foco deste trabalho ? a via de reparo de DNA conhecida por Reparo por Excis?o de Base, mais precisamente, a enzima DNA-glicosilase MUTM (formamidopirimidina-DNA-glicosilase), a qual reconhece e repara guaninas oxidadas no DNA. A caracteriza??o dos genes MUTM da cana-de-a??car foi realizada a partir das an?lises de quatro BACs (Bacterial Artificial Chromosome) de uma biblioteca gen?mica da cultivar R570. Os resultados obtidos dos alinhamentos mostraram a presen?a marcante de elementos de transposi??o. Al?m disso, foi verificado que os genes MUTM foram altamente similares aos de Sorghum bicolor, tanto em sequ?ncias nucleot?dicas e pept?dicas, como na estrutura g?nica. Foi analisado tamb?m que as regi?es promotoras de genes MUTM em algumas gram?neas apresentam v?rios elementos reguladores de express?o, associados com o estresse oxidativo, indicando uma regula??o por estresse oxidativo

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/12626
Date22 February 2013
CreatorsTrindade, Adilson Silva da
ContributorsCPF:13451112825, http://lattes.cnpq.br/4808910380593455, Duarte, F?bio Teixeira, CPF:03063680486, http://lattes.cnpq.br/4371235140013662, Nicolini, Fernanda, CPF:88777413091, http://lattes.cnpq.br/9550506106032691, Rocha, Hugo Alexandre de Oliveira, CPF:76111830449, http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799567J8&dataRevisao=null, Scortecci, K?tia Castanho
PublisherUniversidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de P?s-Gradua??o em Bioqu?mica, UFRN, BR, Bioqu?mica; Biologia Molecular
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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